Filogeografia do subtipo D do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) no Brasil

• Ano de defesa: 2024
• Autor(a) principal: Silva, José Iago Madureira da
• Orientador(a): Gräf, Tiago
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Link de acesso: https://arca.fiocruz.br/handle/icict/71967
• topic: HIV-1; Subtipo-D; Lentivirus; Humimdef1; HIV-1; Subtype-D; Lentivírus; Humimdef1; HIV-1; Subtipo; Lentivirus

INTRODUÇÃO: O HIV-1 é dos vírus humanos de maior importância na história da saúde pública. Apesar da terapia antirretroviral atualmente possibilitar uma grande sobrevida aos indivíduos portadores de HIV-1, a aids ainda causa centenas de milhares de mortes todos os anos. Por possuir uma grande taxa mutacional, o HIV-1 se diferenciou em diversos subtipos, que se espalharam pelo mundo de forma heterogênea. No Brasil, a epidemia do HIV-1 é dominada pelos subtipos B, C e F1, mas também há relatos da circulação de variantes minoritárias como o subtipo D. OBJETIVO: Neste estudo, investigamos a história evolutiva do subtipo D no Brasil através da análise do banco de dados e sequências da Rede Nacional de Genotipagem (RENAGENO) do HIV. MATERIAL E MÉTODOS: Através da subtipagem das sequências da RENAGENO e da busca por sequências publicamente disponíveis, encontramos 78 genomas do subtipo D isolados no Brasil. Nestas foram incorporadas a um banco de sequências internacional, alinhado e analisado por métodos filogenéticos de máxima verossimilhança e filogeografia bayesiana. RESULTADOS: Nossas análises revelaram que o subtipo D foi introduzido no Brasil pelo menos 12 vezes. Em cinco dessas introduções, o vírus parece não ter tido sucesso em se espalhar pelo país, pois os clados eram compostos apenas por uma sequência Brasileira. Em dois dos clados identificados, apenas sequências da região sul do Brasil, especialmente no Rio Grande do Sul, eram agrupadas, mostrando múltiplas introduções que aparentemente ficaram isoladas nesta região. Por fim, encontramos um grande clado contendo mais de 50 sequências subtipo D brasileiras, isoladas em 12 estados, evidenciando que esta variante do HIV está em circulação efetiva no país, sugerindo que a introdução inicial ocorreu no Rio de Janeiro O Rio de Janeiro mostrou-se um ponto central na disseminação interestadual do subtipo D, evidenciando sua relevância na dinâmica de dispersão viral no país. CONCLUSÃO: Esses resultados destacam a diversidade das trajetórias evolutivas do subtipo D no Brasil. O estudo contribui para a compreensão da diversidade genética do HIV-1 no Brasil, ressaltando a importância de uma vigilância contínua utilizando dados genômicos para mapear com mais precisão as redes de transmissão e os padrões de dispersão viral no país