Fatores de transcrição da família ERF em coffea arabica : identificação e avaliação transcricional em estresses abióticos

• Ano de defesa: 2011
• Autor(a) principal: Souza, Silvia Gracielle Hülse
• Orientador(a): Carpentieri-Pípolo, Valéria [Orientador]
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Café; Melhoramento genético; Genética; Expressão; Plantas; Coffee; Breeding; Genes; Expression; Plants - Molecular genetics
• Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/12232

Resumo: Os fatores de transcrição ethylene response factor (ERF) desempenham importante papel no desenvolvimento e na expressão dos genes que regulam a resposta de defesa em plantas Sendo assim, o objetivo desse estudo foi identificar os fatores de transcrição ERFs presentes no banco de dados de ESTs em Coffea arabica e avaliar a atividade transcricional de 13 ERFs no cafeeiro, sob diversas condições de estresses abióticos Para isso, foram realizadas buscas dentro do banco de dados do Projeto Genoma Café para a identificação e caracterização dos fatores de transcrição ERFs Foram identificados 36 ERFs em Coffea arabica com o domínio completo AP2/ERF A identificação dos domínios AP2/ERF foram conservados entre C arabica e Arabidopsis A análise in silico do perfil de expressão gênica mostrou que níveis elevados de expressão foram observados em bibliotecas derivadas de tecidos de frutos, folhas, flores e em bibliotecas submetidas à estresse hídrico A partir da análise in silico, 13 ERFs pertencentes a oito grupos da família ERF foram selecionados e as análises de expressão sob estresses hídrico, salino e térmico foram realizadas No que se refere ao estresse hídrico foi observado que, através da análise do perfil transcricional dentro da subfamília DREB, CaERF1 teve um aumento transcricional acentuado em plantas submetidas a déficit hídrico severo, enquanto que atividade transcricional de CaERF9 decresceu durante o mesmo estresse Dentro da subfamília ERF, em todos os CaERFs, o máximo acúmulo de transcritos ocorreu no déficit hídrico severo Foi também possivel observar que os grupos VIII e IX apresentaram padrões distintos de expressão no estresse hídrico No estresse salino, dentre os membros da subfamília DREB, o máximo acúmulo de transcritos ocorreu seis dias após o início do estresse para CaERF1 e CaERF9 Dentre os membros da subfamília ERF, os genes CaERF3 e CaERF22 apresentaram o máximo acúmulo de transcritos 2 e 4 dias após o início do tratamento, respectivamene Em CaERF19 e CaERF29, foi observado um aumento da atividade transcricional no sexto dia de estresse Entretanto, para os genes CaERF27 e CaERF31 o padrão de transcrição se manteve alto em plantas com 12 dias de estresse salino Durante o estresse térmico, dentro da subfamília DREB, nos genes CaERF1 e CaERF6 o acúmulo de transcritos se deu de forma gradual no início do estresse, atingindo o máximo cinco dias após o início tratamento Dentro os membros da família ERF, os genes CaERF3 e CaERF31 apresentaram acentuado acúmulo no quinto dia de tratamento A expressão do gene CaERF19 também foi analisada por q-PCR durante os estresses térmico, salino e hídrico, onde foi observada a indução da expressão nos três estresses A indução da expressão da família ERF, em resposta a mais de um estresse, sugere que existe uma resposta cruzada (crosstalk) entre as diferentes vias de sinalização dos diferentes estresses Os dados gerados neste trabalho fornecem subsídios para selecionar o melhores candidatos para futuras análises funcionais da família ERF em C arabica, os quais ajudarão a compreender os determinantes genéticos da tolerância aos estresses abióticos, o que constitui um passo importante nos programas de melhoramento genético do cafeeiro