Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2015
Autor(a) principal: Colletta, Gabriel Dalla
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Barcoding
Identificação
Identify
Levantamento
Survey
Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-23092015-082200/
Resumo: O principal objetivo deste trabalho, foi avaliar a eficiêcia do rbcL na identificação das espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo. Para isso, foi construído um banco de dados local de sequências derbcL de 149 espécies circunscritas em 64 famílias e realizado o teste de identificação. Os resultados de porcentagem de correta identificação variaram de 42,8 - 100% quando ordenados por score até 88 - 100% quando ordenados pela porcentagem de identidade, ficando evidente a importância na maneira de ordenar os resultados. Foi gerada também uma lista para as espécies arbóreas ocorrentes na Floresta Estacional Semidecidual no estado de São Paulo, que contou com 716 espécies incluídas em 80 famílias.
id USP_e2e9ebb6106247684f56aff1d14ed6a0
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-23092015-082200
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São PauloIdentifying Semideciduos Seasonal Forest trees species of São Paulo state through rbcLBarcodingBarcodingIdentificaçãoIdentifyLevantamentoSurveyO principal objetivo deste trabalho, foi avaliar a eficiêcia do rbcL na identificação das espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo. Para isso, foi construído um banco de dados local de sequências derbcL de 149 espécies circunscritas em 64 famílias e realizado o teste de identificação. Os resultados de porcentagem de correta identificação variaram de 42,8 - 100% quando ordenados por score até 88 - 100% quando ordenados pela porcentagem de identidade, ficando evidente a importância na maneira de ordenar os resultados. Foi gerada também uma lista para as espécies arbóreas ocorrentes na Floresta Estacional Semidecidual no estado de São Paulo, que contou com 716 espécies incluídas em 80 famílias.The main goal of this work was to evaluate the efficiency of the molecular marker rbcL in the identification of native tree species of Semideciduous Seasonal Forest, in São Paulo, Brazil. A local database of rbcL sequences from 149 species, comprising 64 families, was assembled to carry identification tests. Percentage of correct identification (PCI) ranged from 42.8 to 100% when the score criterion of identification was used and from 88 to 100% when the results were order by percentage of identity. This evidences the importance of the method for ordering results. A list of 716 tree species of Semideciduous Seasonal Forest in the São Paulo state, comprising 80 families, was also a product of this work.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSouza, Vinicius CastroColletta, Gabriel Dalla2015-05-11info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-23092015-082200/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2016-07-28T16:11:58Zoai:teses.usp.br:tde-23092015-082200Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212016-07-28T16:11:58Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo
Identifying Semideciduos Seasonal Forest trees species of São Paulo state through rbcL
title Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo
spellingShingle Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo
Colletta, Gabriel Dalla
Barcoding
Barcoding
Identificação
Identify
Levantamento
Survey
title_short Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo
title_full Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo
title_fullStr Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo
title_full_unstemmed Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo
title_sort Uso do rbcL na identificação de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo
author Colletta, Gabriel Dalla
author_facet Colletta, Gabriel Dalla
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Souza, Vinicius Castro
dc.contributor.author.fl_str_mv Colletta, Gabriel Dalla
dc.subject.por.fl_str_mv Barcoding
Barcoding
Identificação
Identify
Levantamento
Survey
topic Barcoding
Barcoding
Identificação
Identify
Levantamento
Survey
description O principal objetivo deste trabalho, foi avaliar a eficiêcia do rbcL na identificação das espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual do estado de São Paulo. Para isso, foi construído um banco de dados local de sequências derbcL de 149 espécies circunscritas em 64 famílias e realizado o teste de identificação. Os resultados de porcentagem de correta identificação variaram de 42,8 - 100% quando ordenados por score até 88 - 100% quando ordenados pela porcentagem de identidade, ficando evidente a importância na maneira de ordenar os resultados. Foi gerada também uma lista para as espécies arbóreas ocorrentes na Floresta Estacional Semidecidual no estado de São Paulo, que contou com 716 espécies incluídas em 80 famílias.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-05-11
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-23092015-082200/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-23092015-082200/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815258475933990912

Registros relacionados