Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Sousa, Victor Klein de
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-05082021-152747/
Resumo: A espectroscopia de dicroísmo circular (CD) é uma técnica biofísica amplamente difundida e utilizada para fornecer informações estruturais a respeito de proteínas e peptídeos. Compostos quirais apresentam espectro de CD característico devido à diferença de absorção da luz circularmente polarizada à direita e à esquerda. Do espectro de CD de uma proteína, extraem-se informações acerca de sua estrutura secundária no ambiente e nas condições em que se encontra, sendo possível estimar as frações de cada tipo de estrutura secundária presentes na molécula. Todavia, assim como qualquer técnica experimental, deve-se ter cautela na escolha dos parâmetros de entrada ao coletar um espectro de CD, visto que eles afetam diretamente a qualidade do sinal obtido. No primeiro capítulo deste trabalho, foi investigado como a escolha e a variação de sete parâmetros de entrada afetam os resultados de CD. Um método Tipo-Monte Carlo foi implementado para estimar as incertezas nas porcentagens de estrutura secundária predita. Uma mudança sutil em alguns parâmetros foi capaz de afetar significativamente as análises de CD, em destaque as variações na concentração da amostra e na presença de aditivos (tais como os íons cloreto) na solução. No segundo capítulo deste trabalho, descreve-se a implementação das reações de síntese de peptídeos em fase sólida no IFUSP, e a interação do peptídeo Pln149 com diferentes monocamadas fosfolipídicas, utilizando medidas de pressão superficial em monocamadas de Langmuir. Estes resultados evidenciam que a Pln149 pode interagir tanto com monocamadas lipídicas negativamente carregadas (o que já se conhecia previamente) quanto com superfícies zwitteriônicas.
id USP_828a02057f462c6975f292ad110dfb94
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-05082021-152747
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianosApplications of circular dichroism spectroscopy and tensiometry in Langmuir monolayers to study proteins and antimicrobial peptidesCircular Dichroism SpectroscopyEspectroscopia de Dicroísmo CircularLangmuir monolayersMétodo Tipo-Monte CarloMonocamada de LangmuirMonte Carlo-Like MethodSíntese de peptídeos em fase sólidaSolid Phase Peptide synthesisTensiometriaTensiometryA espectroscopia de dicroísmo circular (CD) é uma técnica biofísica amplamente difundida e utilizada para fornecer informações estruturais a respeito de proteínas e peptídeos. Compostos quirais apresentam espectro de CD característico devido à diferença de absorção da luz circularmente polarizada à direita e à esquerda. Do espectro de CD de uma proteína, extraem-se informações acerca de sua estrutura secundária no ambiente e nas condições em que se encontra, sendo possível estimar as frações de cada tipo de estrutura secundária presentes na molécula. Todavia, assim como qualquer técnica experimental, deve-se ter cautela na escolha dos parâmetros de entrada ao coletar um espectro de CD, visto que eles afetam diretamente a qualidade do sinal obtido. No primeiro capítulo deste trabalho, foi investigado como a escolha e a variação de sete parâmetros de entrada afetam os resultados de CD. Um método Tipo-Monte Carlo foi implementado para estimar as incertezas nas porcentagens de estrutura secundária predita. Uma mudança sutil em alguns parâmetros foi capaz de afetar significativamente as análises de CD, em destaque as variações na concentração da amostra e na presença de aditivos (tais como os íons cloreto) na solução. No segundo capítulo deste trabalho, descreve-se a implementação das reações de síntese de peptídeos em fase sólida no IFUSP, e a interação do peptídeo Pln149 com diferentes monocamadas fosfolipídicas, utilizando medidas de pressão superficial em monocamadas de Langmuir. Estes resultados evidenciam que a Pln149 pode interagir tanto com monocamadas lipídicas negativamente carregadas (o que já se conhecia previamente) quanto com superfícies zwitteriônicas.Circular dichroism (CD) spectroscopy is a widely used biophysical technique employed to obtain structural information of proteins and peptides. Chiral compounds present a typical CD spectrum due to the difference in absorption of right and left circularly polarized light. From the CD spectrum of a protein one can extract information about its secondary structure in the experimental conditions that the protein is found, and it is possible to estimate the content of each type of secondary structure present in the molecule. However, as any other experimental technique, caution must be paid in setting the data collection parameters, since they can directly affect the quality of the CD signal. In the first chapter of this work, it was investigated how the choice and the variation of seven collection parameters might affect the CD results. A Monte Carlo-like method was implemented to estimate the uncertainties in the percentages of predicted secondary structures. A slight change in some parameters was enough to significantly affect the CD analysis, in special the changes in sample concentration and the presence of additives (such as chloride ions) in the solution. In the second chapter of this work, the implementation of solid-phase peptide synthesis reaction at IFUSP, the interaction of the peptide Pln149 with different phospholipid monolayers, and measurements of surface pressure in Langmuir monolayers are described. These results pointed out an evidence for Pln149 interaction with both negatively charged monolayers (as was previously described by literature) and zwitterionic phospholipid surfaces.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLopes, José Luiz de SouzaSousa, Victor Klein de2021-07-12info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-05082021-152747/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2021-09-16T20:30:02Zoai:teses.usp.br:tde-05082021-152747Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212021-09-16T20:30:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos
Applications of circular dichroism spectroscopy and tensiometry in Langmuir monolayers to study proteins and antimicrobial peptides
title Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos
spellingShingle Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos
Sousa, Victor Klein de
Circular Dichroism Spectroscopy
Espectroscopia de Dicroísmo Circular
Langmuir monolayers
Método Tipo-Monte Carlo
Monocamada de Langmuir
Monte Carlo-Like Method
Síntese de peptídeos em fase sólida
Solid Phase Peptide synthesis
Tensiometria
Tensiometry
title_short Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos
title_full Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos
title_fullStr Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos
title_full_unstemmed Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos
title_sort Aplicações da espectroscopia de dicroísmo circular e da tensiometria em monocamadas de Langmuir no estudo de proteínas e peptídeos antimicrobianos
author Sousa, Victor Klein de
author_facet Sousa, Victor Klein de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Lopes, José Luiz de Souza
dc.contributor.author.fl_str_mv Sousa, Victor Klein de
dc.subject.por.fl_str_mv Circular Dichroism Spectroscopy
Espectroscopia de Dicroísmo Circular
Langmuir monolayers
Método Tipo-Monte Carlo
Monocamada de Langmuir
Monte Carlo-Like Method
Síntese de peptídeos em fase sólida
Solid Phase Peptide synthesis
Tensiometria
Tensiometry
topic Circular Dichroism Spectroscopy
Espectroscopia de Dicroísmo Circular
Langmuir monolayers
Método Tipo-Monte Carlo
Monocamada de Langmuir
Monte Carlo-Like Method
Síntese de peptídeos em fase sólida
Solid Phase Peptide synthesis
Tensiometria
Tensiometry
description A espectroscopia de dicroísmo circular (CD) é uma técnica biofísica amplamente difundida e utilizada para fornecer informações estruturais a respeito de proteínas e peptídeos. Compostos quirais apresentam espectro de CD característico devido à diferença de absorção da luz circularmente polarizada à direita e à esquerda. Do espectro de CD de uma proteína, extraem-se informações acerca de sua estrutura secundária no ambiente e nas condições em que se encontra, sendo possível estimar as frações de cada tipo de estrutura secundária presentes na molécula. Todavia, assim como qualquer técnica experimental, deve-se ter cautela na escolha dos parâmetros de entrada ao coletar um espectro de CD, visto que eles afetam diretamente a qualidade do sinal obtido. No primeiro capítulo deste trabalho, foi investigado como a escolha e a variação de sete parâmetros de entrada afetam os resultados de CD. Um método Tipo-Monte Carlo foi implementado para estimar as incertezas nas porcentagens de estrutura secundária predita. Uma mudança sutil em alguns parâmetros foi capaz de afetar significativamente as análises de CD, em destaque as variações na concentração da amostra e na presença de aditivos (tais como os íons cloreto) na solução. No segundo capítulo deste trabalho, descreve-se a implementação das reações de síntese de peptídeos em fase sólida no IFUSP, e a interação do peptídeo Pln149 com diferentes monocamadas fosfolipídicas, utilizando medidas de pressão superficial em monocamadas de Langmuir. Estes resultados evidenciam que a Pln149 pode interagir tanto com monocamadas lipídicas negativamente carregadas (o que já se conhecia previamente) quanto com superfícies zwitteriônicas.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-07-12
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-05082021-152747/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-05082021-152747/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257920992968704