Avaliação do desempenho analítico e clínico dos ensaios de quantificação do HIV e das hepatites virais na plataforma Alinity m

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Costa, Diego da Silva
Orientador(a): Silva, Simone da Costa Cruz
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Link de acesso: https://arca.fiocruz.br/handle/icict/65968
Resumo: Introdução: No manejo do paciente infectado pelo HIV, HBV e HCV, a determinação da carga viral é uma etapa importante que pode diagnosticar a infecção e indicar o início e/ou o sucesso do tratamento. A Plataforma de Laboratório Multiusuário (PLATLAB), unidade laboratorial do Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas (INI), integra a Rede Nacional de Contagem de Linfócitos T CD4+/CD8+ e Carga Viral do HIV desde 2014 e das Hepatites Virais desde 2018, sendo financiada pelo Ministério da Saúde. A PLATLAB recebe amostras para realizar a CV do HIV e das hepatites B e C dos pacientes atendidos no INI, de outros Institutos da Fiocruz e de unidades de saúde municipais e federais localizadas no Estado do Rio de Janeiro. No ano de 2022 os exames começaram a ser processados na plataforma analítica Abbott Alinity m, que substituiu o sistema Abbott m2000. Objetivo: Avaliar o desempenho analítico e clínico dos ensaios de quantificação do HIV e das hepatites virais na plataforma Alinity m. Metodologia: Estudo prospectivo, por meio da utilização do ensaio de quantificação do HIV em controles padrão fornecidos pelo Duke Human Vaccine Institute e amostras clínicas, que permitiu avaliar a precisão, sensibilidade, exatidão, contaminação e desempenho clínico da plataforma Alinity m; e estudo retrospectivo, por meio de revisão documental, que permitiu avaliar a influência das duas plataformas – Alinity m e m2000 – no tempo de liberação dos laudos das hepatites virais. Resultados: A análise das cargas virais do HIV dos padrões mostrou que o desvio-padrão não ultrapassou 0,15 e que a diferença das análises esperada e encontrada estão dentro de ± 0,5 Log10 cópias/mL Houve 100% de sensibilidade, correlação de 0,998 (p-valor < 0,001), exatidão na faixa de quantificação de 25 a 50 cópias/mL (teste T, p-valor = 0,078) e ausência de exatidão na faixa de quantificação de 1.500 a 1.500.000 cópias/mL, com viés médio de 0,284 Log10 cópias/mL (teste T, p-valor < 0,001). A análise das amostras clínicas sugeriu ausência de contaminação e mostrou forte correlação (r = 0,994, p-valor < 0,001) com superquantificação média da carga viral do HIV de 0,209 Log10 cópias/mL da plataforma Alinity m comparada a m2000 (teste t, p-valor < 0,001). A revisão documental mostrou que a plataforma Alinity m reduz em aproximadamente três vezes as medidas de tendência central (média e mediana) do tempo de liberação dos laudos de carga viral das hepatites da plataforma m2000 (teste U de Mann-Whitney, p-valor < 0,001). Conclusão: A plataforma Alinity m mostrou potencial analítico satisfatório e garantiu eficiência na melhoria do fluxo de trabalho do laboratório
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A PLATLAB recebe amostras para realizar a CV do HIV e das hepatites B e C dos pacientes atendidos no INI, de outros Institutos da Fiocruz e de unidades de saúde municipais e federais localizadas no Estado do Rio de Janeiro. No ano de 2022 os exames começaram a ser processados na plataforma analítica Abbott Alinity m, que substituiu o sistema Abbott m2000. Objetivo: Avaliar o desempenho analítico e clínico dos ensaios de quantificação do HIV e das hepatites virais na plataforma Alinity m. Metodologia: Estudo prospectivo, por meio da utilização do ensaio de quantificação do HIV em controles padrão fornecidos pelo Duke Human Vaccine Institute e amostras clínicas, que permitiu avaliar a precisão, sensibilidade, exatidão, contaminação e desempenho clínico da plataforma Alinity m; e estudo retrospectivo, por meio de revisão documental, que permitiu avaliar a influência das duas plataformas – Alinity m e m2000 – no tempo de liberação dos laudos das hepatites virais. Resultados: A análise das cargas virais do HIV dos padrões mostrou que o desvio-padrão não ultrapassou 0,15 e que a diferença das análises esperada e encontrada estão dentro de ± 0,5 Log10 cópias/mL Houve 100% de sensibilidade, correlação de 0,998 (p-valor < 0,001), exatidão na faixa de quantificação de 25 a 50 cópias/mL (teste T, p-valor = 0,078) e ausência de exatidão na faixa de quantificação de 1.500 a 1.500.000 cópias/mL, com viés médio de 0,284 Log10 cópias/mL (teste T, p-valor < 0,001). A análise das amostras clínicas sugeriu ausência de contaminação e mostrou forte correlação (r = 0,994, p-valor < 0,001) com superquantificação média da carga viral do HIV de 0,209 Log10 cópias/mL da plataforma Alinity m comparada a m2000 (teste t, p-valor < 0,001). A revisão documental mostrou que a plataforma Alinity m reduz em aproximadamente três vezes as medidas de tendência central (média e mediana) do tempo de liberação dos laudos de carga viral das hepatites da plataforma m2000 (teste U de Mann-Whitney, p-valor < 0,001). Conclusão: A plataforma Alinity m mostrou potencial analítico satisfatório e garantiu eficiência na melhoria do fluxo de trabalho do laboratórioIntroduction: In the management of patients infected with HIV, HBV and HCV, the determination of the viral load is an important step that can diagnose the infection and indicate the beginning and/or success of the treatment. The Multiuser Laboratory Platform (PLATLAB), a laboratory unit of the Evandro Chagas National Institute of Infectious Diseases, is part of the National Network for CD4+/CD8+ T Lymphocyte Counting and Viral Load for HIV since 2014 and for Viral Hepatitis since 2018. The Ministry of Health supports this network. PLATLAB receives samples to carry out the HIV and hepatitis B and C viral load from patients seen at the INI, from other Fiocruz's Institutes and from municipal and federal health units located in the State of Rio de Janeiro. In 2022, exams began to be processed on the Abbott Alinity m analytical platform, which replaced the Abbott m2000 systems. Objective: To evaluate the analytical and clinical performance of HIV and viral hepatitis quantification assays on the Alinity m platform. Methodology: This was a prospective study, that utilized the HIV quantification assay in standard controls provided by the Duke Human Vaccine Institute and clinical samples. We could evaluate the precision, sensitivity, accuracy, contamination and clinical performance of the Alinity m platform. Furthermore, a retrospective study was conducted with a document review, which allowed evaluating the influence of the two platforms – Alinity m and m2000 – on the time taken to release viral hepatitis reports. Results: The analysis of HIV viral load from standard controls showed that the standard deviation did not exceed 0.15 and the difference of all analyzes were within ± 0.5 Log10 cp/mL There was 100% of sensitivity, correlation of 0.998 (p-value < 0.001), accuracy in the quantification range from 25 to 50 copies/mL (T-test, p-value = 0.078) and lack of accuracy in the quantification range from 1,500 to 1,500,000 copies/mL with a mean bias of 0.284 Log10 copies/mL (T-test, p-value < 0.001). Analysis of clinical samples suggested the absence of contamination and showed a strong correlation (r = 0.994, p-value < 0.001) with mean HIV viral load over-quantification of 0.209 Log10 copies/mL of the Alinity m platform under m2000 (T-test, p-value < 0.001). The document review showed that the Alinity m platform reduces the measures of central tendency (mean and median) of the time taken to release viral load hepatitis reports from the m2000 platform by almost three times (Mann-Whitney U test, p-value < 0.001). Conclusion: The Alinity m platform showed satisfactory analytical potential and ensured efficiency in improving the laboratory turnaround timeFundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porHIVHepatites ViraisCarga Viralm2000Alinity mHIVViral HepatitisViral Loadm2000Alinity mHIVHepatite Viral HumanaCarga ViralTécnicas de Diagnóstico MolecularAnálise de DadosAvaliação do desempenho analítico e clínico dos ensaios de quantificação do HIV e das hepatites virais na plataforma Alinity minfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2023Instituto Nacional de Infectologia Evandro ChagasFundação Oswaldo CruzMestrado ProfissionalRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Pesquisa Clínicainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/05f5c662-47b2-4e70-8940-8ae98ca481b1/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADORIGINALdiego_costa_ini_mest_2023.pdfapplication/pdf2421895https://arca.fiocruz.br/bitstreams/88186fad-8a3f-48ff-becc-284dea50ce82/download4f24c01eebdc626dd8c48895ffea8dd5MD52trueAnonymousREADTEXTdiego_costa_ini_mest_2023.pdf.txtdiego_costa_ini_mest_2023.pdf.txtExtracted texttext/plain102915https://arca.fiocruz.br/bitstreams/bd77fd18-c9be-4cfc-9cef-fcb9d47c8121/downloadb82ad9802d5a58e412eb503fa5a0ea30MD513falseAnonymousREADTHUMBNAILdiego_costa_ini_mest_2023.pdf.jpgdiego_costa_ini_mest_2023.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg15433https://arca.fiocruz.br/bitstreams/bc101bc7-f724-4ab9-ba09-71dfc763fa01/download7e38ca9a5624f64dd2492ff2f8b84773MD514falseAnonymousREADicict/659682025-12-11 08:21:44.597open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/65968https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-12-11T11:21:44Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)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