O papel das duplicações segmentares na formação de variação do número de cópias de novo após a exposição parental a doses baixas de radiação ionizante observadas na geração F1 de indivíduos acidentalmente expostos ao Césio-137

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2018
Autor(a) principal: Oliveira, Lorraynne Guimarães lattes
Orientador(a): Cruz, Aparecido Divino da lattes
Banca de defesa: Silva, Cláudio Carlos da lattes, Santos, Eliane Eugenia dos lattes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Pontifícia Universidade Católica de Goiás
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação STRICTO SENSU em Genética
Departamento: Escola de Ciências Agrárias e Biológicas::Curso de Biologia Bacharelado
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://tede2.pucgoias.edu.br/handle/tede/3999
Resumo: At the end of 1987 was one of the most serious radiological accidents in history, occurred in Goiânia-Goiás-Brazil, causing the contamination of the environment, succeending in the external irradiation and the internal contamination of several people. The direct and indirect effects of radiation initiate a series of biochemical and molecular signaling events that can repair the damage or culminate in permanent physiological changes or cell death. Mammalian cells have integrated response systems that detect DNA damage, activate signaling cascades, and realize repair. Chromosomal rearrangements induced by exposure to ionizing radiation can occur by Double Strand Break in the DNA (DSB). The main DNA repair mechanism responsible for the repair of DSBs is Nonallelic Homologous Recombination (NAHR). Through the NAHR process, the Low Copy Repeats known also with Segmental Duplications (LCRs / SDs) can lead to DNA rearrangements, such: deletions, duplications, inversions and translocations. Chromosomal Microarray Analysis (CMA) based on SNP array, is established on the identification of Copy Number Variantion (CNV), including gains and losses. The goal of this study was to investigate the effect of the presence of LCRs in the formation of new CNVs observed in the offspring of individuals exposed to low doses of IR of Cesium-137. The exposed group consisted of 12 families, of which at least one parent was directly exposed to IR Césio-137, including a total of 40 individuals (12 couples and 16 children born after the accident). The absorbed dose for the exposed individuals was estimated at ≤0.2 Gray. A group with 8 families of individuals not exposed to IR was used as control. The statistical tests used were Chi-Square, Pearson's Chi-Square, ANOVA, Spearman's Correlation, Kruskal Wallis, Likelihood Ratio and Linear Linear Association. All analyzes were performed with a significance level of 5% (p <0.05). We identified 50 (10.6%) and 23 (9.7%) CNVs that were being flanked by LCRs for the case and control groups, respectively. The test showed no significant difference. The comparison of gain and loss CNVs flanked by LCRs showed a significant difference where LCRs were significantly more associated with gain CNVs. The presence of LCRs was often associated with more longer CNVs, suggesting that CNVs originating from NAHR tend to be bigger. The CNV rates mutation and paternal meiosis in F1 generation of the case and control groups showed a significant difference. Men exposed to IR transmit more CNVs again small when compared to transmission based on maternal exposure and between controls. The estimation of rate mutation in LCR-mediated CNVs analyzed in F1 generation and in their biological parents was a useful biomarker in the retrospective evaluation of parental exposure to IR in human populations, especially for Burden mutation rate estimation.
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The direct and indirect effects of radiation initiate a series of biochemical and molecular signaling events that can repair the damage or culminate in permanent physiological changes or cell death. Mammalian cells have integrated response systems that detect DNA damage, activate signaling cascades, and realize repair. Chromosomal rearrangements induced by exposure to ionizing radiation can occur by Double Strand Break in the DNA (DSB). The main DNA repair mechanism responsible for the repair of DSBs is Nonallelic Homologous Recombination (NAHR). Through the NAHR process, the Low Copy Repeats known also with Segmental Duplications (LCRs / SDs) can lead to DNA rearrangements, such: deletions, duplications, inversions and translocations. Chromosomal Microarray Analysis (CMA) based on SNP array, is established on the identification of Copy Number Variantion (CNV), including gains and losses. The goal of this study was to investigate the effect of the presence of LCRs in the formation of new CNVs observed in the offspring of individuals exposed to low doses of IR of Cesium-137. The exposed group consisted of 12 families, of which at least one parent was directly exposed to IR Césio-137, including a total of 40 individuals (12 couples and 16 children born after the accident). The absorbed dose for the exposed individuals was estimated at ≤0.2 Gray. A group with 8 families of individuals not exposed to IR was used as control. The statistical tests used were Chi-Square, Pearson's Chi-Square, ANOVA, Spearman's Correlation, Kruskal Wallis, Likelihood Ratio and Linear Linear Association. All analyzes were performed with a significance level of 5% (p <0.05). We identified 50 (10.6%) and 23 (9.7%) CNVs that were being flanked by LCRs for the case and control groups, respectively. The test showed no significant difference. 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The estimation of rate mutation in LCR-mediated CNVs analyzed in F1 generation and in their biological parents was a useful biomarker in the retrospective evaluation of parental exposure to IR in human populations, especially for Burden mutation rate estimation.No final de 1987 houve um dos mais graves acidentes radiológicos da história, ocorrido em Goiânia-Goiás-Brasil, ocasionando a contaminação do ambiente, sucedendo na irradiação externa e a contaminação interna de várias pessoas. Os efeitos diretos e indiretos da radiação iniciam uma série de eventos de sinalização bioquímica e molecular que podem reparar o dano ou culminar em mudanças fisiológicas permanentes ou morte celular. As células de mamíferos integraram sistemas de resposta que detectam danos no DNA, ativam cascatas de sinalização e efetuam o reparo. Os rearranjos cromossômicos induzidos pela exposição à radiação ionizante podem ocorrer por quebras na dupla fita do DNA (DSB). O principal mecanismo de reparo do DNA, responsável pela reparação de DSBs é a Recombinação Homóloga Não Alélica (NAHR). Através do processo de NAHR, as Repetições de poucas cópias conhecidas também com Duplicações Segmentares (LCRs / SDs) podem levar a rearranjos de DNA, como: deleções, duplicações, inversões e translocações. A análise Cromossômica em Microarranjos (CMA) baseada em SNP array, fundamenta-se na identificação de Variação no Número de Cópias (CNV), incluindo ganhos e perdas. O objetivo deste trabalho foi investigar o efeito da presença de LCR na formação de CNVs novas observadas na prole de indivíduos expostos a baixas doses de RI de Césio-137. O grupo exposto foi constituído por 12 famílias, dos quais pelo menos um dos progenitores foi diretamente exposto à RI de Césio-137, incluindo um total de 40 indivíduos (12 casais e 16 filhos nascidos após o acidente). A dose absorvida para os indivíduos expostos foi estimada em ≤0,2 Gray. Um grupo com 8 famílias, de indivíduos não-expostos à radiação ionizante foi usado como controle. Os testes estatísticos utilizados foram Qui–Quadrado, Qui-Quadrado de Pearson, ANOVA, Correlação de Spearman, Kruskal Wallis, Razão de verossimilhança e Associação Linear por Linear. Todas as análises foram realizadas com nível de significância de 5% (p<0,05). Identificamos 50 (10,6%) e 23 (9,7%) CNVs que estavam sendo flanqueadas por LCRs, para os grupos caso e controle, respectivamente. O teste não demonstrou diferença significante. A comparação de CNVs de ganho e perda flanqueadas por LCRs mostrou diferença significativa onde LCRs estavam significativamente mais associadas as CNVs de ganhos. A presença de LCRs esteve associada frequentemente em CNVs mais longas, sugerindo que CNVs originadas a partir de NAHR tendem a ser maiores. As taxas de mutações de CNV e a meiose paterna na geração F1 dos grupos caso e controle demonstram diferença significativa. Homens expostos à RI transmitem mais CNVs de novo pequenas quando comparado com a transmissão em função da exposição materna e entre controles. A estimativa da taxa de mutação em CNVs mediadas por LCRs analisada na geração F1 e em seus pais biológicos foi um biomarcador útil na avaliação retrospectiva de exposição parentalSubmitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2018-06-22T19:18:01Z No. of bitstreams: 1 LORRAYNNE GUIMARÃES OLIVEIRA.pdf: 972251 bytes, checksum: 3d1335f8344b25e2c479fd95096c777d (MD5)Made available in DSpace on 2018-06-22T19:18:01Z (GMT). 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Radiation.CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAO papel das duplicações segmentares na formação de variação do número de cópias de novo após a exposição parental a doses baixas de radiação ionizante observadas na geração F1 de indivíduos acidentalmente expostos ao Césio-137The role of segmental duplications in the formation of de novo copy number variation after parental exposure to low doses of ionizing radiation observed in the F1 generation of individuals accidentally exposed to Cesium-137info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_GOAIS (TEDE-PUC Goiás)instname:Pontifícia Universidade Católica de Goiás (PUC-GO)instacron:PUC_GOTHUMBNAILLORRAYNNE GUIMARÃES OLIVEIRA.pdf.jpgLORRAYNNE GUIMARÃES OLIVEIRA.pdf.jpgimage/jpeg4393http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/3999/4/LORRAYNNE+GUIMAR%C3%83ES+OLIVEIRA.pdf.jpg1a707b6bb3b7a3f002392bcf7c911ebcMD54TEXTLORRAYNNE GUIMARÃES OLIVEIRA.pdf.txtLORRAYNNE GUIMARÃES OLIVEIRA.pdf.txttext/plain209737http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/3999/3/LORRAYNNE+GUIMAR%C3%83ES+OLIVEIRA.pdf.txta6c3e85c09037d1cc70193ecb5f42141MD53ORIGINALLORRAYNNE GUIMARÃES OLIVEIRA.pdfLORRAYNNE GUIMARÃES OLIVEIRA.pdfapplication/pdf972251http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/3999/2/LORRAYNNE+GUIMAR%C3%83ES+OLIVEIRA.pdf3d1335f8344b25e2c479fd95096c777dMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82001http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/3999/1/license.txtfd9262f8b1e1c170dee71e4fbec6b16cMD51tede/39992025-09-17 16:39:21.531oai:ambar: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 Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucgoias.edu.br:8080/http://tede2.pucgoias.edu.br:8080/oai/requesttede@pucgoias.edu.bropendoar:65932025-09-17T19:39:21Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_GOAIS (TEDE-PUC Goiás) - Pontifícia Universidade Católica de Goiás (PUC-GO)false
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