Explorando transcriptomas dos carrapatos Amblyomma cajennense e Rhipicephalus sanguineus para a descoberta de genes e de antígenos
| Ano de defesa: | 2007 |
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| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-03032026-163503/ |
Resumo: | Os carrapatos são artrópodes hematófagos, vetores de doença. Vacinas são uma alternativa para seu controle, já que os parasitas durante a infestação estimulam as respostas imunes do hospedeiro, as quais são implicadas em sua rejeição. As glândulas salivares do parasita são importantes para adquirir refeições de sangue e para mediar os mecanismos de escape às defesas do hospedeiro. A fim de elucidar a biologia da interface parasito-hospedeiro e descobrir antígenos protetores para uma vacina multicomponente, foram analisados os transcriptomas das glândulas salivares do carrapato do cavalo, Amblyomma cajennense, e do carrapato do cão, Rhipicephalus sanguineus. Bibliotecas de cDNA foram construídas a partir de glândulas salivares de ambos os carrapatos. Os clones selecionados aleatoriamente foram seqüenciados gerando um total de 1803 ESTs que foram analisados por programas do bioinformática. As ESTs foram automaticamente depuradas de seqüências de iniciadores e do vetor, agrupadas e comparadas com banco de dados usando programas escritos em Visual Basic 6.0 (Microsoft). Peptídeos sinais, indicativos de função secretória, foram detectados com Signal P 3.0 Server. As buscas por homologia foram feitas nos bancos de dados NR - proteína (NCBI), GO, KOG, P-fam, SMART, rRNA (NCBI) e MIT-PLA (NCBI) e outros bancos de dados particulares como ACARI (referentes a ácaros) e BMNT (referentes a ESTs públicos de R. microplus). As seqüências foram agrupadas em um total de 873 contigs. Aproximadamente 90% das seqüências de ESTs mostraram similaridade significante com proteínas cujas seqüências estão depositadas no banco de dados NR e os 10% restantes não apresentaram similaridade com nenhum acesso dessa base de dados. Entre as seqüências que apresentaram similaridades, incluem-se as similares a proteínas \"housekeeping\" (vitais), proteínas de cimento, diversos inibidores de proteases incluindo anticoagulantes, as metaloproteases, peptídeos antimicrobianos, as proteínas antiinflamatórias e uma potente proteína imunossupressora. Essas proteínas podem ter papel importante durante a alimentação do carrapato e podem ser novos candidatos a uma vacina anti-carrrapatos. |
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Bibliotecas de cDNA foram construídas a partir de glândulas salivares de ambos os carrapatos. Os clones selecionados aleatoriamente foram seqüenciados gerando um total de 1803 ESTs que foram analisados por programas do bioinformática. As ESTs foram automaticamente depuradas de seqüências de iniciadores e do vetor, agrupadas e comparadas com banco de dados usando programas escritos em Visual Basic 6.0 (Microsoft). Peptídeos sinais, indicativos de função secretória, foram detectados com Signal P 3.0 Server. As buscas por homologia foram feitas nos bancos de dados NR - proteína (NCBI), GO, KOG, P-fam, SMART, rRNA (NCBI) e MIT-PLA (NCBI) e outros bancos de dados particulares como ACARI (referentes a ácaros) e BMNT (referentes a ESTs públicos de R. microplus). As seqüências foram agrupadas em um total de 873 contigs. Aproximadamente 90% das seqüências de ESTs mostraram similaridade significante com proteínas cujas seqüências estão depositadas no banco de dados NR e os 10% restantes não apresentaram similaridade com nenhum acesso dessa base de dados. Entre as seqüências que apresentaram similaridades, incluem-se as similares a proteínas \"housekeeping\" (vitais), proteínas de cimento, diversos inibidores de proteases incluindo anticoagulantes, as metaloproteases, peptídeos antimicrobianos, as proteínas antiinflamatórias e uma potente proteína imunossupressora. Essas proteínas podem ter papel importante durante a alimentação do carrapato e podem ser novos candidatos a uma vacina anti-carrrapatos.Ticks are hematophagous arthropod vectors of disease. Vaccines are an alternative for their control, the premise being that infestations with these parasites stimulate host immune responses, which are implicated in their rejection. The tick\'s salivary glands are important for acquiring blood meals and for countering the host\'s defenses. ln order to elucidate the biology of the tick-host interface and discover protective antigens for a multicomponent vaccine, transcriptomes of salivary glands of the horse tick, Amblyomma cajennense, and dog tick, Rhipicephalus sanguineus, are being analyzed. A cDNA library was constructed from salivary glands of both ticks. Randomly selected clones were sequenced and a total of 1803 ESTs were analyzed by bioinformatics programs. ESTs were automatically trimmed of primer and vector sequences, clusterized and compared with databases using programs written in Visual Basic 6.0 (Microsoft). Signal peptides indicative of secretion were detected with the Signal P 3.0 Server. BLAST searches were done with dababases such as NR - protein (NCBI), GO, KOG, P-fam, SMART, rRNA (NCBI) and MIT-PLA (NCBI) and custom databases ACARI (related to acari) and BMNT (related to public EST sequences for R. microplus). The sequences were grouped into 873 contigs. About 90% of the RNAm sequences showed significant similarity to known proteins to database NR and appeared to be coding for functional predicted proteins, whereas the remaining 10% had no similar sequences. Among the functional predicted protein sequences, other than the housekeeping proteins, cement proteins, several protease inhibitors including anticoagulants, metalloproteases, antimicrobial peptides, anti-inflammatory and a potential immunosuppressive protein could be identified. These proteins may play important roles during tick feeding and could be novel anti-tick vaccine candidates.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSantos, Isabel Kinney Ferreira de MirandaAnatriello, Elen2007-07-30info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-03032026-163503/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-03-03T19:45:02Zoai:teses.usp.br:tde-03032026-163503Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-03-03T19:45:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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