Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Santos, Jadson Carlos dos
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
ACE2
Aggressive autoimmunity
AIRE
Autoimmune regulator
Autoimunidade agressiva
COVID-19
Interação entre proteínas
Interaction between proteins
Mutações pontuais
Point mutations
SARS-CoV-2
Spike
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-17012025-114418/
Resumo: O foco desse estudo é sobre a significância de mutações pontuais em resíduos de aminoácidos na proteína Spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína autoimmune regulator (AIRE) de células tímicas humanas. Avaliamos os impactos dessas mutações nas interações moleculares que essas proteínas fazem com seus respectivos ligantes. Essas análises contribuíram com uma melhor compreensão das bases moleculares de duas doenças atuais, a COVID-19 e a autoimunidade agressiva (Síndrome APS-1). O estudo avança ao examinar por meio de ferramentas in silico especificamente as mutações N501Y e S477N presentes no domínio RBD da proteína Spike de diferentes variantes do vírus SARS-CoV-2, explorando as consequências da dessas mutações na interação com o receptor ACE2 humano e o impacto que isso teve na infectividade viral. Investigamos o potencial de peptídeos miméticos da ACE2, contendo a alfa hélice N-terminal desta proteína, como uma estratégia antiviral contra a infecção pelo SARS-CoV-2, analisando a interação desses peptídeos através de simulação de dinâmica molecular frente a mutações específicas do vírus. Além disso, o estudo explora os efeitos da mutação G228W na proteína AIRE, destacando seu papel na imunoregulação e autoimunidade através da interação com sua proteína parceira SIRT1. Os resultados são integrados para enfatizar como as interações moleculares e mutações em determinados resíduos de aminoácidos são fundamentais para entender a patogenicidade de mutações pontuais e tentar desenvolver novas terapias.
id USP_d6366c455792570c90b0d6c388dbefa2
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-17012025-114418
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressivaPoint substitutions of amino acid residues in the spike protein of the SARS-CoV-2 virus and the AIRE protein of human thymic cells respectively impact COVID-19 and aggressive autoimmunityACE2ACE2Aggressive autoimmunityAIREAIREAutoimmune regulatorAutoimmune regulatorAutoimunidade agressivaCOVID-19COVID-19Interação entre proteínasInteraction between proteinsMutações pontuaisPoint mutationsSARS-CoV-2SARS-CoV-2SpikeSpikeO foco desse estudo é sobre a significância de mutações pontuais em resíduos de aminoácidos na proteína Spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína autoimmune regulator (AIRE) de células tímicas humanas. Avaliamos os impactos dessas mutações nas interações moleculares que essas proteínas fazem com seus respectivos ligantes. Essas análises contribuíram com uma melhor compreensão das bases moleculares de duas doenças atuais, a COVID-19 e a autoimunidade agressiva (Síndrome APS-1). O estudo avança ao examinar por meio de ferramentas in silico especificamente as mutações N501Y e S477N presentes no domínio RBD da proteína Spike de diferentes variantes do vírus SARS-CoV-2, explorando as consequências da dessas mutações na interação com o receptor ACE2 humano e o impacto que isso teve na infectividade viral. Investigamos o potencial de peptídeos miméticos da ACE2, contendo a alfa hélice N-terminal desta proteína, como uma estratégia antiviral contra a infecção pelo SARS-CoV-2, analisando a interação desses peptídeos através de simulação de dinâmica molecular frente a mutações específicas do vírus. Além disso, o estudo explora os efeitos da mutação G228W na proteína AIRE, destacando seu papel na imunoregulação e autoimunidade através da interação com sua proteína parceira SIRT1. Os resultados são integrados para enfatizar como as interações moleculares e mutações em determinados resíduos de aminoácidos são fundamentais para entender a patogenicidade de mutações pontuais e tentar desenvolver novas terapias.This study focuses on the significance of point mutations in amino acid residues in the Spike protein of the SARS-CoV-2 virus and in the autoimmune regulatory protein (AIRE) of human thymic cells. We evaluated the impacts of these mutations on the molecular interactions these proteins make with their respective ligands. These analyses contributed to a better understanding of the molecular basis of two current diseases, COVID-19 and aggressive autoimmunity (APS-1 Syndrome). The study advances by examining, using in silico tools, specifically the N501Y and S477N mutations present in the RBD domain of the Spike protein of different variants of the SARS-CoV-2 virus, exploring the consequences of these mutations in the interaction with the human ACE2 receptor and the impact this had on viral infectivity. We investigated the potential of ACE2 mimetic peptides, containing the N-terminal alpha-helix of this protein, as an antiviral strategy against SARS-CoV-2 infection, analyzing the interaction of these peptides through molecular dynamics simulation against specific mutations of the virus. Furthermore, the study explores the effects of the G228W mutation in the AIRE protein, highlighting its role in immunoregulation and autoimmunity through interaction with its partner protein SIRT1. The results are integrated to emphasize how molecular interactions and mutations in specific amino acid residues are fundamental to understanding the pathogenicity of point mutations and trying to develop new therapies.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPPassos Junior, Geraldo Aleixo da SilvaSantos, Jadson Carlos dos2024-08-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-17012025-114418/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-05-05T10:32:06Zoai:teses.usp.br:tde-17012025-114418Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-05-05T10:32:06Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva
Point substitutions of amino acid residues in the spike protein of the SARS-CoV-2 virus and the AIRE protein of human thymic cells respectively impact COVID-19 and aggressive autoimmunity
title Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva
spellingShingle Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva
Santos, Jadson Carlos dos
ACE2
ACE2
Aggressive autoimmunity
AIRE
AIRE
Autoimmune regulator
Autoimmune regulator
Autoimunidade agressiva
COVID-19
COVID-19
Interação entre proteínas
Interaction between proteins
Mutações pontuais
Point mutations
SARS-CoV-2
SARS-CoV-2
Spike
Spike
title_short Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva
title_full Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva
title_fullStr Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva
title_full_unstemmed Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva
title_sort Substituições pontuais de resíduos de aminoácidos na proteína spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína AIRE de células tímicas humanas impactam respectivamente a COVID-19 e a autoimunidade agressiva
author Santos, Jadson Carlos dos
author_facet Santos, Jadson Carlos dos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Passos Junior, Geraldo Aleixo da Silva
dc.contributor.author.fl_str_mv Santos, Jadson Carlos dos
dc.subject.por.fl_str_mv ACE2
ACE2
Aggressive autoimmunity
AIRE
AIRE
Autoimmune regulator
Autoimmune regulator
Autoimunidade agressiva
COVID-19
COVID-19
Interação entre proteínas
Interaction between proteins
Mutações pontuais
Point mutations
SARS-CoV-2
SARS-CoV-2
Spike
Spike
topic ACE2
ACE2
Aggressive autoimmunity
AIRE
AIRE
Autoimmune regulator
Autoimmune regulator
Autoimunidade agressiva
COVID-19
COVID-19
Interação entre proteínas
Interaction between proteins
Mutações pontuais
Point mutations
SARS-CoV-2
SARS-CoV-2
Spike
Spike
description O foco desse estudo é sobre a significância de mutações pontuais em resíduos de aminoácidos na proteína Spike do vírus SARS-CoV-2 e na proteína autoimmune regulator (AIRE) de células tímicas humanas. Avaliamos os impactos dessas mutações nas interações moleculares que essas proteínas fazem com seus respectivos ligantes. Essas análises contribuíram com uma melhor compreensão das bases moleculares de duas doenças atuais, a COVID-19 e a autoimunidade agressiva (Síndrome APS-1). O estudo avança ao examinar por meio de ferramentas in silico especificamente as mutações N501Y e S477N presentes no domínio RBD da proteína Spike de diferentes variantes do vírus SARS-CoV-2, explorando as consequências da dessas mutações na interação com o receptor ACE2 humano e o impacto que isso teve na infectividade viral. Investigamos o potencial de peptídeos miméticos da ACE2, contendo a alfa hélice N-terminal desta proteína, como uma estratégia antiviral contra a infecção pelo SARS-CoV-2, analisando a interação desses peptídeos através de simulação de dinâmica molecular frente a mutações específicas do vírus. Além disso, o estudo explora os efeitos da mutação G228W na proteína AIRE, destacando seu papel na imunoregulação e autoimunidade através da interação com sua proteína parceira SIRT1. Os resultados são integrados para enfatizar como as interações moleculares e mutações em determinados resíduos de aminoácidos são fundamentais para entender a patogenicidade de mutações pontuais e tentar desenvolver novas terapias.
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2024-08-28
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-17012025-114418/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-17012025-114418/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1865492289031241728

Registros relacionados