Comparação de diferentes métodos moleculares na detecção do vírus da necrose infecciosa do baço e do rim (ISNVK) em peixes nativos brasileiros cultivados

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Rocha, Francisco Eduardo Pereira
Orientador(a): Pereira, Ulisses de Pádua
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/18754
Resumo: Tucunaré (Cichla ocellaris) e o acará (Geophagus brasiliensis) são ciclídeos sul-americanos muito desejados por pescadores e aquaristas. No Brasil, desde 2017, há um número crescente de surtos de vírus da necrose infecciosa do baço e do rim (ISKNV) na produção de tilápia. Neste estudo, relatamos a detecção de ISKNV em tucunaré e acará-pérola cultivados e a caracterização filogenética da sequência parcial do gene MCP de ambos os espécimes. Para isso, 12 peixes (dez tucunarés e dois acarás-pérola) de uma piscicultura que relatou um pico incomum de mortalidade afetando juvenis e adultos foram submetidos a análises bacteriológicas e virais. Fragmentos de baço, fígado, cérebro e rim de cada peixe foram semeados em Ágar Sangue de carneiro a 5% e Ágar Cistina Coração com 1% de glicose e hemoglobina bovina. Além disso, o DNA extraído de fígado e baço de todos os animais foi submetido à detecção molecular de ISKNV usando dois protocolos de reação em cadeia da polimerase convencional (cPCR) e dois protocolos de nested-PCR (nPCR). Os amplicons obtidos foram confirmados por sequenciamento de nucleotídeos. Nenhuma bactéria foi isolada nos peixes. O DNA doe ISKNV foi identificado em todos os fragmentos de fígado e baço de peixes analisados, em pelo menos dois dos protocolos de PCR usados. Até onde sabemos, este é o primeiro relato de ISKNV nessas espécies nativas brasileiras, tucunaré e acará-pérola, causando alta mortalidade. As sequências de nucleotídeos derivadas desses animais mostraram alta identidade com cepas previamente identificadas em tilápias e carpas de diferentes regiões brasileiras, indicando uma possível transmissão interespécies do vírus. No entanto, estudos adicionais são necessários para entender melhor a patogênese viral e, assim, estabelecer medidas profiláticas assertivas para reduzir os danos causados pela infecção viral.
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Para isso, 12 peixes (dez tucunarés e dois acarás-pérola) de uma piscicultura que relatou um pico incomum de mortalidade afetando juvenis e adultos foram submetidos a análises bacteriológicas e virais. Fragmentos de baço, fígado, cérebro e rim de cada peixe foram semeados em Ágar Sangue de carneiro a 5% e Ágar Cistina Coração com 1% de glicose e hemoglobina bovina. Além disso, o DNA extraído de fígado e baço de todos os animais foi submetido à detecção molecular de ISKNV usando dois protocolos de reação em cadeia da polimerase convencional (cPCR) e dois protocolos de nested-PCR (nPCR). Os amplicons obtidos foram confirmados por sequenciamento de nucleotídeos. Nenhuma bactéria foi isolada nos peixes. O DNA doe ISKNV foi identificado em todos os fragmentos de fígado e baço de peixes analisados, em pelo menos dois dos protocolos de PCR usados. Até onde sabemos, este é o primeiro relato de ISKNV nessas espécies nativas brasileiras, tucunaré e acará-pérola, causando alta mortalidade. As sequências de nucleotídeos derivadas desses animais mostraram alta identidade com cepas previamente identificadas em tilápias e carpas de diferentes regiões brasileiras, indicando uma possível transmissão interespécies do vírus. No entanto, estudos adicionais são necessários para entender melhor a patogênese viral e, assim, estabelecer medidas profiláticas assertivas para reduzir os danos causados pela infecção viral.Peacock bass (syn.: tucunaré, Cichla ocellaris) and pearl cichlid (syn.: acará, Geophagus brasiliensis) are South American cichlids highly desired in the fish angling and aquarist community. In Brazil, there has been a crescent number of outbreaks of infectious spleen and kidney necrosis virus (ISKNV) in tilapia production since 2017. In this study, we report the detection of ISKNV in farmed peacock bass and pearl cichlid and the phylogenetic characterization of the partial sequence of MCP gene from both specimens. For this, 12 fish (ten peacock bass and two pearl cichlids) from a fish farm that reported an unusual peak in mortality affecting juveniles and adults, were subjected to bacteriological and viral analyses. Spleen, liver, brain and kidney fragments from each fish were streaked on 5% sheep blood agar and cystine heart agar with 1% glucose and bovine haemoglobin. Additionally, DNA extracted from the liver and spleen of all animals was subjected to molecular detection of ISKNV using two conventional polymerase chain reaction (cPCR) and two nested-PCR protocols (nPCR). The amplicons obtained were confirmed by nucleotide sequencing. No bacteria were isolated from the fish. ISKNV DNA was identified in all fish liver and spleen fragments analyzed, in at least two of the used PCR protocols. To the best of our knowledge, this is the first report of ISKNV in these native Brazilian species, peacock bass and pearl cichlids, causing mortality outbreaks. The nucleotide sequences derived from these animals showed high identity with strains previously identified in tilapia and carps from different Brazilian regions, indicating a possible interspecies transmission of the virus. However, additional studies are needed to better understand viral pathogenesis and thus establish assertive prophylactic measures to reduce the damage caused by viral infection.porCiências Agrárias - Medicina VeterináriaCiências Agrárias - Medicina VeterináriaAquacultureFish diseaseMolecular diagnosticPeacock bassPearl cichlidIridovirusPeacock bass (Fish)AcaraAquiculturaDoenças em PeixesDiagnóstico MolecularTucunaréAcaráIridovirusDiagnóstico molecularTucunaré (Peixe)Acará (Peixe)Comparação de diferentes métodos moleculares na detecção do vírus da necrose infecciosa do baço e do rim (ISNVK) em peixes nativos brasileiros cultivadosComparison of different molecular detection methods in the detection of infectious spleen and kidney necrosis virus (ISNVK) in cultivated Brazilian native fishinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisCCA - Departamento de Clínicas VeterináriasPrograma de Pós-Graduação em Ciência AnimalUniversidade Estadual de Londrina - UEL-1-1reponame:Repositório Institucional da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccessMestrado AcadêmicoCentro de Ciências AgráriasORIGINALCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP.pdfCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP.pdfTexto completo. Id. 193463application/pdf390766https://repositorio.uel.br/bitstreams/2b2e236c-2457-4585-b710-2c3ee9d62f2e/download1b22efa96306853de7f2cb197761d010MD51CA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP_TERMO.pdfCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP_TERMO.pdfTermo de autorização.application/pdf93890https://repositorio.uel.br/bitstreams/666a1d56-b852-4b69-b641-06c3a2d8f758/download9a0de4ab402b59d841488d0707c566b9MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8555https://repositorio.uel.br/bitstreams/26eb9e48-c7f0-43eb-86f2-ec738cddc7d3/downloadb0875caec81dd1122312ab77c11250f1MD53TEXTCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP.pdf.txtCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP.pdf.txtExtracted texttext/plain70420https://repositorio.uel.br/bitstreams/39dbbd21-53eb-4a56-b075-b4bbe6e85927/download77a30043a922280b8344039b1078797cMD54CA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP_TERMO.pdf.txtCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP_TERMO.pdf.txtExtracted texttext/plain2004https://repositorio.uel.br/bitstreams/9dd86a4b-b56b-4d24-9777-7157e4c26b6e/download8cd8e61e802779087c156197480d1009MD56THUMBNAILCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP.pdf.jpgCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4196https://repositorio.uel.br/bitstreams/8526f09f-084a-41ab-a2b1-216f5e0cf63d/download6f3f4a20407d7868114e1b21049286f0MD55CA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP_TERMO.pdf.jpgCA_ANI_Me_2023_Rocha_Francisco_EP_TERMO.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4894https://repositorio.uel.br/bitstreams/5100e684-b83d-4f8e-8fd3-be42add62e9d/download08c9bcb106f24da4ff6d14c0fd9d09fdMD57123456789/187542025-10-13 10:42:25.821open.accessoai:repositorio.uel.br:123456789/18754https://repositorio.uel.brBiblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2025-10-13T13:42:25Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)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