Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding
| Ano de defesa: | 2025 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-13052025-160240/ |
Resumo: | O uso de DNA para identificação molecular tem crescido ao longo dos anos, facilitando a delimitação de organismos em níveis taxonômicos mais refinados. Em Chironomidae, a identificação morfológica de espécies geralmente envolve a criação de larvas e sua associação com machos adultos, um processo demorado e nem sempre eficaz devido à semelhança morfológica mesmo em adultos. Uma ferramenta promissora para integrar a taxonomia é o DNA barcoding, utilizado neste estudo para explorar a diversidade de Ablabesmyia na América do Sul e propor um modelo de delimitação de espécies para gêneros de Tanypodinae. Espécimes foram coletados na América do Sul, identificados morfologicamente e sequenciados com o gene mitocondrial COI, alinhados e montados em sequências contínuas. No total, foram analisadas 877 sequências de 239 localidades em 19 países, das quais 92 foram geradas nesta pesquisa e o restante obtido no banco de dados Barcode of Life Data Systems (BOLD). Diferentes métodos de delimitação de espécies com abordagens filogenéticas variadas foram aplicados, incluindo três métodos baseados em distância (ABGD, ASAP e BIN) e dois baseados em árvore (PTP e GMYC). Os resultados indicaram que o método GMYC como o mais apropriado para a delimitação de espécies de Ablabesmyia no presente conjunto de dados, resultando na identificação de 73 espécies putativas, sendo 31 delas pertencentes à região Neotropical, especificamente da América do Sul. Além disso, os resultados apontam uma maior riqueza de espécies na região Neotropical em comparação com as regiões Paleártica e Oriental. Neste estudo, também foi observado diferenças potenciais na composição de espécies de Ablabesmyia entre as regiões Neotropical e Neártica, que, por sua proximidade, poderiam compartilhar faunas semelhantes. No entanto, os resultados destacaram altos níveis de endemismo e riqueza de espécies na região Neotropical, confirmando a hipótese de que a composição da fauna de Ablabesmyia na América do Sul apresenta diferenças substanciais em relação às regiões vizinhas. Por outro lado, as regiões Neártica e Paleártica demonstraram maior semelhança em sua composição, evidenciada pelo compartilhamento de algumas espécies de Ablabesmyia entre essas áreas. |
| id |
USP_f0e03712608ee40e490742ff50808b7e |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-13052025-160240 |
| network_acronym_str |
USP |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcodingExploring the species diversity of Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) in the New World through DNA barcodingAblabesmyiaAblabesmyiaBiodiversidadeBiodiversityChironomidaeChironomidaeDelimitação de espéciesDNA barcodeDNA barcodeSpecies delimitationO uso de DNA para identificação molecular tem crescido ao longo dos anos, facilitando a delimitação de organismos em níveis taxonômicos mais refinados. Em Chironomidae, a identificação morfológica de espécies geralmente envolve a criação de larvas e sua associação com machos adultos, um processo demorado e nem sempre eficaz devido à semelhança morfológica mesmo em adultos. Uma ferramenta promissora para integrar a taxonomia é o DNA barcoding, utilizado neste estudo para explorar a diversidade de Ablabesmyia na América do Sul e propor um modelo de delimitação de espécies para gêneros de Tanypodinae. Espécimes foram coletados na América do Sul, identificados morfologicamente e sequenciados com o gene mitocondrial COI, alinhados e montados em sequências contínuas. No total, foram analisadas 877 sequências de 239 localidades em 19 países, das quais 92 foram geradas nesta pesquisa e o restante obtido no banco de dados Barcode of Life Data Systems (BOLD). Diferentes métodos de delimitação de espécies com abordagens filogenéticas variadas foram aplicados, incluindo três métodos baseados em distância (ABGD, ASAP e BIN) e dois baseados em árvore (PTP e GMYC). Os resultados indicaram que o método GMYC como o mais apropriado para a delimitação de espécies de Ablabesmyia no presente conjunto de dados, resultando na identificação de 73 espécies putativas, sendo 31 delas pertencentes à região Neotropical, especificamente da América do Sul. Além disso, os resultados apontam uma maior riqueza de espécies na região Neotropical em comparação com as regiões Paleártica e Oriental. Neste estudo, também foi observado diferenças potenciais na composição de espécies de Ablabesmyia entre as regiões Neotropical e Neártica, que, por sua proximidade, poderiam compartilhar faunas semelhantes. No entanto, os resultados destacaram altos níveis de endemismo e riqueza de espécies na região Neotropical, confirmando a hipótese de que a composição da fauna de Ablabesmyia na América do Sul apresenta diferenças substanciais em relação às regiões vizinhas. Por outro lado, as regiões Neártica e Paleártica demonstraram maior semelhança em sua composição, evidenciada pelo compartilhamento de algumas espécies de Ablabesmyia entre essas áreas.The use of DNA for molecular identification has grown over the years, facilitating the delimitation of organisms at more refined taxonomic levels. In Chironomidae, morphological species identification often involves rearing larvae and associating them with adult males, a time-consuming and not always effective process due to morphological similarities even in adults. A promising tool to integrate taxonomy is DNA barcoding, which was used in this study to explore the diversity of Ablabesmyia in South America and propose a species delimitation model for Tanypodinae genera. Specimens were collected in South America, morphologically identified, and sequenced using the mitochondrial COI gene, which was aligned and assembled into continuous sequences. In total, 877 sequences from 239 localities in 19 countries were analyzed, 92 of which were generated in this study, with the remainder obtained from the Barcode of Life Data Systems (BOLD) database. Different species delimitation methods using varied phylogenetic approaches were applied, including three distance-based methods (ABGD, ASAP, and BIN) and two tree-based methods (PTP and GMYC). The results indicated that the GMYC method was the most appropriate for delimiting Ablabesmyia species in the present dataset, identifying 73 putative species, 31 of which were from the Neotropical region, specifically South America. Furthermore, the results revealed greater species richness in the Neotropical region compared to the Palearctic and Oriental regions. This study also observed potential differences in the species composition of Ablabesmyia between the Neotropical and Nearctic regions, which, due to their proximity, might be expected to share similar faunas. However, the results highlighted high levels of endemism and species richness in the Neotropical region, supporting the hypothesis that the Ablabesmyia fauna composition in South America differs substantially from neighboring regions. On the other hand, the Nearctic and Palearctic regions demonstrated greater similarity in their composition, as evidenced by the sharing of some Ablabesmyia species between these areas.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSilva, Fabio Laurindo daMorelli, Ricardo Miranda2025-03-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-13052025-160240/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-05-14T09:01:01Zoai:teses.usp.br:tde-13052025-160240Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-05-14T09:01:01Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding Exploring the species diversity of Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) in the New World through DNA barcoding |
| title |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding |
| spellingShingle |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding Morelli, Ricardo Miranda Ablabesmyia Ablabesmyia Biodiversidade Biodiversity Chironomidae Chironomidae Delimitação de espécies DNA barcode DNA barcode Species delimitation |
| title_short |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding |
| title_full |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding |
| title_fullStr |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding |
| title_full_unstemmed |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding |
| title_sort |
Explorando a diversidade de espécies de Ablabesmyia Johannsen, 1905 (Diptera, Chironomidae, Tanypodinae) no Novo Mundo, por meio de DNA barcoding |
| author |
Morelli, Ricardo Miranda |
| author_facet |
Morelli, Ricardo Miranda |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Silva, Fabio Laurindo da |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Morelli, Ricardo Miranda |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Ablabesmyia Ablabesmyia Biodiversidade Biodiversity Chironomidae Chironomidae Delimitação de espécies DNA barcode DNA barcode Species delimitation |
| topic |
Ablabesmyia Ablabesmyia Biodiversidade Biodiversity Chironomidae Chironomidae Delimitação de espécies DNA barcode DNA barcode Species delimitation |
| description |
O uso de DNA para identificação molecular tem crescido ao longo dos anos, facilitando a delimitação de organismos em níveis taxonômicos mais refinados. Em Chironomidae, a identificação morfológica de espécies geralmente envolve a criação de larvas e sua associação com machos adultos, um processo demorado e nem sempre eficaz devido à semelhança morfológica mesmo em adultos. Uma ferramenta promissora para integrar a taxonomia é o DNA barcoding, utilizado neste estudo para explorar a diversidade de Ablabesmyia na América do Sul e propor um modelo de delimitação de espécies para gêneros de Tanypodinae. Espécimes foram coletados na América do Sul, identificados morfologicamente e sequenciados com o gene mitocondrial COI, alinhados e montados em sequências contínuas. No total, foram analisadas 877 sequências de 239 localidades em 19 países, das quais 92 foram geradas nesta pesquisa e o restante obtido no banco de dados Barcode of Life Data Systems (BOLD). Diferentes métodos de delimitação de espécies com abordagens filogenéticas variadas foram aplicados, incluindo três métodos baseados em distância (ABGD, ASAP e BIN) e dois baseados em árvore (PTP e GMYC). Os resultados indicaram que o método GMYC como o mais apropriado para a delimitação de espécies de Ablabesmyia no presente conjunto de dados, resultando na identificação de 73 espécies putativas, sendo 31 delas pertencentes à região Neotropical, especificamente da América do Sul. Além disso, os resultados apontam uma maior riqueza de espécies na região Neotropical em comparação com as regiões Paleártica e Oriental. Neste estudo, também foi observado diferenças potenciais na composição de espécies de Ablabesmyia entre as regiões Neotropical e Neártica, que, por sua proximidade, poderiam compartilhar faunas semelhantes. No entanto, os resultados destacaram altos níveis de endemismo e riqueza de espécies na região Neotropical, confirmando a hipótese de que a composição da fauna de Ablabesmyia na América do Sul apresenta diferenças substanciais em relação às regiões vizinhas. Por outro lado, as regiões Neártica e Paleártica demonstraram maior semelhança em sua composição, evidenciada pelo compartilhamento de algumas espécies de Ablabesmyia entre essas áreas. |
| publishDate |
2025 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2025-03-10 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-13052025-160240/ |
| url |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-13052025-160240/ |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
|
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.coverage.none.fl_str_mv |
|
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
| instacron_str |
USP |
| institution |
USP |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
| repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
| _version_ |
1865492284410167296 |