Expressão heteróloga e caracterização de uma beta-glucanase identificada na saliva do inseto Pseudolicoriella hygida

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Lopes, Vítor Kunes
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59138/tde-02122024-165918/
Resumo: A biorrefinaria é uma das vertentes da economia circular de base biológica, a qual visa a transformação de biomassa em produtos químicos de interesse industrial e em energia limpa. A utilização de enzimas ativas contra carboidratos (Carbohydrate Active Enzymes - CAZymes) na degradação de biomassa está ganhando destaque devido aos seus diversos benefícios e vantagens, e a busca de enzimas de várias fontes é uma área de pesquisa dinâmica e em expansão. Apesar de insetos apresentarem ampla distribuição geográfica, um grande número de espécies distribuídas em pelo menos 30 ordens e hábitos alimentares diversificados, as CAZymes de insetos são pouco exploradas. Um recente estudo -ômico do inseto Pseudolicoriella hygida identificou um conjunto de β-glucanases no genoma e no transcriptoma que estão presentes no proteoma da saliva das larvas. A presença destas enzimas na saliva de larvas foi posteriormente confirmada através de ensaios de atividade enzimática. Nesse contexto, os objetivos desse trabalho foram a expressão, purificação e caracterização bioquímica das CAZymes encontradas no genoma de Psl. hygida. Os cDNAs que codificam cinco enzimas foram extraídas e amplificadas com sucesso. As enzimas Bhyg_04913/pET-28a, Bhyg_13095/pET-28a e Bhyg_05920/pET-22b foram expressas com sucesso em sistema procariótico se utilizando de baixas temperaturas. A enzima Bhyg_05920/pET-22b, que possui um peso molecular aproximado de 42 kDa, foi purificada e caracterizada. Essa enzima se mostrou mais ativa em pH 8.0 e tampão Tris-HCl 50 mM, apresentando uma atividade de 4676 U.mg-1 . Além disso, apresentou atividade em condições ácidas e básicas, preservando 50% da atividade em pH 4.0 e 52% em pH 11.0. A temperatura ótima da enzima foi de 80 °C, apresentando ótima termotolerância, sendo capaz de manter 53% de atividade a 60 °C e 44% a 90 °C. Além disso, a análise estrutural comparativa identificou diferenças marcantes que explicam a atividade da enzima contra ligações β-1,4 glicosídicas, e a ausência de atividade contra ligações β-1,3 e ligações β-1,3/β-1,4. Os resultados obtidos sugerem bom potencial de aplicação no ramo industrial da biorrefinaria, sendo capaz de suportar altas temperaturas utilizadas no processamento de biomassa e também se mostrou ativa em uma ampla faixa de pH, sendo essa uma característica desejada para lidar com os problemas causados no prétratamento da matéria-prima, e também no processamento de biomassa.
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Apesar de insetos apresentarem ampla distribuição geográfica, um grande número de espécies distribuídas em pelo menos 30 ordens e hábitos alimentares diversificados, as CAZymes de insetos são pouco exploradas. Um recente estudo -ômico do inseto Pseudolicoriella hygida identificou um conjunto de β-glucanases no genoma e no transcriptoma que estão presentes no proteoma da saliva das larvas. A presença destas enzimas na saliva de larvas foi posteriormente confirmada através de ensaios de atividade enzimática. Nesse contexto, os objetivos desse trabalho foram a expressão, purificação e caracterização bioquímica das CAZymes encontradas no genoma de Psl. hygida. Os cDNAs que codificam cinco enzimas foram extraídas e amplificadas com sucesso. As enzimas Bhyg_04913/pET-28a, Bhyg_13095/pET-28a e Bhyg_05920/pET-22b foram expressas com sucesso em sistema procariótico se utilizando de baixas temperaturas. A enzima Bhyg_05920/pET-22b, que possui um peso molecular aproximado de 42 kDa, foi purificada e caracterizada. Essa enzima se mostrou mais ativa em pH 8.0 e tampão Tris-HCl 50 mM, apresentando uma atividade de 4676 U.mg-1 . Além disso, apresentou atividade em condições ácidas e básicas, preservando 50% da atividade em pH 4.0 e 52% em pH 11.0. A temperatura ótima da enzima foi de 80 °C, apresentando ótima termotolerância, sendo capaz de manter 53% de atividade a 60 °C e 44% a 90 °C. Além disso, a análise estrutural comparativa identificou diferenças marcantes que explicam a atividade da enzima contra ligações β-1,4 glicosídicas, e a ausência de atividade contra ligações β-1,3 e ligações β-1,3/β-1,4. Os resultados obtidos sugerem bom potencial de aplicação no ramo industrial da biorrefinaria, sendo capaz de suportar altas temperaturas utilizadas no processamento de biomassa e também se mostrou ativa em uma ampla faixa de pH, sendo essa uma característica desejada para lidar com os problemas causados no prétratamento da matéria-prima, e também no processamento de biomassa.Biorefinery is one of the aspects of the bio-based circular economy, which aims to transform biomass into industrially significant chemicals and clean energy. The use of Carbohydrate Active Enzymes (CAZymes) in biomass degradation is gaining prominence due to its various benefits and advantages, and the search for enzymes from various sources is a dynamic and expanding research area. Despite insects having a wide geographical distribution, a large number of species distributed in at least 30 orders, and diversified feeding habits, insect CAZymes are underexplored. A recent -omics study of the insect Pseudolicoriella hygida identified a set of β-glucanases in the genome and transcriptome that are present in the larval saliva proteome. The presence of these enzymes in larval saliva was subsequently confirmed through enzymatic activity assays. In this context, the objectives of this work were the expression, purification, and biochemical characterization of the CAZymes found in the genome of Psl. hygida. The cDNAs encoding five enzymes were successfully extracted and amplified. The enzymes Bhyg_04913/pET-28a, Bhyg_13095/pET-28a, and Bhyg_05920/pET22b were successfully expressed in a prokaryotic system using low temperatures. The enzyme Bhyg_05920/pET-22b, which has a molecular weight of approximately 42 kDa, was purified and characterized. This enzyme was most active at pH 8.0 in 50 mM Tris-HCl buffer, showing an activity of 4676 U.mg-1 . Furthermore, it exhibited activity under both acidic and basic conditions, retaining 50% activity at pH 4.0 and 52% at pH 11.0. The enzyme\'s optimal temperature was 80 °C, demonstrating excellent thermotolerance, maintaining 53% activity at 60 °C and 44% at 90 °C. Additionally, comparative structural analysis identified significant differences that explain the enzyme\'s activity against β-1,4 glycosidic bonds and the absence of activity against β-1,3 and β-1,3/β-1,4 bonds. The results suggest good potential for application in the industrial biorefinery sector, being able to withstand the high temperatures used in biomass processing and showing activity over a wide pH range, which is a desired characteristic to address the issues caused during the pretreatment of raw materials and biomass processing.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPWard, Richard JohnLopes, Vítor Kunes2024-10-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59138/tde-02122024-165918/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-03-17T17:10:53Zoai:teses.usp.br:tde-02122024-165918Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-03-17T17:10:53Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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description A biorrefinaria é uma das vertentes da economia circular de base biológica, a qual visa a transformação de biomassa em produtos químicos de interesse industrial e em energia limpa. A utilização de enzimas ativas contra carboidratos (Carbohydrate Active Enzymes - CAZymes) na degradação de biomassa está ganhando destaque devido aos seus diversos benefícios e vantagens, e a busca de enzimas de várias fontes é uma área de pesquisa dinâmica e em expansão. Apesar de insetos apresentarem ampla distribuição geográfica, um grande número de espécies distribuídas em pelo menos 30 ordens e hábitos alimentares diversificados, as CAZymes de insetos são pouco exploradas. Um recente estudo -ômico do inseto Pseudolicoriella hygida identificou um conjunto de β-glucanases no genoma e no transcriptoma que estão presentes no proteoma da saliva das larvas. A presença destas enzimas na saliva de larvas foi posteriormente confirmada através de ensaios de atividade enzimática. Nesse contexto, os objetivos desse trabalho foram a expressão, purificação e caracterização bioquímica das CAZymes encontradas no genoma de Psl. hygida. Os cDNAs que codificam cinco enzimas foram extraídas e amplificadas com sucesso. As enzimas Bhyg_04913/pET-28a, Bhyg_13095/pET-28a e Bhyg_05920/pET-22b foram expressas com sucesso em sistema procariótico se utilizando de baixas temperaturas. A enzima Bhyg_05920/pET-22b, que possui um peso molecular aproximado de 42 kDa, foi purificada e caracterizada. Essa enzima se mostrou mais ativa em pH 8.0 e tampão Tris-HCl 50 mM, apresentando uma atividade de 4676 U.mg-1 . Além disso, apresentou atividade em condições ácidas e básicas, preservando 50% da atividade em pH 4.0 e 52% em pH 11.0. A temperatura ótima da enzima foi de 80 °C, apresentando ótima termotolerância, sendo capaz de manter 53% de atividade a 60 °C e 44% a 90 °C. Além disso, a análise estrutural comparativa identificou diferenças marcantes que explicam a atividade da enzima contra ligações β-1,4 glicosídicas, e a ausência de atividade contra ligações β-1,3 e ligações β-1,3/β-1,4. Os resultados obtidos sugerem bom potencial de aplicação no ramo industrial da biorrefinaria, sendo capaz de suportar altas temperaturas utilizadas no processamento de biomassa e também se mostrou ativa em uma ampla faixa de pH, sendo essa uma característica desejada para lidar com os problemas causados no prétratamento da matéria-prima, e também no processamento de biomassa.
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