Influência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viral
Ano de defesa: | 2017 |
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Resumo: | A proteína do envelope (E) é responsável pela entrada de flavivírus na célula, sendo um determinante importante no processo infeccioso, apresentando três domínios (DI, DII e DIII). A proteína E de vários flavivírus pode sofrer deformações conformacionais. Em alguns casos, como na Dengue 2, essas mudanças estruturais são capazes de tornar as células de mamíferos mais propensas à infecção. Por estas razões, analisamos como a temperatura pode influenciar a conformação de ZIKENV, com o objetivo de descrever movimentos coletivos em larga escala que têm o potencial de impactar a funcionalidade da proteína e, conseqüentemente, a infectividade do vírus. Foram simuladas in silico quatro temperaturas diferentes (4°C, 27°C, 37°C e 45°C) utilizando a técnica de dinâmica acelerada que permite o estudo de movimentos em grande escala. Foi possível descrever movimentos em larga escala correspondentes à dobra de DIII sobre DI e DII e dois laços adjacentes ao circuito de fusão, permitindo a exposição do mesmo. Os resíduos K84, M151, I152 e V255 foram identificados como essenciais nas deformações estruturais descritas, auxiliando na desestabilização da forma dimérica de ZIKENV. Essas mudanças são específicas na transição de 27°C para 37°C, o que imita a passagem do vírus do invertebrado para o hospedeiro vertebrado. Também caracterizou-se que a conformação preferencial da proteína E do vírus Zika é dobrada e mais compacta do que a estrutura preferencial a 27°C, apresentando a estruturação de um laço próximo ao laço de fusão da proteína como uma folha beta. A caracterização dessas preferências conformacionais tem um impacto direto no desenvolvimento de drogas e vacinas, uma vez que os locais expostos variam de acordo com a temperatura. Este trabalho elucida diferenças importantes nas conformações adotadas a essas temperaturas e pode servir de guia no desenvolvimento de medicamentos e vacinas. |
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Muniz, Gabriela de MedeirosNunes, Márcio Roberto TeixeiraOliveira, Layanna Freitas deMartins, Lívia CaricioMassafra, Janaína Mota de VasconcelosVianez Júnior, João Lídio da Silva Gonçalves2018-03-08T19:32:53Z2018-03-08T19:32:53Z2017MUNIZ, Gabriela de Medeiros. Influência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viral. 83 f. Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Programa de Pós-Graduação em Virologia, Ananindeua, 2017.https://patua.iec.gov.br/handle/iec/3077A proteína do envelope (E) é responsável pela entrada de flavivírus na célula, sendo um determinante importante no processo infeccioso, apresentando três domínios (DI, DII e DIII). A proteína E de vários flavivírus pode sofrer deformações conformacionais. Em alguns casos, como na Dengue 2, essas mudanças estruturais são capazes de tornar as células de mamíferos mais propensas à infecção. Por estas razões, analisamos como a temperatura pode influenciar a conformação de ZIKENV, com o objetivo de descrever movimentos coletivos em larga escala que têm o potencial de impactar a funcionalidade da proteína e, conseqüentemente, a infectividade do vírus. Foram simuladas in silico quatro temperaturas diferentes (4°C, 27°C, 37°C e 45°C) utilizando a técnica de dinâmica acelerada que permite o estudo de movimentos em grande escala. Foi possível descrever movimentos em larga escala correspondentes à dobra de DIII sobre DI e DII e dois laços adjacentes ao circuito de fusão, permitindo a exposição do mesmo. Os resíduos K84, M151, I152 e V255 foram identificados como essenciais nas deformações estruturais descritas, auxiliando na desestabilização da forma dimérica de ZIKENV. Essas mudanças são específicas na transição de 27°C para 37°C, o que imita a passagem do vírus do invertebrado para o hospedeiro vertebrado. Também caracterizou-se que a conformação preferencial da proteína E do vírus Zika é dobrada e mais compacta do que a estrutura preferencial a 27°C, apresentando a estruturação de um laço próximo ao laço de fusão da proteína como uma folha beta. A caracterização dessas preferências conformacionais tem um impacto direto no desenvolvimento de drogas e vacinas, uma vez que os locais expostos variam de acordo com a temperatura. Este trabalho elucida diferenças importantes nas conformações adotadas a essas temperaturas e pode servir de guia no desenvolvimento de medicamentos e vacinas.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.porInfluência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viralinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2017-07-13Núcleo de Ensino e Pós-GraduaçãoInstituto Evandro ChagasMestrado AcadêmicoAnanindeua / PAPrograma de Pós-Graduação em VirologiaZika virusProteínasProteínas do Envelope ViralConformação ProteicaInfecções por Flavivirusinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)instname:Instituto Evandro Chagas (IEC)instacron:IECORIGINALInfluência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viral.pdfInfluência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viral.pdfapplication/pdf4524475https://patua.iec.gov.br/bitstreams/df9988f6-3ae9-4237-871b-d5c06f762c2d/download1c66eb35d9e9b1e3fd1037dace77d4d7MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://patua.iec.gov.br/bitstreams/38cf12d8-2146-4b1d-92e6-cb0d9fd548c3/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTInfluência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viral.pdf.txtInfluência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viral.pdf.txtExtracted texttext/plain102808https://patua.iec.gov.br/bitstreams/bd392e19-ae2b-4d01-81b5-dbd8f883717e/downloadcd4b9908ee941f15f58cf86de06f5959MD55THUMBNAILInfluência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viral.pdf.jpgInfluência da temperatura na mudança conformacional da proteína e do vírus Zika e suas consequências na infectividade viral.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2858https://patua.iec.gov.br/bitstreams/9ff86441-6083-498c-b18d-0df648b00a1d/downloadeac10e2605b7bc83e9769809a3d23038MD56iec/30772022-10-20 21:07:05.305oai:patua.iec.gov.br:iec/3077https://patua.iec.gov.brRepositório InstitucionalPUBhttps://patua.iec.gov.br/oai/requestclariceneta@iec.gov.br || Biblioteca@iec.gov.bropendoar:2022-10-20T21:07:05Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) - Instituto Evandro Chagas (IEC)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 |
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