Filogenia, biologia celular, genômica e aplicações biotecnológicas de Amoebozoa com ênfase em amebas tecadas (Arcellinida)

• Ano de defesa: 2024
• Autor(a) principal: Sousa, Alfredo Leonardo Porfirio de
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: Draft genome; Eukaryotic evolution; Evolução eucariótica; Filogenômica; Genoma rascunho; Phylogenomics; Rab GTPases; Vase-shaped microfossils
• Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-18112024-141011/

Amoebozoa emergiu como um grupo modelo estratégico na protistologia e na biologia evolutiva. Este grupo eucariótico é composto principalmente por organismos ameboides (amebas) com tipos celulares morfologicamente dinâmicos que se movem e/ou se alimentam usando extensões transitórias chamadas pseudópodes. A diversidade de Amoebozoa abrange pelo menos 1,2 bilhão de anos de história evolutiva, conforme estimado por relógios moleculares. Sendo uma linhagem tão antiga, Amoebozoa testemunhou eventos geológicos e biológicos significativos, incluindo a formação e fragmentação de três supercontinentes, a formação dos continentes e oceanos atuais da Terra, e eventos importantes de extinç ao de vida, como as relacionadas as glaciações Sturtiana e Marinoana do Período Criogênico, frequentemente referidas como \"Snowball Earth\". Além disso, Amoebozoa possui um dos registros fósseis mais antigos atribuídos a um grupo de organismos vivos: microfósseis em formato de vaso do Toniano (vase-shaped microfossils, VSMs) associados a amebas tecadas (Arcellinida), fornecendo evidências convincentes de suas origens antigas e história evolutiva. Esta notável diversidade, raízes evolutivas profundas e rico registro fóssil tornam Amoebozoa um grupo fascinante para iluminar padrões de evolução da vida. Esta tese explora o potencial de Amoebozoa como um grupo modelo emergente, com um foco especial no grupo das amebas tecadas (Arcellinida). Nós investigamos a profunda história evolutiva de Amoebozoa através de filogenómica e evidências fósseis para obter insights sobre a evolução da vida ao longo do tempo geológico. Também estudamos a evolução da família de genes Rab GTPase dentro de Amoebozoa, destacando seu papel na complexidade celular e adaptação. Além disso, exploramos avanços metodológicos otimizando protocolos para coloração de actina e expressão transiente de genes-alvo fundidos a uma proteína fluorescente verde (Green Fluorescent Protein, GFP) usando Arcellinida como modelo. Além disso, a tese inclui a geração de um genoma rascunho para Cryptodifflugia operculata (Arcellinida: Amoebozoa). Finalmente, exploramos possíveis aplicações biotecnológicas derivadas de características morfológicas das amebas tecadas. Através de uma abordagem multidisciplinar abrangente, esta tese sublinha o potencial de Amoebozoa no avanço do conhecimento biológico e inovações tecnológicas. Em última análise, enfatizamos a importância de estabelecer e estudar grupos modelo como Amoebozoa para ampliar nossa compreensão de princípios biológicos fundamentais além daqueles fornecidos por organismos modelo de uma única espécie.