Uso de algoritmos de inteligência artificial para triagem de tomografias computadorizadas de pacientes portadores de carcinoma hepatocelular

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Rocha, Bruno Aragão
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5151/tde-25022025-140523/
Resumo: Introdução: o carcinoma hepatocelular (CHC) é um tumor muito relevante para a saúde pública. A tomografia computadorizada (TC) de abdome com protocolo multifásico de contraste é crucial para o diagnóstico de CHC. Avanços em machine learning (ML), em especial deep learning (DL) com convolutional neural networks (CNN), tem ganhado espaço na literatura médica. Apesar desses avanços, a aplicação dessas técnicas no diagnóstico do CHC é inicial, enfrentando desafios como inconsistências nos metadados DICOM, falta de descrição precisa de fluxos de trabalho e poucos estudos de DL em TC de abdome para triagem de CHC. Objetivos: desenvolver um algoritmo de CNN para classificar automaticamente a fase do contraste em TC de abdome a partir da imagem, sem depender dos metadados DICOM. Descrever a criação e implantação de um banco de dados estruturado em um hospital universitário para armazenar exames de TC com informações clínicas e de imagem. Treinar e avaliar a acurácia de algoritmos de CNN para predizer alterações morfológicas hepáticas e a presença de CHC. Métodos: este estudo inclui três artigos. Artigo 1: estudo retrospectivo com 396 TCs de abdome (80% para treino e 20% para teste), com protocolo de contraste multifásico. Uma CNN foi treinada para classificar a fase de contraste baseada na imagem. Artigo 2: estudo descritivo qualitativo que detalha a criação e implantação de um banco de dados estruturado em um hospital universitário para armazenar exames de TC de abdome com informações relevantes para o treinamento de algoritmos de inteligência artificial. Artigo 3: estudo retrospectivo com dois experimentos. O experimento 1 envolveu 424 TCs para detecção de alterações morfológicas hepáticas e o experimento 2, 145 TCs de treino e 300 TCs de teste para triagem de CHC, usando a arquitetura de CNN YOLO V8 para detecção de nódulos na fase arterial. Resultados: Artigo 1: A CNN alcançou 94,6% de acurácia por fatia, 98% por série e 100% no exame completo para classificar a fase do contraste. Artigo 2: foi criado um banco de dados relacional integrado à infraestrutura de tecnologia da informação do hospital, com um dashboard gerencial e filtros para seleção de dados. Artigo 3: no experimento 1, a CNN teve 86,2% de precisão, 85,9% de sensibilidade e 87% de especificidade; no experimento 2, o modelo YOLO V8 apresentou 80,9% de sensibilidade, 74,9% de especificidade, 77% de precisão, 57,6% de valor preditivo positivo, 90,3% de valor preditivo negativo e 67,4% de F1 score para triagem de CHC. Discussão e Conclusão: esse compilado de artigos contribui para a evolução do conhecimento científico na aplicação de técnicas de aprendizado profundo em exames de TC de abdome com foco na triagem de CHC. O primeiro artigo mostra a viabilidade de usar CNNs para identificar a fase do exame a partir da imagem, superando inconsistências nos metadados DICOM. O segundo artigo detalha a criação de uma infraestrutura de banco de dados para treinamento de algoritmos em um hospital universitário, fornecendo subsídios para outros grupos replicarem a arquitetura. O terceiro artigo demonstra a viabilidade técnica de algoritmos de DL na triagem de alterações morfológicas hepáticas e presença de CHC no exame, embora ressalte a necessidade de dados mais diversos para aprimorar os modelos. Esses achados evidenciam o potencial dos modelos de DL para melhorar o fluxo diagnóstico e potencialmente trazer benefícios ao cuidado dos pacientes
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spelling Uso de algoritmos de inteligência artificial para triagem de tomografias computadorizadas de pacientes portadores de carcinoma hepatocelularUse of artificial intelligence algorithms for screening computed tomography scans of patients with hepatocellular carcinomaAprendizado de máquinaAprendizado profundoArtificial intelligenceBanco de dadosCarcinoma hepatocelularComputed tomographyDatabaseDeep learningHepatocellular carcinomaInteligência artificialMachine learningTomografia computadorizadaIntrodução: o carcinoma hepatocelular (CHC) é um tumor muito relevante para a saúde pública. A tomografia computadorizada (TC) de abdome com protocolo multifásico de contraste é crucial para o diagnóstico de CHC. Avanços em machine learning (ML), em especial deep learning (DL) com convolutional neural networks (CNN), tem ganhado espaço na literatura médica. Apesar desses avanços, a aplicação dessas técnicas no diagnóstico do CHC é inicial, enfrentando desafios como inconsistências nos metadados DICOM, falta de descrição precisa de fluxos de trabalho e poucos estudos de DL em TC de abdome para triagem de CHC. Objetivos: desenvolver um algoritmo de CNN para classificar automaticamente a fase do contraste em TC de abdome a partir da imagem, sem depender dos metadados DICOM. Descrever a criação e implantação de um banco de dados estruturado em um hospital universitário para armazenar exames de TC com informações clínicas e de imagem. Treinar e avaliar a acurácia de algoritmos de CNN para predizer alterações morfológicas hepáticas e a presença de CHC. Métodos: este estudo inclui três artigos. Artigo 1: estudo retrospectivo com 396 TCs de abdome (80% para treino e 20% para teste), com protocolo de contraste multifásico. Uma CNN foi treinada para classificar a fase de contraste baseada na imagem. Artigo 2: estudo descritivo qualitativo que detalha a criação e implantação de um banco de dados estruturado em um hospital universitário para armazenar exames de TC de abdome com informações relevantes para o treinamento de algoritmos de inteligência artificial. Artigo 3: estudo retrospectivo com dois experimentos. O experimento 1 envolveu 424 TCs para detecção de alterações morfológicas hepáticas e o experimento 2, 145 TCs de treino e 300 TCs de teste para triagem de CHC, usando a arquitetura de CNN YOLO V8 para detecção de nódulos na fase arterial. Resultados: Artigo 1: A CNN alcançou 94,6% de acurácia por fatia, 98% por série e 100% no exame completo para classificar a fase do contraste. Artigo 2: foi criado um banco de dados relacional integrado à infraestrutura de tecnologia da informação do hospital, com um dashboard gerencial e filtros para seleção de dados. Artigo 3: no experimento 1, a CNN teve 86,2% de precisão, 85,9% de sensibilidade e 87% de especificidade; no experimento 2, o modelo YOLO V8 apresentou 80,9% de sensibilidade, 74,9% de especificidade, 77% de precisão, 57,6% de valor preditivo positivo, 90,3% de valor preditivo negativo e 67,4% de F1 score para triagem de CHC. Discussão e Conclusão: esse compilado de artigos contribui para a evolução do conhecimento científico na aplicação de técnicas de aprendizado profundo em exames de TC de abdome com foco na triagem de CHC. O primeiro artigo mostra a viabilidade de usar CNNs para identificar a fase do exame a partir da imagem, superando inconsistências nos metadados DICOM. O segundo artigo detalha a criação de uma infraestrutura de banco de dados para treinamento de algoritmos em um hospital universitário, fornecendo subsídios para outros grupos replicarem a arquitetura. O terceiro artigo demonstra a viabilidade técnica de algoritmos de DL na triagem de alterações morfológicas hepáticas e presença de CHC no exame, embora ressalte a necessidade de dados mais diversos para aprimorar os modelos. Esses achados evidenciam o potencial dos modelos de DL para melhorar o fluxo diagnóstico e potencialmente trazer benefícios ao cuidado dos pacientesIntroduction: hepatocellular carcinoma (HCC) is a highly significant tumor for public health. Abdominal computed tomography (CT) with a multiphasic contrast protocol is crucial for HCC diagnosis. Advances in machine learning (ML), particularly deep learning (DL) with convolutional neural networks (CNN), have gained traction in medical literature. Despite these advancements, the application of these techniques in HCC diagnosis is still in its infancy, facing challenges such as inconsistencies in DICOM metadata, lack of precise workflow descriptions, and few studies on DL in abdominal CT for HCC screening. Objectives: to develop a CNN algorithm to automatically classify the contrast phase in abdominal CT from the image, without relying on DICOM metadata. To describe the creation and implementation of a structured database in a university hospital to store CT scans with clinical and imaging information. To train and evaluate the accuracy of CNN algorithms to predict hepatic morphological changes and the presence of HCC. Methods: this study includes three articles. Article 1: A retrospective study with 396 abdominal CTs (80% for training and 20% for testing) with a multiphasic contrast protocol. A CNN was trained to classify the contrast phase based on the image. Article 2: A qualitative descriptive study detailing the creation and implementation of a structured database in a university hospital to store abdominal CT scans with relevant information for training artificial intelligence algorithms. Article 3: A retrospective study with two experiments. Experiment 1 involved 424 CTs for detecting hepatic morphological changes, and Experiment 2, 145 CTs for training and 300 CTs for testing HCC screening, using the YOLO V8 CNN architecture for nodule detection in the arterial phase. Results: article 1: the CNN achieved 94.6% accuracy per slice, 98% per series, and 100% for the complete exam in classifying the contrast phase. Article 2: a relational database was created, integrated into the hospital\'s IT infrastructure, with a management dashboard and filters for data selection. Article 3: in Experiment 1, the CNN achieved 86.2% precision, 85.9% sensitivity, and 87% specificity; in Experiment 2, the YOLO V8 model achieved 80.9% sensitivity, 74.9% specificity, 77% precision, 57.6% positive predictive value, 90.3% negative predictive value, and 67.4% F1 score for HCC screening. Discussion and Conclusion: this compilation of articles contributes to the advancement of scientific knowledge in the application of DL techniques in abdominal CT scans focusing on HCC screening. The first article demonstrates the feasibility of using CNNs to identify the exam phase from the image, overcoming inconsistencies in DICOM metadata. The second article details the creation of a database infrastructure for algorithm training in a university hospital, providing a framework for other groups to replicate the architecture. The third article demonstrates the technical feasibility of DL algorithms in screening hepatic morphological changes and HCC presence in CT scans, highlighting the need for more diverse data to improve models. These findings highlight the potential of DL models to enhance diagnostic workflows and potentially bring benefits to patient careBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLeite, Claudia da CostaNomura, Cesar HigaRocha, Bruno Aragão2024-10-03info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5151/tde-25022025-140523/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-03-07T15:29:02Zoai:teses.usp.br:tde-25022025-140523Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-03-07T15:29:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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