Simulação de propriedades estruturais e eletrônicas de agregados, líquidos regulares e supercríticos
| Ano de defesa: | 2010 |
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| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | Resumo: | Esta tese de doutorado investiga as propriedades espectroscópicas e termodinâmicas de líquidos moleculares. Para este fim utilizam-se técnicas de química quântica e modelagem na simulação computacional. Para simular as propriedades termodinâmicas e flexibilidade molecular foi utilizada Simulação Clássica (Monte Carlo e Dinâmica Molecular). Já para reproduzir as propriedades eletrônicas, valeu-se de métodos de Química Quântica (post-HF e DFT). O efeito de polarização foi introduzido pelo Método Seqüencial Monte Carlo/Mecânica Quântica (S-MC/QM) e também via campo de força polarizáveis. Apresenta-se uma visão geral destas técnicas no apêndice. Este trabalho se divide em três partes. Na primeira parte são obtidas as propriedades estruturais e espectroscópicas de agregados de fenol e água (1+1 e 1+2) e fenol e etanol (1+1). Os modos vibracionais (inter e intramoleculares) e a energia de ligação são calculados. Os resultados estruturais e o desvio solvatocrômico são coerentes com dados experimentais e expectativas teóricas (para os diferentes agregados). Na segunda parte é realizada a simulação do fenol em água utilizando o protocolo S-MC/QM, com o respectivo cálculo do espectro eletrônico. É apresentado o estudo das pontes de hidrogênio e as diferentes contribuições que determinam o desvio solvatocrômico em solução. Em seguida é feita a simulação do fenol em etanol utilizando dinâmica molecular e o campo de força flexível e polarizável AMOEBA. As propriedades termodinâmicas da simulação estão em excelente concordância com as expectativas teóricas e experimentais. Isso é surpreendente dado o fato que o modelo não é parametrizado empiricamente. Por fim, é detalhado o trabalho realizado com a água supercrítica. Foram executadas centenas de simulações a fim de se obter o ponto crítico do modelo AMOEBA. São apresentadas as isotermas e os parâmetros da equação de estado que determinam o comportamento do modelo nessa região. Este documento amostra o conhecimento adquirido pelo aluno em diferentes aspectos da física computacional, desde a parte técnica, os diversos modelos e aproximações teóricas utilizadas em simulação e a capacidade de aplicação deste conhecimento em problemas de interesse físico, os quais resultaram em dois artigos publicados [12,22] e mais dois trabalhos em preparação. |
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Simulação de propriedades estruturais e eletrônicas de agregados, líquidos regulares e supercríticosSimulation of Structural and Electronic Properties of Aggregates, Regular and Supercritical Liquidságua supercríticacomputational simulationdinâmica molecularlíquidos molecularesmolecular dynamicsmolecular liquidsquantum chemistryquímica quânticasimulação computacionalsupercritical waterEsta tese de doutorado investiga as propriedades espectroscópicas e termodinâmicas de líquidos moleculares. Para este fim utilizam-se técnicas de química quântica e modelagem na simulação computacional. Para simular as propriedades termodinâmicas e flexibilidade molecular foi utilizada Simulação Clássica (Monte Carlo e Dinâmica Molecular). Já para reproduzir as propriedades eletrônicas, valeu-se de métodos de Química Quântica (post-HF e DFT). O efeito de polarização foi introduzido pelo Método Seqüencial Monte Carlo/Mecânica Quântica (S-MC/QM) e também via campo de força polarizáveis. Apresenta-se uma visão geral destas técnicas no apêndice. Este trabalho se divide em três partes. Na primeira parte são obtidas as propriedades estruturais e espectroscópicas de agregados de fenol e água (1+1 e 1+2) e fenol e etanol (1+1). Os modos vibracionais (inter e intramoleculares) e a energia de ligação são calculados. Os resultados estruturais e o desvio solvatocrômico são coerentes com dados experimentais e expectativas teóricas (para os diferentes agregados). Na segunda parte é realizada a simulação do fenol em água utilizando o protocolo S-MC/QM, com o respectivo cálculo do espectro eletrônico. É apresentado o estudo das pontes de hidrogênio e as diferentes contribuições que determinam o desvio solvatocrômico em solução. Em seguida é feita a simulação do fenol em etanol utilizando dinâmica molecular e o campo de força flexível e polarizável AMOEBA. As propriedades termodinâmicas da simulação estão em excelente concordância com as expectativas teóricas e experimentais. Isso é surpreendente dado o fato que o modelo não é parametrizado empiricamente. Por fim, é detalhado o trabalho realizado com a água supercrítica. Foram executadas centenas de simulações a fim de se obter o ponto crítico do modelo AMOEBA. São apresentadas as isotermas e os parâmetros da equação de estado que determinam o comportamento do modelo nessa região. Este documento amostra o conhecimento adquirido pelo aluno em diferentes aspectos da física computacional, desde a parte técnica, os diversos modelos e aproximações teóricas utilizadas em simulação e a capacidade de aplicação deste conhecimento em problemas de interesse físico, os quais resultaram em dois artigos publicados [12,22] e mais dois trabalhos em preparação.This thesis investigates the spectroscopic and thermodynamic properties of molecular liquids. To this end, we use techniques of quantum chemistry and modeling to do computational simulation. To simulate the thermodynamic properties and molecular flexibility it was used Classical Simulation (Monte Carlo and Molecular Dynamics). To reproduce the electronic properties it was used Quantum Chemistry methods (post-HF and DFT). The polarization effect was introduced through the Sequential Monte Carlo / Quantum Mechanics Method and polarizable force fields. It is presented an overview of these techniques in the appendix. This work is divided into three parts. In the first part is obtained spectroscopic and structural properties of phenol and water (1+1 and 1+2) and phenol and ethanol (1+1) clusters. The vibrational modes (intra and intermolecular) and binding energies are calculated. The structural results and the solvatochromic deviations are consistent with experimental data and theoretical expectations (for different clusters). In the second part is performed the simulation of phenol in water using the S-MC/QM protocol, followed by the calculation of the electronic spectrum. It is presented the study of hydrogen bonding and the different contributions which determine the solvatochromic deviation in solution. So, it is made the simulation of phenol in ethanol using molecular dynamics and the polarizable and flexible force field AMOEBA. The thermodynamic properties of the simulation are in excellent agreement with theoretical expectations and experimental data. This is surprising given the fact that the model is not parameterized empirically. Finally, it is detailed the work on supercritical water. It has been performed hundreds of simulations in order to obtain the critical point of the model AMOEBA. Isotherms are presented as well as the parameters of the equation of state which determine the behavior of the model in that region. This document samples the acquired knowledge of the student in different aspects of computational physics, from the technical side, the various models and theoretical approaches used in simulation and the ability to apply this knowledge to problems of physical interest, which resulted in two published articles [12,22] and other two are in preparation.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCanuto, Sylvio Roberto AcciolyBarreto, Rafael Carvalho2010-12-03info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-13122024-162550/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-07-01T16:21:02Zoai:teses.usp.br:tde-13122024-162550Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.platendimento@abcd.usp.bropendoar:27212025-08-07T19:46:14.595247Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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Esta tese de doutorado investiga as propriedades espectroscópicas e termodinâmicas de líquidos moleculares. Para este fim utilizam-se técnicas de química quântica e modelagem na simulação computacional. Para simular as propriedades termodinâmicas e flexibilidade molecular foi utilizada Simulação Clássica (Monte Carlo e Dinâmica Molecular). Já para reproduzir as propriedades eletrônicas, valeu-se de métodos de Química Quântica (post-HF e DFT). O efeito de polarização foi introduzido pelo Método Seqüencial Monte Carlo/Mecânica Quântica (S-MC/QM) e também via campo de força polarizáveis. Apresenta-se uma visão geral destas técnicas no apêndice. Este trabalho se divide em três partes. Na primeira parte são obtidas as propriedades estruturais e espectroscópicas de agregados de fenol e água (1+1 e 1+2) e fenol e etanol (1+1). Os modos vibracionais (inter e intramoleculares) e a energia de ligação são calculados. Os resultados estruturais e o desvio solvatocrômico são coerentes com dados experimentais e expectativas teóricas (para os diferentes agregados). Na segunda parte é realizada a simulação do fenol em água utilizando o protocolo S-MC/QM, com o respectivo cálculo do espectro eletrônico. É apresentado o estudo das pontes de hidrogênio e as diferentes contribuições que determinam o desvio solvatocrômico em solução. Em seguida é feita a simulação do fenol em etanol utilizando dinâmica molecular e o campo de força flexível e polarizável AMOEBA. As propriedades termodinâmicas da simulação estão em excelente concordância com as expectativas teóricas e experimentais. Isso é surpreendente dado o fato que o modelo não é parametrizado empiricamente. Por fim, é detalhado o trabalho realizado com a água supercrítica. Foram executadas centenas de simulações a fim de se obter o ponto crítico do modelo AMOEBA. São apresentadas as isotermas e os parâmetros da equação de estado que determinam o comportamento do modelo nessa região. Este documento amostra o conhecimento adquirido pelo aluno em diferentes aspectos da física computacional, desde a parte técnica, os diversos modelos e aproximações teóricas utilizadas em simulação e a capacidade de aplicação deste conhecimento em problemas de interesse físico, os quais resultaram em dois artigos publicados [12,22] e mais dois trabalhos em preparação. |
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