Taxonomia e filogenia de microssimbiontes de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) com o uso da metodologia de MLSA (multilocus sequence analysis)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Ribeiro, Renan Augusto
Orientador(a): Barcellos, Fernando Gomes [Orientador]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Rizóbio
Filogenia
Taxonomia microbiana
Microbiologia molecular
Rhizobium
Microbial taxonomists
Rhizobium - Phylogeny
Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/10667
Resumo: Resumo: Os rizóbios são bactérias que vivem em simbiose com algumas leguminosas Atualmente, a filogenia dos rizóbios, assim como de outros procariotos é baseada, principalmente, no gene ribossomal 16S, embora alguns estudos tenham demonstrado que os genes ribossomais podem, ocasionalmente, sofrer transferência lateral e recombinação genética, fazendo com que os resultados nem sempre possam refletir a verdadeira filogenia procariótica Com o objetivo de minimizar esses efeitos foi proposta a técnica de MLSA (Multilocus Sequence Analysis), que utiliza mais que um locus gênico, resultando em uma análise mais precisa Neste estudo, foram utilizadas 18 estirpes de rizóbios microssimbiontes do feijoeiro, com o objetivo de correlacioná-las taxonomicamente e filogeneticamente, através da técnica de MLSA, utilizando cinco genes conservados e essenciais ao metabolismo microbiano (genes houseekeping) além do gene ribossomal 16S As espécies de rizóbios descritas como simbiontes de feijão formaram grupos separados, tanto nas análises dos genes separadamente como na análise dos genes concatenados As similaridades das sequências dos genes entre as cinco espécies tipo variaram de 95 a 1% para o gene ribossomal 16S e de 83 a 99% para os outros 5 genes Os cinco genes podem assim ser utilizados como marcadores para o gênero Rhizobium, e com isso auxiliarão na identificação de rizóbios que venham a ser isolados O MLSA também revelou uma grande diversidade genética entre as estirpes classificadas como R tropici, demonstrando a evidência de novas espécies
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however, this marker fails to discriminate some closely related species In this study we have established the first multilocus sequence analysis (MLSA) scheme for the identification and classification of rhizobial microsymbionts of common bean (Phaseolus vulgaris L) We have analyzed eighteen strains, including type strains and representatives of the biodiversity present in Brazilian soils, by means of sequencing recA, dnaK, gltA, glnII and rpoA genes Gene sequence similarities among the five type strains ranged from 95 to 1% for the 16S rRNA, and from 83 to 99% for the other five genes Rhizobial species described as symbionts of common bean have also formed separated groups on the analysis of single and concatenated gene sequences, and clusters formed in each tree were 39 in good mutual agreement The five additional loci may thus be considered as useful markers for the genus Rhizobium, and will allow underpinning the online identification of rhizobial isolates The MLSA also revealed broad genetic diversity among strains classified as R tropici, providing evidence of new speciesporRizóbioRizóbioFilogeniaTaxonomia microbianaMicrobiologia molecularRhizobiumMicrobial taxonomistsRhizobium - PhylogenyTaxonomia e filogenia de microssimbiontes de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) com o uso da metodologia de MLSA (multilocus sequence analysis)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisMestradoMicrobiologiaCentro de Ciências BiológicasPrograma de Pós-Graduação em Microbiologia-1-1reponame:Repositório Institucional da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccess114073vtls000129369SIMvtls000129369http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls00012936964.00SIMhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls0001293691105.pdf123456789/2502 - Mestrado - MicrobiologiaORIGINAL1105.pdfapplication/pdf406494https://repositorio.uel.br/bitstreams/29f2879b-dbea-4645-b3b8-d7cdb649cdc3/download57da384db0f8f84445e3d3072be8bb32MD51Termoapplication/pdf50616https://repositorio.uel.br/bitstreams/8bcf3f35-0ac4-41ff-8ee3-1ba7dd3ea9d7/download6a7ec1100f99e4a31f65a96c5092e79fMD55LICENCElicence.txttext/plain263https://repositorio.uel.br/bitstreams/6af80f9c-c10d-49d3-9714-40936977a78b/download753f376dfdbc064b559839be95ac5523MD52TEXT1105.pdf.txt1105.pdf.txtExtracted texttext/plain105746https://repositorio.uel.br/bitstreams/d7aa76d0-b2e4-42b8-8923-6caee9bccdb6/download241bf91f881ab29337cc125e38747c81MD53Termo.txtTermo.txtExtracted texttext/plain4https://repositorio.uel.br/bitstreams/3a0b84c4-9f6e-49d3-8db8-ff99f66bc2ad/downloadff4c8ff01d544500ea4bfea43e6108c1MD56THUMBNAIL1105.pdf.jpg1105.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3731https://repositorio.uel.br/bitstreams/91e30294-940d-47d9-adbb-fbbab10ef153/download704080569e8df05fb2cce0a4ca563c77MD54Termo.jpgTermo.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg5095https://repositorio.uel.br/bitstreams/3526048d-4b7b-4559-ae45-ef0eb163ad33/downloadd574ba7e382f9a82fcf2da68278f3c3bMD57123456789/106672025-05-01 03:05:03.468open.accessoai:repositorio.uel.br:123456789/10667https://repositorio.uel.brBiblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2025-05-01T06:05:03Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)false
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