Desenvolvimento e validação de uma nova escala diagramática para estimar severidade de ferrugem asiática da soja

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2017
Autor(a) principal: Franceschi, Vinicius Tadeu
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Tecnológica Federal do Paraná
Dois Vizinhos
Brasil
Programa de Pós-Graduação em Agroecossistemas
UTFPR
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/24742
Resumo: Asian Soybean Rust (ASR), caused by the fungus Phakopsora pachyrhizi is the most important disease of soybean crop. The objective of this study was to develop a new Standard Area Diagrams Set (SADs) to evaluate ASR severity. The proposed SADs was composed of real and colored images and has 10 distinct levels of severity, distributed with a linear distribution (0.2, 3, 5, 10, 25, 40, 55, 70 and 84%). For the validation of the new SADs, 40 raters with no experience in the quantification of diseases were used and later were divided into two groups with 20 raters each. The validation consisted of two steps. In the first, the raters of the two groups estimated the severity of 50 leaves with different levels of severity without the use of SADs. In the second, using the same 50 leaves, one group estimated the severity values using the SADs published (Godoy et al. 2006) and another group made the estimates using the SADs proposed in this study. Lin's concordance correlation analysis was used to verify the accuracy and precision of the estimates. When the published SADs was used, only scale bias (v) and location bias (u) values were improved. However, when the proposed SADs was used, the values of scale bias (v), coefficient of bias (Cb), correlation coefficient (r) and Lin's concordance correlation coefficient (ρc) were improved. This shows that the proposed SADs provided more accurate and precise severity estimates. The reliability of the estimates was verified using the intra-class correlation coefficient (ρ) and mean inter-rater coefficient of determination (R²). It was verified that with and without the use of published SADs the values of ρ and R² did not differ and with the use of the proposed SADs there was gain in reliability. The SADs proposed in this study improved the accuracy, precision and reliability of the evaluations.
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In the first, the raters of the two groups estimated the severity of 50 leaves with different levels of severity without the use of SADs. In the second, using the same 50 leaves, one group estimated the severity values using the SADs published (Godoy et al. 2006) and another group made the estimates using the SADs proposed in this study. Lin's concordance correlation analysis was used to verify the accuracy and precision of the estimates. When the published SADs was used, only scale bias (v) and location bias (u) values were improved. However, when the proposed SADs was used, the values of scale bias (v), coefficient of bias (Cb), correlation coefficient (r) and Lin's concordance correlation coefficient (ρc) were improved. This shows that the proposed SADs provided more accurate and precise severity estimates. The reliability of the estimates was verified using the intra-class correlation coefficient (ρ) and mean inter-rater coefficient of determination (R²). It was verified that with and without the use of published SADs the values of ρ and R² did not differ and with the use of the proposed SADs there was gain in reliability. The SADs proposed in this study improved the accuracy, precision and reliability of the evaluations.A Ferrugem Asiática da Soja (FAS), causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi é a doença mais importante da cultura da soja. Objetivou-se neste trabalho desenvolver uma nova escala diagramática para avaliar severidade de FAS. A escala proposta foi constituída por imagens reais e coloridas e possui 10 níveis de severidade distintos, distribuídos com um padrão linear (0.2; 3; 5; 10; 25; 40; 55; 70 e 84%). Para a avaliação da nova escala foram utilizados 40 avaliadores sem experiência na quantificação de doenças e posteriormente foram divididos em dois grupos com 20 avaliadores cada. A validação consistiu de duas etapas. Na primeira, os avaliadores dos dois grupos estimaram a severidade de 50 folhas com diferentes níveis de severidade sem o uso de escalas diagramáticas. Na segunda, utilizando as mesmas 50 folhas, um grupo estimou os valores de severidades usando a escala publicada por Godoy et al. (2006) e outro grupo fez as estimativas utilizando a escala proposta neste estudo. A análise de correlação concordante de Lins foi usada para verificar a acurácia e precisão das estimativas. Quando foi utilizada a escala publicada, apenas os valores de v e u foram melhores. No entanto, quando a escala proposta foi usada, houve melhoria nos valores de v, Cb, r e ρc. Isto mostra que a escala proposta proporcionou estimativas de severidade mais acuradas e precisas. A reprodutibilidade das estimativas foi verificada utilizando o coeficiente de correlação intra-classe (ρ) e coeficiente de determinação (R2). Verificou-se que com e sem o uso da escala publicada os valores de ρ e R2 não diferiram e com o uso da escala proposta houve ganho em reprodutibilidade. A escala proposta neste estudo aumentou a acurácia, a precisão e a reprodutibilidade das avaliações, sendo uma ferramenta de grande utilidade para avaliar severidade de FAS.Universidade Tecnológica Federal do ParanáDois VizinhosBrasilPrograma de Pós-Graduação em AgroecossistemasUTFPRMazaro, Sérgio Miguelhttps://orcid.org/0000-0003-2787-9409http://lattes.cnpq.br/4271660992059925Mazaro, Sérgio Miguelhttps://orcid.org/0000-0003-2787-9409http://lattes.cnpq.br/4271660992059925Rey, Maristela dos Santoshttps://orcid.org/0000-0002-9323-0395http://lattes.cnpq.br/2881579615367576Duarte, Henrique da Silva Silveirahttps://orcid.org/0000-0002-8128-5428http://lattes.cnpq.br/4365683626496703Franceschi, Vinicius Tadeu2021-04-12T17:49:56Z2021-04-12T17:49:56Z2017-09-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfFRANCESCHI, Vinicius Tadeu. Desenvolvimento e validação de uma nova escala diagramática para estimar severidade de ferrugem asiática da soja. 2017. Dissertação (Mestrado em Agroecossistemas) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Dois Vizinhos, 2017.http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/24742porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)instacron:UTFPR2021-04-13T06:11:44Zoai:repositorio.utfpr.edu.br:1/24742Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.utfpr.edu.br:8080/oai/requestriut@utfpr.edu.br || sibi@utfpr.edu.bropendoar:2021-04-13T06:11:44Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)false
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