Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Silva, Samuel Henrique
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59143/tde-16112023-151332/
Resumo: Displasia Cortical Focal (DCF) é um tipo de lesão cerebral que é a principal causa de Epilepsia Refratária em crianças, e o terceira maior causa em adultos, estando presente em mais de 50% dos casos infantis e 20% nos casos adultos. Pacientes com essa doença sofrem de crises epiléticas os quais os remédios não são capazes de ajudar. O tratamento clínico mais indicado nesse caso é a cirurgia. Mas para ser realizada é necessário se ter uma identificação precisa da lesão. Esse processo é bastante complexo pois a região da lesão não é bem definida para visualização em Imagens de Ressonância Magnética (IRM). Porém com os avanços computacionais sugiram várias técnicas para o auxílio na classificação de imagens médicas. Neste trabalho é estudado o uso de Algoritimos Genético (AG) com Redes Neurais Convolucionais (CNN) para classificação de imagens com a presença da DCF. O sistema baseado em CNN deve detectar e identificar a localização de DCF nas imagens. Para isso, propõese que a CNN classifique janelas retangulares das imagens com o objetivo de localizar regiões afetadas pela DCF. O tamanho das janelas e a sobreposição entre elas tem impacto direto na eficiência do sistema baseado em CNNs. Além disso, os hiperparâmetros influenciam fortemente a performance da CNN. Propõe-se aqui utilizar um algoritmo genético para: i) definir o tamanho das janelas; ii) definir a sobreposição das janelas; iii) definir alguns dos hiperparâmetros da CNN. Como resultado, o AG se mostrou bastante benéfico, otimizando a CNN de maneira a obter uma acurácia superior a 90% na classificação.
id USP_d8b5120834f193c573d5fb3a928cfa0d
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-16112023-151332
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratáriaUse of genetic algorithms and convolutional networks to classify focal cortical dysplasias in patients with refractory epilepsyAlgoritimos genéticos (AG)Convolutional neural networks (CNN)Diagnóstico auxiliado por computador (CAD)Displasia cortical focal (DCF)Focal cortical dysplasia (FCD)Genetic algorithm (GA)Imagens de ressonância magnética (IRM)Magnetic resonance images (MRI)Redes neurais convolucionais (CNN)Displasia Cortical Focal (DCF) é um tipo de lesão cerebral que é a principal causa de Epilepsia Refratária em crianças, e o terceira maior causa em adultos, estando presente em mais de 50% dos casos infantis e 20% nos casos adultos. Pacientes com essa doença sofrem de crises epiléticas os quais os remédios não são capazes de ajudar. O tratamento clínico mais indicado nesse caso é a cirurgia. Mas para ser realizada é necessário se ter uma identificação precisa da lesão. Esse processo é bastante complexo pois a região da lesão não é bem definida para visualização em Imagens de Ressonância Magnética (IRM). Porém com os avanços computacionais sugiram várias técnicas para o auxílio na classificação de imagens médicas. Neste trabalho é estudado o uso de Algoritimos Genético (AG) com Redes Neurais Convolucionais (CNN) para classificação de imagens com a presença da DCF. O sistema baseado em CNN deve detectar e identificar a localização de DCF nas imagens. Para isso, propõese que a CNN classifique janelas retangulares das imagens com o objetivo de localizar regiões afetadas pela DCF. O tamanho das janelas e a sobreposição entre elas tem impacto direto na eficiência do sistema baseado em CNNs. Além disso, os hiperparâmetros influenciam fortemente a performance da CNN. Propõe-se aqui utilizar um algoritmo genético para: i) definir o tamanho das janelas; ii) definir a sobreposição das janelas; iii) definir alguns dos hiperparâmetros da CNN. Como resultado, o AG se mostrou bastante benéfico, otimizando a CNN de maneira a obter uma acurácia superior a 90% na classificação.Focal Cortical Dysplasia (FCD) is a type of brain injury that is the main cause of Refractory Epilepsy in children, and the third largest cause in adults, present in more than 50% of childhood cases and 20% in adult cases. Patients with this inflammatory disease of epileptic seizures where the drugs are not able to help. The most appropriate clinical treatment in this case is surgery. But to be performed it is necessary if you have an accurate identification of the injury. This process is quite complex because the region of the lesion is not well defined for viewing on Magnetic Resonance Images (MRI). However, with the computational advances, have been suggested several techniques to aid in the classification of medical images. In this work, the use of Genetic Algorithm with Convolutional Neural Networks (CNN) to classify images with the presence of FCD is studied. The CNN-based system should detect and identify the location of FCD in the images. For this, it is proposed that CNN classify rectangular windows of the images in order to locate regions affected by FCD. The size of the windows and the overlap between them has a direct impact on the efficiency of the CNN-based system. In addition, hyper-parameters strongly influence CNN\'s performance. It is proposed here, using a genetic algorithm to: i) define the size of the windows; ii) define the overlap of the windows; iii) define some of CNN\'s hyper-parameters. As a result, the AG proved to be quite beneficial, optimizing the CNN in order to obtain an accuracy greater than 90% in the classification.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPTinós, RenatoSilva, Samuel Henrique2023-03-29info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59143/tde-16112023-151332/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-12-20T18:41:03Zoai:teses.usp.br:tde-16112023-151332Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-12-20T18:41:03Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária
Use of genetic algorithms and convolutional networks to classify focal cortical dysplasias in patients with refractory epilepsy
title Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária
spellingShingle Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária
Silva, Samuel Henrique
Algoritimos genéticos (AG)
Convolutional neural networks (CNN)
Diagnóstico auxiliado por computador (CAD)
Displasia cortical focal (DCF)
Focal cortical dysplasia (FCD)
Genetic algorithm (GA)
Imagens de ressonância magnética (IRM)
Magnetic resonance images (MRI)
Redes neurais convolucionais (CNN)
title_short Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária
title_full Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária
title_fullStr Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária
title_full_unstemmed Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária
title_sort Uso de algoritmos genéticos e redes convolucionais para classificação de displasias corticais focais em pacientes com epilepsia refratária
author Silva, Samuel Henrique
author_facet Silva, Samuel Henrique
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Tinós, Renato
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Samuel Henrique
dc.subject.por.fl_str_mv Algoritimos genéticos (AG)
Convolutional neural networks (CNN)
Diagnóstico auxiliado por computador (CAD)
Displasia cortical focal (DCF)
Focal cortical dysplasia (FCD)
Genetic algorithm (GA)
Imagens de ressonância magnética (IRM)
Magnetic resonance images (MRI)
Redes neurais convolucionais (CNN)
topic Algoritimos genéticos (AG)
Convolutional neural networks (CNN)
Diagnóstico auxiliado por computador (CAD)
Displasia cortical focal (DCF)
Focal cortical dysplasia (FCD)
Genetic algorithm (GA)
Imagens de ressonância magnética (IRM)
Magnetic resonance images (MRI)
Redes neurais convolucionais (CNN)
description Displasia Cortical Focal (DCF) é um tipo de lesão cerebral que é a principal causa de Epilepsia Refratária em crianças, e o terceira maior causa em adultos, estando presente em mais de 50% dos casos infantis e 20% nos casos adultos. Pacientes com essa doença sofrem de crises epiléticas os quais os remédios não são capazes de ajudar. O tratamento clínico mais indicado nesse caso é a cirurgia. Mas para ser realizada é necessário se ter uma identificação precisa da lesão. Esse processo é bastante complexo pois a região da lesão não é bem definida para visualização em Imagens de Ressonância Magnética (IRM). Porém com os avanços computacionais sugiram várias técnicas para o auxílio na classificação de imagens médicas. Neste trabalho é estudado o uso de Algoritimos Genético (AG) com Redes Neurais Convolucionais (CNN) para classificação de imagens com a presença da DCF. O sistema baseado em CNN deve detectar e identificar a localização de DCF nas imagens. Para isso, propõese que a CNN classifique janelas retangulares das imagens com o objetivo de localizar regiões afetadas pela DCF. O tamanho das janelas e a sobreposição entre elas tem impacto direto na eficiência do sistema baseado em CNNs. Além disso, os hiperparâmetros influenciam fortemente a performance da CNN. Propõe-se aqui utilizar um algoritmo genético para: i) definir o tamanho das janelas; ii) definir a sobreposição das janelas; iii) definir alguns dos hiperparâmetros da CNN. Como resultado, o AG se mostrou bastante benéfico, otimizando a CNN de maneira a obter uma acurácia superior a 90% na classificação.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-03-29
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59143/tde-16112023-151332/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59143/tde-16112023-151332/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815258229705277440