Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo I: métodos de inferência filogenética
| Ano de defesa: | 2004 |
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Resumo: | O crescimento das bases de dados moleculares referentes ao vírus da imunodeficiência humana do tipo I (HIV-1) aumentou progressivamente desde 1991. Pesquisadores do mundo inteiro têm se dedicado ao seqüenciamento de diferentes regiões do genoma do HIV visando elucidar o processo evolutivo viral. Supõe-se que este processo evolutivo esteja na base da pesquisa que determinará a produção de vacinas eficazes além de novas drogas para o combate da Aids. Neste trabalho, procuramos introduzir alguns aspectos da epidemiologia molecular do HIV-1 enfatizando a distribuição global dos seus subtipos e os métodos de inferência filogenética utilizados no estudo de sua evolução. Apresentamos, como aplicação dos métodos de inferência filogenética, um artigo intitulado "Epidemiologia Molecular do Sub-subtipo F1 do HIV-1", onde discutimos a epidemiologia molecular do sub-subtipo F1 buscando comparar as epidemias deste sub-subtipo no Brasil e na Romênia. |
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Pinto, Jorge Francisco da CunhaStruchiner, Claudio José2012-09-06T01:11:49Z2012-09-06T01:11:49Z2004PINTO, Jorge Francisco da Cunha. Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo I: métodos de inferência filogenética. 2004. 68 f. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2004.https://arca.fiocruz.br/handle/icict/5011O crescimento das bases de dados moleculares referentes ao vírus da imunodeficiência humana do tipo I (HIV-1) aumentou progressivamente desde 1991. Pesquisadores do mundo inteiro têm se dedicado ao seqüenciamento de diferentes regiões do genoma do HIV visando elucidar o processo evolutivo viral. Supõe-se que este processo evolutivo esteja na base da pesquisa que determinará a produção de vacinas eficazes além de novas drogas para o combate da Aids. Neste trabalho, procuramos introduzir alguns aspectos da epidemiologia molecular do HIV-1 enfatizando a distribuição global dos seus subtipos e os métodos de inferência filogenética utilizados no estudo de sua evolução. Apresentamos, como aplicação dos métodos de inferência filogenética, um artigo intitulado "Epidemiologia Molecular do Sub-subtipo F1 do HIV-1", onde discutimos a epidemiologia molecular do sub-subtipo F1 buscando comparar as epidemias deste sub-subtipo no Brasil e na Romênia.The growth of the human immunodeficiency virus (HIV) sequence databases has been staggering since 1991. Researchers all over the world are sequencing different regions of the HIV genome to infer processes of HIV evolution. It has been supposed that this process is on the top of the researches that will contribute to vaccine development and the discovery of new drugs against Aids. In this work, we introduce some aspects of the molecular epidemiology of HIV-1 linking to its world diversity and global distribution. We also set forth the methods of inferring phylogenies. Finally, we present a paper named "Epidemiologia Molecular do Sub-subtipo F1 do HIV-1" where we discuss the molecular epidemic of the sub-subtype F1 of HIV-1 linking the Brazilian and Romanian epidemic of this sub-subtype.Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porInferência FilogenéticaEpidemiologia MolecularSubtipos de HIV-1Inferring PhylogeniesMolecular EpidemiologyHIV-1 SubtypesEpidemiologia MolecularFilogeniaHIV-1Síndrome de Imunodeficiência AdquiridaGenômicaBases de Dados GenéticasEpidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo I: métodos de inferência filogenéticaEpidemiology molecular of the human immunodeficiency virus type I: approaches of inferring phylogeniesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisEscola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca, Fundação Oswaldo Cruz.Fundação Oswaldo Cruz, Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca.MestreRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Epidemiologia em Saúde Públicainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/16626c5a-80f0-4397-b055-503b85331dde/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADORIGINALjorge_francisco_cunha_pinto_ensp_mest_2004.pdfapplication/pdf456158https://arca.fiocruz.br/bitstreams/20f6a37f-80e9-4740-8183-ebe2540b44a5/downloadbdc3f655a9020357b70fb3ebae086be9MD52trueAnonymousREADTEXT811.pdf.txt811.pdf.txtExtracted texttext/plain126630https://arca.fiocruz.br/bitstreams/2106443e-4605-4d36-80a2-e8cb76c0bc3e/download8bc0bc242df60baf1964405a3856c6c3MD55falseAnonymousREADjorge_francisco_cunha_pinto_ensp_mest_2004.pdf.txtjorge_francisco_cunha_pinto_ensp_mest_2004.pdf.txtExtracted texttext/plain102411https://arca.fiocruz.br/bitstreams/f3af1886-8dc5-485a-abe3-b75da5ddd7c3/downloaddadb5a13904180a6eee4839c105f6c4dMD514falseAnonymousREADTHUMBNAIL811.pdf.jpg811.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1354https://arca.fiocruz.br/bitstreams/d5c72015-ecc5-4b26-a0e8-d67db0440991/downloade354ccca353d8a89050728f6fa7e893aMD54falseAnonymousREADjorge_francisco_cunha_pinto_ensp_mest_2004.pdf.jpgjorge_francisco_cunha_pinto_ensp_mest_2004.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg16737https://arca.fiocruz.br/bitstreams/8df96fd5-164d-483c-8daf-007b8c559b00/download3f80c33f854c747b58be07d0c431bad1MD515falseAnonymousREADicict/50112025-12-11 08:29:52.687open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/5011https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-12-11T11:29:52Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)falseTk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo= |
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