Expressão e atividade diferenciais da MMP9 em urina de pacientes com câncer de próstata comparados com pacientes com hiperplasia benigna de próstata.

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Quina, Daniel Outon
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-26032025-164819/
Resumo: O câncer de próstata (PCa) é um dos cânceres mais prevalentes em homens em todo o mundo. A principal ferramenta de diagnóstico atual disponível considerada o padrão ouro é o antígeno específico da próstata (PSA). No entanto, pode resultar em falsos positivos e sobrediagnóstico, levando a biópsias desnecessárias. Isto é particularmente relevante quando comparado com outras condições como hiperplasia prostática benigna (BPH), prostatite, atrofia prostática associada a tecidos prostáticos benignos (BPT) ou infecções do trato urinário. Devido a isso, há uma necessidade urgente de descobrir novos biomarcadores para o diagnóstico precoce de alto risco. A urina é considerada uma fonte rica em proteínas, lipídios e biomarcadores baseados em ácidos nucléicos para diversas doenças, pois pode ser coletada em grandes volumes de forma recorrente por técnicas não invasivas. Neste trabalho, aplicamos um fluxo de trabalho abrangente com base em abordagens proteômicas e validação funcional para avaliar candidatos a potenciais biomarcadores na urina de pacientes com PCa e BPT. Depois de realizar uma análise proteômica baseada em espectrometria de massa quantitativa em grande escala, a metaloproteinase de matriz 9 (MMP9) foi identificada como diferencialmente regulada na urina de pacientes com PCa em comparação com o grupo de controle. Sua validação foi realizada por meio de técnicas ortogonais que vão desde proteômica direcionada (monitoramento de reação paralela e monitoramento de reação pseudo-selecionada), zimografia, ELISA e transferência de energia por ressonância fluorescente, com foco na expressão e atividade de MMP9 presente na urina dos pacientes. Mostramos que, usando os valores combinados de expressão e atividade de MMP9, obtivemos uma boa separação na análise ROC (0,94 AUC) entre pacientes com PCa e BPT com sensibilidade de 100% e especificidade de 76,92%. Como resultado, a MMP9 pode ser um passo em direção a um candidato a biomarcador para câncer de próstata.
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Isto é particularmente relevante quando comparado com outras condições como hiperplasia prostática benigna (BPH), prostatite, atrofia prostática associada a tecidos prostáticos benignos (BPT) ou infecções do trato urinário. Devido a isso, há uma necessidade urgente de descobrir novos biomarcadores para o diagnóstico precoce de alto risco. A urina é considerada uma fonte rica em proteínas, lipídios e biomarcadores baseados em ácidos nucléicos para diversas doenças, pois pode ser coletada em grandes volumes de forma recorrente por técnicas não invasivas. Neste trabalho, aplicamos um fluxo de trabalho abrangente com base em abordagens proteômicas e validação funcional para avaliar candidatos a potenciais biomarcadores na urina de pacientes com PCa e BPT. Depois de realizar uma análise proteômica baseada em espectrometria de massa quantitativa em grande escala, a metaloproteinase de matriz 9 (MMP9) foi identificada como diferencialmente regulada na urina de pacientes com PCa em comparação com o grupo de controle. Sua validação foi realizada por meio de técnicas ortogonais que vão desde proteômica direcionada (monitoramento de reação paralela e monitoramento de reação pseudo-selecionada), zimografia, ELISA e transferência de energia por ressonância fluorescente, com foco na expressão e atividade de MMP9 presente na urina dos pacientes. Mostramos que, usando os valores combinados de expressão e atividade de MMP9, obtivemos uma boa separação na análise ROC (0,94 AUC) entre pacientes com PCa e BPT com sensibilidade de 100% e especificidade de 76,92%. Como resultado, a MMP9 pode ser um passo em direção a um candidato a biomarcador para câncer de próstata.Prostate cancer (PCa) is one of the most prevalent cancers in men all over the world. The current gold standard diagnostic tool available is the prostate specific antigen (PSA). However, it can yield false positives and overdiagnosis leading to unnecessary biopsies. This is particularly relevant when compared to other conditions such as benign prostatic hyperplasia (BPH), prostatitis, prostatic atrophy associated to benign prostatic tissues (BPT) or urinary tract infections. Due to that, there is an urgent need to discover novel biomarkers for early diagnosis of high-risk. Urine is considered a rich source of proteins, lipids and nucleic acids-based biomarkers for several diseases because it can be collected in large volumes recurrently by non-invasive techniques. In this work, we applied a comprehensive workflow based on proteomic approaches and functional validation to evaluate potential biomarker candidates in the urine of PCa and BPT patients. After performing a large scale quantitative mass spectrometry-based proteomic analysis, matrix metalloproteinase 9 (MMP-9) was identified as differentially regulated in urine from PCa patients compared to the control group. Its validation was performed using orthogonal techniques ranging from targeted proteomics (parallel reaction monitoring and pseudo Selected Reaction Monitoring), zymography, ELISA and fluorescence resonance energy transfer, focusing on both MMP9 expression and activity present in the urine of the patients. We showed that, using the combined values of expression and activity of MMP-9, we obtained a good separation in the ROC analysis (0.94 AUC) between PCa and BPT patients with 100% sensitivity and 76.92% specificity. As a result, MMP-9 can be a step towards a biomarker candidate for prostate cancer.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPPalmisano, GiuseppeQuina, Daniel Outon2021-02-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-26032025-164819/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-03-28T16:24:01Zoai:teses.usp.br:tde-26032025-164819Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-03-28T16:24:01Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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