Estudos analíticos instrumentais de metabólitos secundários produzidos por bactérias endofíticas e fitopatógenas de citros
| Ano de defesa: | 2005 |
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| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75132/tde-07082025-143621/ |
Resumo: | Este projeto teve como objetivo a investigação de metabólitos secundários sintetizados in vitro por bactérias fitopatogênicas (Xyella fastid iosa Xf ) e endofíticas (linhagens de Methylobacterium), que estão associadas a doenças em citros. Padrões de metabólitos também foram investigados. Desta forma, técnicas instrumentais, tais como eletroforese capilar (CE), cromatografia líquida (HPLC), cromatografia gasosa (GC) e espectrometria de massas (MS), foram empregadas. Os metabólitos investigados foram sideróforos e fatores sinais difusíveis (DSF). Os sideróforos são peptídeos de síntese não-ribossomal com baixa massa molecular (ca. 500 à 2000 Da) e alta afinidade por ferro. Estes metabólitos são produzidos e secretados por microorganismos sob estresse de ferro para seqüestrar este elemento do ambiente externo ou do hospedeiro. Portanto, os sideróforos são fatores patogênicos em potencial já que seqüestram um elemento essencial ao hospedeiro. A investigação sobre o mecanismo de fragmentação de padrões de sideróforos foi realizada por espectrometria de massas em \"tandem\", revelando as clivagens preferenciais destas biomoléculas . As técnicas de CE-MS e CE-UV foram usadas para analisar extratos de Methylobacterium in vitro. Diferentes sideróforos foram detectados de acordo com a espécie de bactéria. Uma das linhagens de Methylobacterium foi selecionada para ser analisada por CE-MS/MS levando a identificação de possíveis resíduos de aminoácidos presentes no sideróforo. A estequiometria e as constantes condicionais de formação de alguns complexos metal-deferoxamina, um padrão de sideróforo, foram investigados por eletroforese capilar de zona (CZE) usando o método da variação contínua. Esta é uma novidade em relação a análise de complexos metálicos já que este método nunca foi realizado por CZE. Os DSFs são moléculas sinalizadoras que ativam o mecanismo de \"quorum sensing\" dos microorganismos levando à síntese de fatores patogênicos. O DSF produzido pela fitobactéria Xanthomonas campestris pv. Campestris é um ácido graxo α-β instaurado ramificado e a literatura apresenta fortes evidências de que a Xf também produz uma molécula de DSF similar. Os resultados obtidos pelas análises por HPLC e GC-MS de extratos de Xf in vitro comfirmaram esta similaridade já que a molécula de DSF identificada é, provavelmente , o ácido 12-metil tetradecanóico. |
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Estudos analíticos instrumentais de metabólitos secundários produzidos por bactérias endofíticas e fitopatógenas de citrosInstrumental analytical studies of secondary metabolites produced by endophytic bacteria and phytopathogens of citrus xylella fastidiosaxanthomonas campestrisxanthomonas campestrisxylella fastidiosaCE-MSCE-MSCE-UVCE-UVdifuseble signal factorsfatores sinais difusíveisGC-MSGC-MSLC-UVLC-UVsideroforessideróforosEste projeto teve como objetivo a investigação de metabólitos secundários sintetizados in vitro por bactérias fitopatogênicas (Xyella fastid iosa Xf ) e endofíticas (linhagens de Methylobacterium), que estão associadas a doenças em citros. Padrões de metabólitos também foram investigados. Desta forma, técnicas instrumentais, tais como eletroforese capilar (CE), cromatografia líquida (HPLC), cromatografia gasosa (GC) e espectrometria de massas (MS), foram empregadas. Os metabólitos investigados foram sideróforos e fatores sinais difusíveis (DSF). Os sideróforos são peptídeos de síntese não-ribossomal com baixa massa molecular (ca. 500 à 2000 Da) e alta afinidade por ferro. Estes metabólitos são produzidos e secretados por microorganismos sob estresse de ferro para seqüestrar este elemento do ambiente externo ou do hospedeiro. Portanto, os sideróforos são fatores patogênicos em potencial já que seqüestram um elemento essencial ao hospedeiro. A investigação sobre o mecanismo de fragmentação de padrões de sideróforos foi realizada por espectrometria de massas em \"tandem\", revelando as clivagens preferenciais destas biomoléculas . As técnicas de CE-MS e CE-UV foram usadas para analisar extratos de Methylobacterium in vitro. Diferentes sideróforos foram detectados de acordo com a espécie de bactéria. Uma das linhagens de Methylobacterium foi selecionada para ser analisada por CE-MS/MS levando a identificação de possíveis resíduos de aminoácidos presentes no sideróforo. A estequiometria e as constantes condicionais de formação de alguns complexos metal-deferoxamina, um padrão de sideróforo, foram investigados por eletroforese capilar de zona (CZE) usando o método da variação contínua. Esta é uma novidade em relação a análise de complexos metálicos já que este método nunca foi realizado por CZE. Os DSFs são moléculas sinalizadoras que ativam o mecanismo de \"quorum sensing\" dos microorganismos levando à síntese de fatores patogênicos. O DSF produzido pela fitobactéria Xanthomonas campestris pv. Campestris é um ácido graxo α-β instaurado ramificado e a literatura apresenta fortes evidências de que a Xf também produz uma molécula de DSF similar. Os resultados obtidos pelas análises por HPLC e GC-MS de extratos de Xf in vitro comfirmaram esta similaridade já que a molécula de DSF identificada é, provavelmente , o ácido 12-metil tetradecanóico.This project aimed to investigate secondary metabolites synthesized in vitro by phytopathogenic (Xylella fastidiosa Xf ) and endophytic (Methylobacterium strains) bacteria, which can cause citrus diseases. Standard metabolites were investigated as well. For this purpose, instrumental analytical techniques, such as capillary electrophoresis (CE), liquid chromatography (HPLC), gas chromatography (GC) and mass spectrometry (MS), were employed. The investigated metabolites were siderophores and diffusible signal factors (DSF). Siderophores are non-ribosomal peptides with low molecular weight (e.a. 500 to 2000 Da) and high affinity for iron. These metabolites are produced and secreted by microorganisms under iron stress in order to scavange this element from the environment or from the host. Therefore, siderophores are potential pathogenic factors since they sequester an essencial element from the host. Investigation concemed about standard siderophore fragmentation pathway was carried out by tandem mass spectrometry, revealing the preferential cleavages of such biomolecules. CE-MS and CE-UV were used to analyze Methylobacterium in vitro extracts. Different siderophores were detected according to the bacterium species. One of the extracts was selected for CE-MS/MS experiments, which has shown the possible amino acids residues present in the siderophore molecule. The stoichiometry and conditional formation constants of some metal-deferoxamine complexes, a standard siderophore, were investigated by capillary zone electrophoresis (CZE) using the continuous variation method. This is a new approach towards metallic complexes research since CZE has never been used for this purpose. DSFs are signaling molecules which activates the microorganism \"quorum sensing\" mechanism and, as a consequence, the synthesis of pathogenic factors. The DSF produced by Xanthomonas campestris pv. Campestris phytobacterium is an α-β unsaturated branched fatty acid and the literature strongly suggests that Xf also produces a similar DSF molecule. The results obtained by HPLC and GC-MS analysis of a Xf in vitro extract confirmed this similarity since the identified DSF molecule is, probably, 12-methyl tetradecanoic acid.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCarrilho, EmanuelSimionato, Ana Valeria Colnaghi2005-10-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75132/tde-07082025-143621/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-08-08T15:09:02Zoai:teses.usp.br:tde-07082025-143621Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-08-08T15:09:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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Este projeto teve como objetivo a investigação de metabólitos secundários sintetizados in vitro por bactérias fitopatogênicas (Xyella fastid iosa Xf ) e endofíticas (linhagens de Methylobacterium), que estão associadas a doenças em citros. Padrões de metabólitos também foram investigados. Desta forma, técnicas instrumentais, tais como eletroforese capilar (CE), cromatografia líquida (HPLC), cromatografia gasosa (GC) e espectrometria de massas (MS), foram empregadas. Os metabólitos investigados foram sideróforos e fatores sinais difusíveis (DSF). Os sideróforos são peptídeos de síntese não-ribossomal com baixa massa molecular (ca. 500 à 2000 Da) e alta afinidade por ferro. Estes metabólitos são produzidos e secretados por microorganismos sob estresse de ferro para seqüestrar este elemento do ambiente externo ou do hospedeiro. Portanto, os sideróforos são fatores patogênicos em potencial já que seqüestram um elemento essencial ao hospedeiro. A investigação sobre o mecanismo de fragmentação de padrões de sideróforos foi realizada por espectrometria de massas em \"tandem\", revelando as clivagens preferenciais destas biomoléculas . As técnicas de CE-MS e CE-UV foram usadas para analisar extratos de Methylobacterium in vitro. Diferentes sideróforos foram detectados de acordo com a espécie de bactéria. Uma das linhagens de Methylobacterium foi selecionada para ser analisada por CE-MS/MS levando a identificação de possíveis resíduos de aminoácidos presentes no sideróforo. A estequiometria e as constantes condicionais de formação de alguns complexos metal-deferoxamina, um padrão de sideróforo, foram investigados por eletroforese capilar de zona (CZE) usando o método da variação contínua. Esta é uma novidade em relação a análise de complexos metálicos já que este método nunca foi realizado por CZE. Os DSFs são moléculas sinalizadoras que ativam o mecanismo de \"quorum sensing\" dos microorganismos levando à síntese de fatores patogênicos. O DSF produzido pela fitobactéria Xanthomonas campestris pv. Campestris é um ácido graxo α-β instaurado ramificado e a literatura apresenta fortes evidências de que a Xf também produz uma molécula de DSF similar. Os resultados obtidos pelas análises por HPLC e GC-MS de extratos de Xf in vitro comfirmaram esta similaridade já que a molécula de DSF identificada é, provavelmente , o ácido 12-metil tetradecanóico. |
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