Exportação concluída — 

Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Cruz Filho, João Ricardo Pereira da
Orientador(a): Reis, Mitermayer Galvão dos
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Link de acesso: https://arca.fiocruz.br/handle/icict/65191
Resumo: INTRODUÇÃO: água é um elemento indispensável para a manutenção da vida, no entanto, suas fontes naturais podem representar um veículo para disseminação de doenças em grandes centros urbanos. O saneamento básico inadequado leva a contaminação de corpos hídricos com microrganismos potencialmente patogênicos para a saúde humana, por conseguinte, microrganismos com altos índices de resistência aos antimicrobianos têm sido relatados em todo o mundo. OBJETIVO: O presente estudo visou caracterizar os genes de virulência e resistência antimicrobiana em isolados de Klebsiella pneumoniae encontrados na coleção hídrica urbana do Rio do Cobre, Salvador - Bahia. MATERIAL E MÉTODOS: A coleta das amostras de água foi iniciada em outubro de 2021 e foi finalizada em agosto de 2022, em intervalos de três meses entre as coletas. Foram realizadas coletas em sete pontos distribuídos ao longo do rio do Cobre, incluindo nascente e foz. As amostras foram isoladas em meio Chromoagar Orientation® e MacConkey. A identificação bacteriana foi realizada por espectrometria de massa (MALDI-TOF®) e o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos determinados por microdiluição (VITEK®-2). As amostras identificadas como K. pneumoniae foram genotipadas através de PCR convencional para detecção dos genes codificantes de β-lactamases e os principais genes de virulência correspondentes à produção de cápsula, fímbrias, sideróforos e outros mecanismos. RESULTADOS: 60 isolados foram confirmados como de Klebsiella pneumoniae. O perfil antimicrobiano mostrou alta prevalência a pelo menos um dos b-lactâmicos analisados, porém, a frequência de isolados resistentes as cefalosporinas foi considerada baixa. 16 cepas foram classificadas como multidroga resistentes. As análises por PCR demonstraram que 80% dos isolados possuem codificantes para b-lactamases. Os genes responsáveis pela produção de fímbrias e sideróforos foram os mais frequentes. CONCLUSÕES: A detecção de K. pneumoniae resistentes em uma coleção hídrica urbana demonstra a importância de estudos seguindo o modelo One Health. Altos índices de resistência aos antimicrobianos são uma preocupação mundial e, as tomadas de decisões em programas destinados à saúde pública devem integrar o entendimento da distribuição dessa resistência tanto no ambiente hospitalar, comunitário e na agropecuária
id CRUZ_f5a9b06a1b168e8620fbf2fa8e30eaeb
oai_identifier_str oai:arca.fiocruz.br:icict/65191
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da Fiocruz (ARCA)
repository_id_str
spelling Cruz Filho, João Ricardo Pereira daCordeiro, Soraia Machado.Reis, Mitermayer Galvão dos2024-07-26T18:20:29Z2024-07-26T18:20:29Z2023CRUZ FILHO, João Ricardo Pereira da. Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador. 2023. 73f. Dissertação, (Mestrado)-Instituto Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2023.https://arca.fiocruz.br/handle/icict/65191INTRODUÇÃO: água é um elemento indispensável para a manutenção da vida, no entanto, suas fontes naturais podem representar um veículo para disseminação de doenças em grandes centros urbanos. O saneamento básico inadequado leva a contaminação de corpos hídricos com microrganismos potencialmente patogênicos para a saúde humana, por conseguinte, microrganismos com altos índices de resistência aos antimicrobianos têm sido relatados em todo o mundo. OBJETIVO: O presente estudo visou caracterizar os genes de virulência e resistência antimicrobiana em isolados de Klebsiella pneumoniae encontrados na coleção hídrica urbana do Rio do Cobre, Salvador - Bahia. MATERIAL E MÉTODOS: A coleta das amostras de água foi iniciada em outubro de 2021 e foi finalizada em agosto de 2022, em intervalos de três meses entre as coletas. Foram realizadas coletas em sete pontos distribuídos ao longo do rio do Cobre, incluindo nascente e foz. As amostras foram isoladas em meio Chromoagar Orientation® e MacConkey. A identificação bacteriana foi realizada por espectrometria de massa (MALDI-TOF®) e o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos determinados por microdiluição (VITEK®-2). As amostras identificadas como K. pneumoniae foram genotipadas através de PCR convencional para detecção dos genes codificantes de β-lactamases e os principais genes de virulência correspondentes à produção de cápsula, fímbrias, sideróforos e outros mecanismos. RESULTADOS: 60 isolados foram confirmados como de Klebsiella pneumoniae. O perfil antimicrobiano mostrou alta prevalência a pelo menos um dos b-lactâmicos analisados, porém, a frequência de isolados resistentes as cefalosporinas foi considerada baixa. 16 cepas foram classificadas como multidroga resistentes. As análises por PCR demonstraram que 80% dos isolados possuem codificantes para b-lactamases. Os genes responsáveis pela produção de fímbrias e sideróforos foram os mais frequentes. CONCLUSÕES: A detecção de K. pneumoniae resistentes em uma coleção hídrica urbana demonstra a importância de estudos seguindo o modelo One Health. Altos índices de resistência aos antimicrobianos são uma preocupação mundial e, as tomadas de decisões em programas destinados à saúde pública devem integrar o entendimento da distribuição dessa resistência tanto no ambiente hospitalar, comunitário e na agropecuáriaINTRODUCTION: water is an essential element for the maintenance of life, however, its natural sources can represent a vehicle for the spread of diseases in large urban centers. Inadequate basic sanitation leads to the contamination of water bodies with microorganisms potentially pathogenic to human health; therefore, microorganisms with high levels of resistance to antimicrobials have been reported around the world. AIM: The present study aimed to characterize the virulence and antimicrobial resistance genes in isolates of Klebsiella pneumoniae found in the urban water collection of Rio do Cobre, Salvador - Bahia. MATERIAL AND METHODS: Water sample collection began in October 2021 and ended in August 2022, with three-month intervals between collections. Collections were carried out at seven points distributed along the Cobre River, including its source and mouth. Samples were isolated on Chromoagar Orientation® and MacConkey medium. Bacterial identification was performed by mass spectrometry (MALDI-TOF®) and the antimicrobial susceptibility profile determined by microdilution (VITEK®-2). The samples identified as K. pneumoniae were genotyped using conventional PCR to detect the genes encoding β-lactamases and the main virulence genes corresponding to the production of capsule, fimbriae, siderophores and other mechanisms. RESULTS: 60 isolates were confirmed as Klebsiella pneumoniae. The antimicrobial profile showed a high prevalence of at least one of the b-lactams analyzed, however, the frequency of isolates resistant to cephalosporins was considered low. 16 strains were classified as multidrug resistant. PCR analyzes demonstrated that 80% of the isolates have coding for b-lactamases. The genes responsible for the production of fimbriae and siderophores were the most frequent. CONCLUSIONS: The detection of resistant K. pneumoniae in an urban water collection demonstrates the importance of studies following the One Health model. High rates of resistance to antimicrobials are a global concern and decision-making in programs aimed at public health must integrate the understanding of the distribution of this resistance both in the hospital, community and agricultural environmentsCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES)Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.porResistência aos antimicrobianosKlebsiella pneumoniaeESBLFatores de VirulênciaAntimicrobial resistanceKlebsiella pneumoniaeESBLVirulence factorsResistência AntimicrobianaKlebsiella PneumoniaeESBLFatores de VirulênciaCaracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvadorCharacterization of virulence factors and antimicrobial resistance in Klebsiella pneumoniae identified in an urban water collection in Salvadorinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2023Instituto Gonçalo MonizMestrado AcadêmicoSalvador/BAPrograma de Pós-Graduação em Patologia Humana e Experimentalinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/56027263-4378-4411-88f2-bca27a961789/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADORIGINALjoao_cruz_filho_fioba_mest_2023.pdfapplication/pdf2166940https://arca.fiocruz.br/bitstreams/6c6bbbdc-ab09-4e56-8ad1-3b1ff7e7c6f4/download1c710151cca30a1c58a07b4f2f48c1b7MD52trueAnonymousREADTEXTjoao_cruz_filho_fioba_mest_2023.pdf.txtjoao_cruz_filho_fioba_mest_2023.pdf.txtExtracted texttext/plain102663https://arca.fiocruz.br/bitstreams/16be38ce-f2f1-4fe8-89c3-006b2d4b8ee6/download3d5c23d36494338f01d72ea273eb2a93MD511falseAnonymousREADTHUMBNAILjoao_cruz_filho_fioba_mest_2023.pdf.jpgjoao_cruz_filho_fioba_mest_2023.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg18595https://arca.fiocruz.br/bitstreams/3544df1e-dd86-4b6f-a814-73498045f09a/download06d3e751a54348c2d4d0248209c4d14fMD512falseAnonymousREADicict/651912025-12-11 08:43:14.949open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/65191https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-12-11T11:43:14Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)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
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador
dc.title.alternative.none.fl_str_mv Characterization of virulence factors and antimicrobial resistance in Klebsiella pneumoniae identified in an urban water collection in Salvador
title Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador
spellingShingle Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador
Cruz Filho, João Ricardo Pereira da
Resistência aos antimicrobianos
Klebsiella pneumoniae
ESBL
Fatores de Virulência
Antimicrobial resistance
Klebsiella pneumoniae
ESBL
Virulence factors
Resistência Antimicrobiana
Klebsiella Pneumoniae
ESBL
Fatores de Virulência
title_short Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador
title_full Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador
title_fullStr Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador
title_full_unstemmed Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador
title_sort Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador
author Cruz Filho, João Ricardo Pereira da
author_facet Cruz Filho, João Ricardo Pereira da
author_role author
dc.contributor.advisorco.none.fl_str_mv Cordeiro, Soraia Machado.
dc.contributor.author.fl_str_mv Cruz Filho, João Ricardo Pereira da
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Reis, Mitermayer Galvão dos
contributor_str_mv Reis, Mitermayer Galvão dos
dc.subject.other.none.fl_str_mv Resistência aos antimicrobianos
Klebsiella pneumoniae
ESBL
Fatores de Virulência
topic Resistência aos antimicrobianos
Klebsiella pneumoniae
ESBL
Fatores de Virulência
Antimicrobial resistance
Klebsiella pneumoniae
ESBL
Virulence factors
Resistência Antimicrobiana
Klebsiella Pneumoniae
ESBL
Fatores de Virulência
dc.subject.en.none.fl_str_mv Antimicrobial resistance
Klebsiella pneumoniae
ESBL
Virulence factors
dc.subject.decs.none.fl_str_mv Resistência Antimicrobiana
Klebsiella Pneumoniae
ESBL
Fatores de Virulência
description INTRODUÇÃO: água é um elemento indispensável para a manutenção da vida, no entanto, suas fontes naturais podem representar um veículo para disseminação de doenças em grandes centros urbanos. O saneamento básico inadequado leva a contaminação de corpos hídricos com microrganismos potencialmente patogênicos para a saúde humana, por conseguinte, microrganismos com altos índices de resistência aos antimicrobianos têm sido relatados em todo o mundo. OBJETIVO: O presente estudo visou caracterizar os genes de virulência e resistência antimicrobiana em isolados de Klebsiella pneumoniae encontrados na coleção hídrica urbana do Rio do Cobre, Salvador - Bahia. MATERIAL E MÉTODOS: A coleta das amostras de água foi iniciada em outubro de 2021 e foi finalizada em agosto de 2022, em intervalos de três meses entre as coletas. Foram realizadas coletas em sete pontos distribuídos ao longo do rio do Cobre, incluindo nascente e foz. As amostras foram isoladas em meio Chromoagar Orientation® e MacConkey. A identificação bacteriana foi realizada por espectrometria de massa (MALDI-TOF®) e o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos determinados por microdiluição (VITEK®-2). As amostras identificadas como K. pneumoniae foram genotipadas através de PCR convencional para detecção dos genes codificantes de β-lactamases e os principais genes de virulência correspondentes à produção de cápsula, fímbrias, sideróforos e outros mecanismos. RESULTADOS: 60 isolados foram confirmados como de Klebsiella pneumoniae. O perfil antimicrobiano mostrou alta prevalência a pelo menos um dos b-lactâmicos analisados, porém, a frequência de isolados resistentes as cefalosporinas foi considerada baixa. 16 cepas foram classificadas como multidroga resistentes. As análises por PCR demonstraram que 80% dos isolados possuem codificantes para b-lactamases. Os genes responsáveis pela produção de fímbrias e sideróforos foram os mais frequentes. CONCLUSÕES: A detecção de K. pneumoniae resistentes em uma coleção hídrica urbana demonstra a importância de estudos seguindo o modelo One Health. Altos índices de resistência aos antimicrobianos são uma preocupação mundial e, as tomadas de decisões em programas destinados à saúde pública devem integrar o entendimento da distribuição dessa resistência tanto no ambiente hospitalar, comunitário e na agropecuária
publishDate 2023
dc.date.issued.fl_str_mv 2023
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-07-26T18:20:29Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-07-26T18:20:29Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv CRUZ FILHO, João Ricardo Pereira da. Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador. 2023. 73f. Dissertação, (Mestrado)-Instituto Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2023.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://arca.fiocruz.br/handle/icict/65191
identifier_str_mv CRUZ FILHO, João Ricardo Pereira da. Caracterização dos fatores de virulência e da resistência aos antimicrobianos em Klebsiella Pneumoniae identificadas em uma coleção hídrica urbana de salvador. 2023. 73f. Dissertação, (Mestrado)-Instituto Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2023.
url https://arca.fiocruz.br/handle/icict/65191
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://arca.fiocruz.br/bitstreams/56027263-4378-4411-88f2-bca27a961789/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/6c6bbbdc-ab09-4e56-8ad1-3b1ff7e7c6f4/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/16be38ce-f2f1-4fe8-89c3-006b2d4b8ee6/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/3544df1e-dd86-4b6f-a814-73498045f09a/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
1c710151cca30a1c58a07b4f2f48c1b7
3d5c23d36494338f01d72ea273eb2a93
06d3e751a54348c2d4d0248209c4d14f
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1855588482596995072