Reações positrônicas em solução
| Ano de defesa: | 2024 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-11102024-092652/ |
Resumo: | Pósitrons e átomos de positrônio são conhecidos por serem excelentes sondas em nanoescala amplamente utilizadas em ciência de materiais e na medicina. Essas aplicações tecnológicas envolvendo pósitrons exploram os diferentes mecanismos de aniquilação desta partícula em matéria condensada de maneira geral. Em líquidos, a injeção de pósitrons desencadeia diversos processos ao longo da termalização dos mesmos resultando em reações positrônicas como a formação de átomos de positrônio, aniquilação pick-off, aniquilação direta com moléculas do meio, auto-aniquilação, conversão de spin entre outras. Neste trabalho, estamos interessados no estudo teórico da aniquilação pick-off de átomos de positrônio em líquidos, assim como na interação do pósitron com biomoléculas em solução. O estudo de átomos de positrônio (Ps) solvatados resultou em um protocolo QM/MM para a solvatação destes átomos. A descrição da interação Ps-solvente foi possível através da definição de um campo de força para o Ps, que permitiu a realização de simulações clássicas de Monte Carlo do sistema. A estrutura do líquido e as propriedades termodinâmicas obtidas nestas simulações indicaram um comportamento hidrofóbico do Ps, análogo ao observado na solvatação de gases nobres. As configurações do líquido geradas nestas simulações possibilitaram a realização de cálculos quânticos com a metodologia Any Particle Molecular Orbital. Com isso, determinamos as energias de ionização vertical do Ps em diferentes níveis de cálculo, e encontramos os tempos de vida do mesmo a partir das contribuições dos orbitais eletrônicos ocupados. Em paralelo ao estudo do Ps em líquidos, investigamos a formação de moléculas positrônicas em solução, ou seja, estados ligados pósitron-molécula em meio biológico. A interação de pósitrons com biomoléculas tem atraído interesse tanto do ponto de vista de processos fundamentais, quanto em aplicações médicas para a terapia do câncer. Os resultados deste trabalho apontam para uma forte competição entre o pósitron e o solvente pela interação com os sítios positivamente carregados das biomoléculas, com os quais o solvente forma ligações de hidrogênio inibindo a formação de moléculas positrônicas em solução. |
| id |
USP_d864d8035e3341615ce5e9faffcba192 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-11102024-092652 |
| network_acronym_str |
USP |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Reações positrônicas em soluçãoPositronic reactions in solutionátomos de positrôniométodos QM/MMmoléculas positrônicaspositronpósitronpositronic moleculespositronium atomQM/MM methodsPósitrons e átomos de positrônio são conhecidos por serem excelentes sondas em nanoescala amplamente utilizadas em ciência de materiais e na medicina. Essas aplicações tecnológicas envolvendo pósitrons exploram os diferentes mecanismos de aniquilação desta partícula em matéria condensada de maneira geral. Em líquidos, a injeção de pósitrons desencadeia diversos processos ao longo da termalização dos mesmos resultando em reações positrônicas como a formação de átomos de positrônio, aniquilação pick-off, aniquilação direta com moléculas do meio, auto-aniquilação, conversão de spin entre outras. Neste trabalho, estamos interessados no estudo teórico da aniquilação pick-off de átomos de positrônio em líquidos, assim como na interação do pósitron com biomoléculas em solução. O estudo de átomos de positrônio (Ps) solvatados resultou em um protocolo QM/MM para a solvatação destes átomos. A descrição da interação Ps-solvente foi possível através da definição de um campo de força para o Ps, que permitiu a realização de simulações clássicas de Monte Carlo do sistema. A estrutura do líquido e as propriedades termodinâmicas obtidas nestas simulações indicaram um comportamento hidrofóbico do Ps, análogo ao observado na solvatação de gases nobres. As configurações do líquido geradas nestas simulações possibilitaram a realização de cálculos quânticos com a metodologia Any Particle Molecular Orbital. Com isso, determinamos as energias de ionização vertical do Ps em diferentes níveis de cálculo, e encontramos os tempos de vida do mesmo a partir das contribuições dos orbitais eletrônicos ocupados. Em paralelo ao estudo do Ps em líquidos, investigamos a formação de moléculas positrônicas em solução, ou seja, estados ligados pósitron-molécula em meio biológico. A interação de pósitrons com biomoléculas tem atraído interesse tanto do ponto de vista de processos fundamentais, quanto em aplicações médicas para a terapia do câncer. Os resultados deste trabalho apontam para uma forte competição entre o pósitron e o solvente pela interação com os sítios positivamente carregados das biomoléculas, com os quais o solvente forma ligações de hidrogênio inibindo a formação de moléculas positrônicas em solução.Positrons and positronium atoms are known to be excellent nanoscale probes widely used in materials science and medicine. These positron-based technological applications explore the different annihilation mechanisms of this particle in condensed matter in general. In liquids, the injection of positrons induces several processes throughout their thermalization, resulting in positronic reactions such as forming positronium atoms, pick-off annihilation, direct annihilation with solvent molecules, self-annihilation, spin conversion, and others. In this work, we are interested in the theoretical study of the pick-off annihilation of positronium atoms in liquids and the interaction of the positron with biomolecules in solution. The study of solvated positronium (Ps) atoms resulted in a QM/MM protocol for the solvation of these atoms. The description of the Ps-solvent interaction was made possible by defining a force field for Ps, allowing classical Monte Carlo simulations of the system. The structure of the liquid and the thermodynamic properties obtained in these simulations indicated a hydrophobic behavior of Ps, analogous to that observed in the solvation of noble gases. The liquid configurations generated in these simulations allowed the performance of quantum calculations with the Any Particle Molecular Orbital methodology. We determined the vertical ionization energies of Ps at different calculation levels and the lifetimes from the contributions of the occupied electronic orbitals. In parallel to the study of Ps in liquids, we investigated the formation of positronic molecules in solution, i.e., positron-molecule bound states in biological media. The interaction of positrons with biomolecules has attracted interest both from the point of view of fundamental processes and in medical applications for cancer therapy. The results of this work point out the intense competition between the positron and the solvent for interaction with the positively charged sites of biomolecules. This interaction of solvent results in the formation of solute-solvent hydrogen bonds, which inhibits the formation of positronic molecules in solution.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPVarella, Marcio Teixeira do NascimentoRocha, Mateus Bergami2024-09-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-11102024-092652/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-10-29T22:28:02Zoai:teses.usp.br:tde-11102024-092652Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-10-29T22:28:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Reações positrônicas em solução Positronic reactions in solution |
| title |
Reações positrônicas em solução |
| spellingShingle |
Reações positrônicas em solução Rocha, Mateus Bergami átomos de positrônio métodos QM/MM moléculas positrônicas positron pósitron positronic molecules positronium atom QM/MM methods |
| title_short |
Reações positrônicas em solução |
| title_full |
Reações positrônicas em solução |
| title_fullStr |
Reações positrônicas em solução |
| title_full_unstemmed |
Reações positrônicas em solução |
| title_sort |
Reações positrônicas em solução |
| author |
Rocha, Mateus Bergami |
| author_facet |
Rocha, Mateus Bergami |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Varella, Marcio Teixeira do Nascimento |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Rocha, Mateus Bergami |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
átomos de positrônio métodos QM/MM moléculas positrônicas positron pósitron positronic molecules positronium atom QM/MM methods |
| topic |
átomos de positrônio métodos QM/MM moléculas positrônicas positron pósitron positronic molecules positronium atom QM/MM methods |
| description |
Pósitrons e átomos de positrônio são conhecidos por serem excelentes sondas em nanoescala amplamente utilizadas em ciência de materiais e na medicina. Essas aplicações tecnológicas envolvendo pósitrons exploram os diferentes mecanismos de aniquilação desta partícula em matéria condensada de maneira geral. Em líquidos, a injeção de pósitrons desencadeia diversos processos ao longo da termalização dos mesmos resultando em reações positrônicas como a formação de átomos de positrônio, aniquilação pick-off, aniquilação direta com moléculas do meio, auto-aniquilação, conversão de spin entre outras. Neste trabalho, estamos interessados no estudo teórico da aniquilação pick-off de átomos de positrônio em líquidos, assim como na interação do pósitron com biomoléculas em solução. O estudo de átomos de positrônio (Ps) solvatados resultou em um protocolo QM/MM para a solvatação destes átomos. A descrição da interação Ps-solvente foi possível através da definição de um campo de força para o Ps, que permitiu a realização de simulações clássicas de Monte Carlo do sistema. A estrutura do líquido e as propriedades termodinâmicas obtidas nestas simulações indicaram um comportamento hidrofóbico do Ps, análogo ao observado na solvatação de gases nobres. As configurações do líquido geradas nestas simulações possibilitaram a realização de cálculos quânticos com a metodologia Any Particle Molecular Orbital. Com isso, determinamos as energias de ionização vertical do Ps em diferentes níveis de cálculo, e encontramos os tempos de vida do mesmo a partir das contribuições dos orbitais eletrônicos ocupados. Em paralelo ao estudo do Ps em líquidos, investigamos a formação de moléculas positrônicas em solução, ou seja, estados ligados pósitron-molécula em meio biológico. A interação de pósitrons com biomoléculas tem atraído interesse tanto do ponto de vista de processos fundamentais, quanto em aplicações médicas para a terapia do câncer. Os resultados deste trabalho apontam para uma forte competição entre o pósitron e o solvente pela interação com os sítios positivamente carregados das biomoléculas, com os quais o solvente forma ligações de hidrogênio inibindo a formação de moléculas positrônicas em solução. |
| publishDate |
2024 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2024-09-06 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| format |
doctoralThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-11102024-092652/ |
| url |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-11102024-092652/ |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
|
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.coverage.none.fl_str_mv |
|
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
| instacron_str |
USP |
| institution |
USP |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
| repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
| _version_ |
1865491574100590592 |