Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2009
Autor(a) principal: Costa, Ana Karoline Freire da
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual do Ceará
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Pcr
Link de acesso: https://siduece.uece.br/siduece/trabalhoAcademicoPublico.jsf?id=58500
Resumo: O gênero fúngico Cryptococcus é composto por leveduras capsuladas que apresentam capacidade de infectar e causar doença em uma larga variedade de hospedeiros, sendo C. neoformans e C. gattii as principais espécies patogênicas. No primeiro momento do presente estudo, cepas de leveduras (n=36) isoladas da cloaca e excremento de pombos, que se encontravam estocadas na micoteca do Centro Especializado em Micologia Médica (CEMM), foram re-identificadas para a realização da análise fenotípica e genotípica de Cryptococcus spp. Assim como, foram coletadas e processadas amostras de material vegetal provenientes das árvores Psidium guajava (n = 11), Mangifera indica (n = 2), Eucalyptus sp. (n = 8), Cassia siamea (n = 5), Zizyphus joazeiro (n = 10) e Azadirachta indica (n = 14), localizadas próximas aos ambientes de onde foram obtidas as leveduras analisadas. Além disso, foi avaliada a sensibilidade in vitro das cepas ambientais de Cryptococcus spp. frente a anfotericina B, azólicos e caspofungina. A partir das amostras estocadas, oriundas de excretas, foram identificados C. neoformans var. neoformans (27,8%), C. laurentii (8,3%) e outras leveduras (63,9%), enquanto dos espécimes provenientes da cloaca não obteve-se nenhum isolado de Cryptococcus spp. Para as amostras vegetais, vale destacar que, Cryptococcus spp. não foi isolado, obtendo-se apenas uma cepa de C. glabrata. Resistência aos azólicos foi detectada em somente uma cepa ambiental de C. neoformans, a qual foi resistente para itraconazol (CIM=1 µg/ml). Outro objetivo desse estudo foi realizar um estudo comparativo entre métodos manuais (características morfológicas e perfil bioquímico), semi-automatizado API 20C AUX, automatizado Vitek 2 e PCR-REA na identificação de Cryptococcus spp. obtidos de fontes ambientais (n=13) e clínicas (n=22). Adicionalmente, determinou-se as variedades e sorotipos das cepas analisadas. Considerando-se o método manual como padrão-ouro de identificação, O PCR-REA foi o método diagnóstico mais rápido e que apresentou relação significativa com o método manual. O último objetivo desse estudo foi caracterizar o perfil mating-type das cepas ambientais e clínicas de Cryptococcus spp. Logo, por PCR, foi possível verificar que as cepas de Cryptococcus spp. avaliadas eram do tipo α-mating-type. Por fim, a importância dessa pesquisa concentrou-se em buscar novos nichos ecológicos de Cryptococcus spp. em fontes vegetais; investigar o fenômeno de resistência antifúngica primária em cepas ambientais do fungo estudado, avaliar que método diagnóstico apresenta mais vantagens na identificação de Cryptococcus spp., incluindo a determinação das variedades e sorotipos das espécies de C. neoformans e C. gattii; e determinar o perfil mating-type dos nossos isolados. Palavras-chave: Cryptococcus spp. Resistência Antifúngica. PCR. Mating-type
id UECE-0_6ff205797bfef8dfe51d3095a44e371c
oai_identifier_str oai:uece.br:58500
network_acronym_str UECE-0
network_name_str Repositório Institucional da UECE
repository_id_str
spelling Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicasCiências veterinárias Cryptococcus Spp Mating - Type Pcr Resistência antifúngicaO gênero fúngico Cryptococcus é composto por leveduras capsuladas que apresentam capacidade de infectar e causar doença em uma larga variedade de hospedeiros, sendo C. neoformans e C. gattii as principais espécies patogênicas. No primeiro momento do presente estudo, cepas de leveduras (n=36) isoladas da cloaca e excremento de pombos, que se encontravam estocadas na micoteca do Centro Especializado em Micologia Médica (CEMM), foram re-identificadas para a realização da análise fenotípica e genotípica de Cryptococcus spp. Assim como, foram coletadas e processadas amostras de material vegetal provenientes das árvores Psidium guajava (n = 11), Mangifera indica (n = 2), Eucalyptus sp. (n = 8), Cassia siamea (n = 5), Zizyphus joazeiro (n = 10) e Azadirachta indica (n = 14), localizadas próximas aos ambientes de onde foram obtidas as leveduras analisadas. Além disso, foi avaliada a sensibilidade in vitro das cepas ambientais de Cryptococcus spp. frente a anfotericina B, azólicos e caspofungina. A partir das amostras estocadas, oriundas de excretas, foram identificados C. neoformans var. neoformans (27,8%), C. laurentii (8,3%) e outras leveduras (63,9%), enquanto dos espécimes provenientes da cloaca não obteve-se nenhum isolado de Cryptococcus spp. Para as amostras vegetais, vale destacar que, Cryptococcus spp. não foi isolado, obtendo-se apenas uma cepa de C. glabrata. Resistência aos azólicos foi detectada em somente uma cepa ambiental de C. neoformans, a qual foi resistente para itraconazol (CIM=1 µg/ml). Outro objetivo desse estudo foi realizar um estudo comparativo entre métodos manuais (características morfológicas e perfil bioquímico), semi-automatizado API 20C AUX, automatizado Vitek 2 e PCR-REA na identificação de Cryptococcus spp. obtidos de fontes ambientais (n=13) e clínicas (n=22). Adicionalmente, determinou-se as variedades e sorotipos das cepas analisadas. Considerando-se o método manual como padrão-ouro de identificação, O PCR-REA foi o método diagnóstico mais rápido e que apresentou relação significativa com o método manual. O último objetivo desse estudo foi caracterizar o perfil mating-type das cepas ambientais e clínicas de Cryptococcus spp. Logo, por PCR, foi possível verificar que as cepas de Cryptococcus spp. avaliadas eram do tipo α-mating-type. Por fim, a importância dessa pesquisa concentrou-se em buscar novos nichos ecológicos de Cryptococcus spp. em fontes vegetais; investigar o fenômeno de resistência antifúngica primária em cepas ambientais do fungo estudado, avaliar que método diagnóstico apresenta mais vantagens na identificação de Cryptococcus spp., incluindo a determinação das variedades e sorotipos das espécies de C. neoformans e C. gattii; e determinar o perfil mating-type dos nossos isolados. Palavras-chave: Cryptococcus spp. Resistência Antifúngica. PCR. Mating-typeCryptococcus is a capsulated yeast that presents capacity of infecting and causing disease in a great variety of hosts, including mammals, insects and birds, with C. neoformans and C. gattii as the main pathogenic species. Thus, during the first step of this research, 36 yeast strains, isolated from cloaca and stools of pigeons, which had previously been stocked in the mycoteca of Specialized Medical Mycology Center, were investigated in order to analyse phenotypic and genotypic Cryptococcus spp characteristic. In addition, vegetable material was collected from Psidium guajava (n = 11), Mangifera indica (n = 2), Eucalyptus sp. (n = 8), Cassia siamea (n = 5), Zizyphus joazeiro (n = 10) and Azadirachta indica (n = 14) trees, located near the areas where the analyzed yeasts were obtained. Besides, in vitro susceptibility to amphotericin B, azole derivatives and caspofungin against Cryptococcus spp. environmental strains was assessed. Out of the stocked isolates from stools, 27.8% were C. neoformans var. neoformans, 8.3% C. laurentii and 63.9% belonged to other yeast species. On the other hand, no Cryptococcus spp. isolates were obtained from cloaca and vegetable matter. From the latter, only one isolate of Candida glabrata was obtained. Azole resistance was observed in only one environmental strain of C. neoformans, which was resistant to itraconazole (MIC=1 µg/ml). Another goal of this study was to perform a comparative analysis between manual (morphological and biochemical characteristics), semiautomated (API 20C AUX), automated (VITEK 2) and molecular (PCR-REA) methods for the identification of Cryptococcus spp. obtained from environmental (n=13) and clinical (n=22) sources. Additionally, the variety and the serotype to which each strain belonged was determined. Considering the manual method as the gold standard for identification, PCRREA was the fastest diagnostic method and was significantly related to manual methods. The last goal of this study was to characterize the mating-type profile of environmental and clinical Cryptococcus spp. strains. Through PCR, it was possible to verify that the evaluated strains belonged to α-mating-type. Finally, the importance of this research was the pursuit of new ecological niches for Cryptococcus spp. within vegetable sources, the investigation of occurrence of primary antifungal resistance phenomenon among fungal environmental strains, the evaluation of the most advantageous diagnostic method for the identification of Cryptococcus spp., including the determination of varieties and serotypes of the species C. neoformans and C. gattii and the determination of the mating-type profile of our isolates. Keywords: Cryptococcus spp. Antifungal Resistance. PCR. Mating-type.Universidade Estadual do CearáMarcos Fabio Gadelha RochaCosta, Ana Karoline Freire da2010-02-22T00:00:00Z2009info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://siduece.uece.br/siduece/trabalhoAcademicoPublico.jsf?id=58500info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UECEinstname:Universidade Estadual do Cearáinstacron:UECE2010-02-22T00:00:00Zoai:uece.br:58500Repositório InstitucionalPUBhttps://siduece.uece.br/siduece/api/oai/requestopendoar:2010-02-22T00:00Repositório Institucional da UECE - Universidade Estadual do Cearáfalse
dc.title.none.fl_str_mv Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas
title Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas
spellingShingle Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas
Costa, Ana Karoline Freire da
Ciências veterinárias
Cryptococcus Spp
Mating - Type
Pcr
Resistência antifúngica
title_short Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas
title_full Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas
title_fullStr Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas
title_full_unstemmed Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas
title_sort Análise fenotípica e molecular de cepas de Cryptococcus spp. obtidas de fontes ambientais e clínicas
author Costa, Ana Karoline Freire da
author_facet Costa, Ana Karoline Freire da
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Marcos Fabio Gadelha Rocha
dc.contributor.author.fl_str_mv Costa, Ana Karoline Freire da
dc.subject.por.fl_str_mv Ciências veterinárias
Cryptococcus Spp
Mating - Type
Pcr
Resistência antifúngica
topic Ciências veterinárias
Cryptococcus Spp
Mating - Type
Pcr
Resistência antifúngica
description O gênero fúngico Cryptococcus é composto por leveduras capsuladas que apresentam capacidade de infectar e causar doença em uma larga variedade de hospedeiros, sendo C. neoformans e C. gattii as principais espécies patogênicas. No primeiro momento do presente estudo, cepas de leveduras (n=36) isoladas da cloaca e excremento de pombos, que se encontravam estocadas na micoteca do Centro Especializado em Micologia Médica (CEMM), foram re-identificadas para a realização da análise fenotípica e genotípica de Cryptococcus spp. Assim como, foram coletadas e processadas amostras de material vegetal provenientes das árvores Psidium guajava (n = 11), Mangifera indica (n = 2), Eucalyptus sp. (n = 8), Cassia siamea (n = 5), Zizyphus joazeiro (n = 10) e Azadirachta indica (n = 14), localizadas próximas aos ambientes de onde foram obtidas as leveduras analisadas. Além disso, foi avaliada a sensibilidade in vitro das cepas ambientais de Cryptococcus spp. frente a anfotericina B, azólicos e caspofungina. A partir das amostras estocadas, oriundas de excretas, foram identificados C. neoformans var. neoformans (27,8%), C. laurentii (8,3%) e outras leveduras (63,9%), enquanto dos espécimes provenientes da cloaca não obteve-se nenhum isolado de Cryptococcus spp. Para as amostras vegetais, vale destacar que, Cryptococcus spp. não foi isolado, obtendo-se apenas uma cepa de C. glabrata. Resistência aos azólicos foi detectada em somente uma cepa ambiental de C. neoformans, a qual foi resistente para itraconazol (CIM=1 µg/ml). Outro objetivo desse estudo foi realizar um estudo comparativo entre métodos manuais (características morfológicas e perfil bioquímico), semi-automatizado API 20C AUX, automatizado Vitek 2 e PCR-REA na identificação de Cryptococcus spp. obtidos de fontes ambientais (n=13) e clínicas (n=22). Adicionalmente, determinou-se as variedades e sorotipos das cepas analisadas. Considerando-se o método manual como padrão-ouro de identificação, O PCR-REA foi o método diagnóstico mais rápido e que apresentou relação significativa com o método manual. O último objetivo desse estudo foi caracterizar o perfil mating-type das cepas ambientais e clínicas de Cryptococcus spp. Logo, por PCR, foi possível verificar que as cepas de Cryptococcus spp. avaliadas eram do tipo α-mating-type. Por fim, a importância dessa pesquisa concentrou-se em buscar novos nichos ecológicos de Cryptococcus spp. em fontes vegetais; investigar o fenômeno de resistência antifúngica primária em cepas ambientais do fungo estudado, avaliar que método diagnóstico apresenta mais vantagens na identificação de Cryptococcus spp., incluindo a determinação das variedades e sorotipos das espécies de C. neoformans e C. gattii; e determinar o perfil mating-type dos nossos isolados. Palavras-chave: Cryptococcus spp. Resistência Antifúngica. PCR. Mating-type
publishDate 2009
dc.date.none.fl_str_mv 2009
2010-02-22T00:00:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://siduece.uece.br/siduece/trabalhoAcademicoPublico.jsf?id=58500
url https://siduece.uece.br/siduece/trabalhoAcademicoPublico.jsf?id=58500
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual do Ceará
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual do Ceará
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UECE
instname:Universidade Estadual do Ceará
instacron:UECE
instname_str Universidade Estadual do Ceará
instacron_str UECE
institution UECE
reponame_str Repositório Institucional da UECE
collection Repositório Institucional da UECE
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UECE - Universidade Estadual do Ceará
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1828296345776029696