Comparação entre transcritos rítmicos de folhas de cana-de-açúcar (Saccharum híbrido spp.) coletadas durante o inverno (4 meses) e verão (9 meses)
| Ano de defesa: | 2022 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
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Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-10042025-153307/ |
Resumo: | O ambiente natural está submetido a mudanças cíclicas de luz e temperatura. Essas mudanças podem ser diárias, como o dia e a noite, ou anuais, como os dias mais longos no verão e noites mais longas no inverno. O relógio circadiano é o mecanismo molecular autossustentado na planta que permite a antecipação desses eventos cíclicos e o ajuste da fisiologia, metabolismo e reprodução da planta para que ocorram durante o período mais adequado do dia, ou do ano, de forma otimizada. Consequentemente, os genes regulados pelo relógio circadiano possuem uma transcrição rítmica, com picos em horários específicos do dia. Mesmo que o relógio circadiano seja um mecanismo que permita a planta interpretar as pistas ambientais corretas, mesmo com muitos ruídos, a maioria dos estudos do relógio circadiano ocorrem em condições controladas, como em constante luz e temperatura, uma vez que o relógio circadiano mantém sua ritmicidade mesmo na ausência de pistas ambientais. Este trabalho visa estudar o padrão de transcrição de folhas +1 de canade-açúcar com 4 meses cultivadas em campo e coletadas durante o inverno (CI) e compará-lo com o padrão de transcrição de folhas +1 de cana-de-açúcar com 9 meses coletadas durante o verão (CV). Visto que o campo de coleta se encontra em Araras - SP, um local com clima subtropical de invernos seco (Cwa), espera-se um padrão de transcrição no inverno, que possui noites mais longas que o dia, baixas médias de temperatura e baixa pluviosidade, diferente do verão, que possui dias mais longos que a noite, altas médias de temperatura e alta pluviosidade. O padrão de transcrição foi investigado com o uso de oligoarrays, e concluiu-se que CV apresenta mais transcritos expressos e rítmicos que CI. Foi possível identificar também a tendência de haver uma maior proporção de transcritos circadianos em CI e uma maior proporção de transcritos diurnos em CV. Quanto ao perfil de expressão dos transcritos no decorrer do dia, transcritos expressos em CV tendem a ter pico mais largos e terem ápice de expressão mais tarde que em CI. A amplitude dos transcritos não se difere com as coletas. Os resultados obtidos e discutidos auxiliam na compreensão de como a transcrição diferenciada da cana-de-açúcar de acordo com a estação do ano reflete sua adaptação para melhor se beneficiar das condições ambientais. |
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Comparação entre transcritos rítmicos de folhas de cana-de-açúcar (Saccharum híbrido spp.) coletadas durante o inverno (4 meses) e verão (9 meses)Comparison between rhythmic transcripts in sugarcane (Saccharum hybrid spp.) harvested on winter (4-month sugarcane) and summer (9-month sugarcane)Cana-de-açúcarCircadian clockExpressão sazonalRelógio circadianoSeasonal expressionSugarcaneTranscriptomaTranscriptomeO ambiente natural está submetido a mudanças cíclicas de luz e temperatura. Essas mudanças podem ser diárias, como o dia e a noite, ou anuais, como os dias mais longos no verão e noites mais longas no inverno. O relógio circadiano é o mecanismo molecular autossustentado na planta que permite a antecipação desses eventos cíclicos e o ajuste da fisiologia, metabolismo e reprodução da planta para que ocorram durante o período mais adequado do dia, ou do ano, de forma otimizada. Consequentemente, os genes regulados pelo relógio circadiano possuem uma transcrição rítmica, com picos em horários específicos do dia. Mesmo que o relógio circadiano seja um mecanismo que permita a planta interpretar as pistas ambientais corretas, mesmo com muitos ruídos, a maioria dos estudos do relógio circadiano ocorrem em condições controladas, como em constante luz e temperatura, uma vez que o relógio circadiano mantém sua ritmicidade mesmo na ausência de pistas ambientais. Este trabalho visa estudar o padrão de transcrição de folhas +1 de canade-açúcar com 4 meses cultivadas em campo e coletadas durante o inverno (CI) e compará-lo com o padrão de transcrição de folhas +1 de cana-de-açúcar com 9 meses coletadas durante o verão (CV). Visto que o campo de coleta se encontra em Araras - SP, um local com clima subtropical de invernos seco (Cwa), espera-se um padrão de transcrição no inverno, que possui noites mais longas que o dia, baixas médias de temperatura e baixa pluviosidade, diferente do verão, que possui dias mais longos que a noite, altas médias de temperatura e alta pluviosidade. O padrão de transcrição foi investigado com o uso de oligoarrays, e concluiu-se que CV apresenta mais transcritos expressos e rítmicos que CI. Foi possível identificar também a tendência de haver uma maior proporção de transcritos circadianos em CI e uma maior proporção de transcritos diurnos em CV. Quanto ao perfil de expressão dos transcritos no decorrer do dia, transcritos expressos em CV tendem a ter pico mais largos e terem ápice de expressão mais tarde que em CI. A amplitude dos transcritos não se difere com as coletas. Os resultados obtidos e discutidos auxiliam na compreensão de como a transcrição diferenciada da cana-de-açúcar de acordo com a estação do ano reflete sua adaptação para melhor se beneficiar das condições ambientais.The natural environment is under cyclic changes in light and temperature. These changes may be daily, such as the day and the night, or annual, such as the longer days in summer and the long nights in winter. The circadian clock is a self-sustained molecular mechanism in plants that anticipates these environmental events, fitting the plants physiology, metabolism and reproduction to the best period of the day or the year. Consequently, genes regulated by the circadian clock have rhythmic transcription, with peaks at specific times of the day. Even though the circadian clock is a mechanism in which plants perceive correct environmental cues mixed with noise, most studies about the circadian clock are in controlled conditions. Moreover, some experiments are in constant light and temperature since the circadian clock can maintain its rhythm without environmental cues. This work aims to study the transcription patterns in +1 leaves of 4-month sugarcane (CI) cultivated on the field and harvested in winter and compare it to the transcription pattern of +1 leaves of 9- month sugarcane harvested in summer (CV). Since the field is in Araras - SP, a local subtropical climate with dry winter (Cwa), the transcription pattern in winter (with nights more prolonged than the days, low average temperature and low rain rate) is expected to be different than in summer (with days longer than nights, high average temperature and high rain rate). Oligoarrays were used to investigate the transcription patterns, and the first conclusion was that CV has more expressed and rhythmic transcripts than CI.CI has a higher tendency to have a more significant proportion of circadian transcripts, and CV has a more considerable proportion of diurnal transcripts. In addition, CV has a more prominent peak of expression than CI and a later phase. The amplitude has no difference between the harvests. The obtained and discussed results help to understand how seasonal transcription differs from each other in sugarcane and shows how plants adapt to better fit into the environmental conditions.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPHotta, Carlos TakeshiDourado, Maira Marins2022-12-12info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-10042025-153307/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-04-16T12:43:02Zoai:teses.usp.br:tde-10042025-153307Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-04-16T12:43:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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O ambiente natural está submetido a mudanças cíclicas de luz e temperatura. Essas mudanças podem ser diárias, como o dia e a noite, ou anuais, como os dias mais longos no verão e noites mais longas no inverno. O relógio circadiano é o mecanismo molecular autossustentado na planta que permite a antecipação desses eventos cíclicos e o ajuste da fisiologia, metabolismo e reprodução da planta para que ocorram durante o período mais adequado do dia, ou do ano, de forma otimizada. Consequentemente, os genes regulados pelo relógio circadiano possuem uma transcrição rítmica, com picos em horários específicos do dia. Mesmo que o relógio circadiano seja um mecanismo que permita a planta interpretar as pistas ambientais corretas, mesmo com muitos ruídos, a maioria dos estudos do relógio circadiano ocorrem em condições controladas, como em constante luz e temperatura, uma vez que o relógio circadiano mantém sua ritmicidade mesmo na ausência de pistas ambientais. Este trabalho visa estudar o padrão de transcrição de folhas +1 de canade-açúcar com 4 meses cultivadas em campo e coletadas durante o inverno (CI) e compará-lo com o padrão de transcrição de folhas +1 de cana-de-açúcar com 9 meses coletadas durante o verão (CV). Visto que o campo de coleta se encontra em Araras - SP, um local com clima subtropical de invernos seco (Cwa), espera-se um padrão de transcrição no inverno, que possui noites mais longas que o dia, baixas médias de temperatura e baixa pluviosidade, diferente do verão, que possui dias mais longos que a noite, altas médias de temperatura e alta pluviosidade. O padrão de transcrição foi investigado com o uso de oligoarrays, e concluiu-se que CV apresenta mais transcritos expressos e rítmicos que CI. Foi possível identificar também a tendência de haver uma maior proporção de transcritos circadianos em CI e uma maior proporção de transcritos diurnos em CV. Quanto ao perfil de expressão dos transcritos no decorrer do dia, transcritos expressos em CV tendem a ter pico mais largos e terem ápice de expressão mais tarde que em CI. A amplitude dos transcritos não se difere com as coletas. Os resultados obtidos e discutidos auxiliam na compreensão de como a transcrição diferenciada da cana-de-açúcar de acordo com a estação do ano reflete sua adaptação para melhor se beneficiar das condições ambientais. |
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