Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Silva, Nathalia Volpi e
Orientador(a): Pereira, Luiz Filipe Protasio
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/13530
Resumo: Resumo: A maturação de frutos do cafeeiro é um processo bioquímico e fisiológico que altera cor, sabor aroma e textura Esses processos envolvem a expressão de diferentes enzimas e proteínas tais como as expansinas, responsáveis por promoverem o relaxamento da parede celular A caracterização do padrão de expressão de expansinas do cafeeiro (CaExp1, 2 e 3) em diferentes tecidos do fruto despertou o interesse no estudo da região promotora desses genes Deste modo este trabalho teve por objetivo clonar as regiões promotoras dos genes, CaExp1, CaExp2 e CaExp3 de C arabica em duas cultivares IAPAR 59 e IAPAR 59 Graúdo; comparar e caracterizar in silico as regiões promotoras assim como validar a função do promotor (ProCaExp2) Os fragmentos dos promotores foram gerados utilizando o kit Genome Walker e ligados ao vetor PCR 21–TOPO As sequencias foram comparadas utilizando os bancos de dados: PLACE, RegSite, MatInspector e PlantCare A análise in silico dos promotores revelou a presença de motivos de resposta a luminosidade nos quatro promotores Também foi observada a presença de motivos para fitorreguladores como etileno e auxina no ProCaExp2 e ABA, Brassinosteróides e GA nos ProCaExp1 e ProCaExp3 O ProCaExp2 foi fusionado ao gene GUSA e inserido via A tumefaciens no tomateiro A análise histomíquica do gene GUSA foi realizada em diferentes tecidos das plantas transformadas e controles não transformados A análise da expressão do gene GUSA demonstrou que o ProCaExp2 direciona a expressão do gene para o endosperma antes do início da maturação e para o endosperma e polpa durante a maturação do fruto A disponibilidade de promotores específicos é uma importante ferramenta biotecnológica para direcionar a expressão de genes para os frutos sem interferir em outros processos metabólicos das plantas
id UEL_f6424484d4fb8b3f84dba34cd547d301
oai_identifier_str oai:repositorio.uel.br:123456789/13530
network_acronym_str UEL
network_name_str Repositório Institucional da UEL
repository_id_str
spelling Silva, Nathalia Volpi eAbdelnoor, Ricardo Vilela8b6fa77d-0c49-4ef1-90eb-82eaa79b9d35-1Molinari, Hugo Bruno Correa4935d8eb-e460-43d4-b5de-9321fc14b6ea-1627e8866-237a-4e0a-8516-b19e70c935bdc9f9acd9-3cfa-4505-95f1-c40b664767ebPereira, Luiz Filipe ProtasioLondrina2024-05-01T14:15:51Z2024-05-01T14:15:51Z2012.0015.02.2012https://repositorio.uel.br/handle/123456789/13530Resumo: A maturação de frutos do cafeeiro é um processo bioquímico e fisiológico que altera cor, sabor aroma e textura Esses processos envolvem a expressão de diferentes enzimas e proteínas tais como as expansinas, responsáveis por promoverem o relaxamento da parede celular A caracterização do padrão de expressão de expansinas do cafeeiro (CaExp1, 2 e 3) em diferentes tecidos do fruto despertou o interesse no estudo da região promotora desses genes Deste modo este trabalho teve por objetivo clonar as regiões promotoras dos genes, CaExp1, CaExp2 e CaExp3 de C arabica em duas cultivares IAPAR 59 e IAPAR 59 Graúdo; comparar e caracterizar in silico as regiões promotoras assim como validar a função do promotor (ProCaExp2) Os fragmentos dos promotores foram gerados utilizando o kit Genome Walker e ligados ao vetor PCR 21–TOPO As sequencias foram comparadas utilizando os bancos de dados: PLACE, RegSite, MatInspector e PlantCare A análise in silico dos promotores revelou a presença de motivos de resposta a luminosidade nos quatro promotores Também foi observada a presença de motivos para fitorreguladores como etileno e auxina no ProCaExp2 e ABA, Brassinosteróides e GA nos ProCaExp1 e ProCaExp3 O ProCaExp2 foi fusionado ao gene GUSA e inserido via A tumefaciens no tomateiro A análise histomíquica do gene GUSA foi realizada em diferentes tecidos das plantas transformadas e controles não transformados A análise da expressão do gene GUSA demonstrou que o ProCaExp2 direciona a expressão do gene para o endosperma antes do início da maturação e para o endosperma e polpa durante a maturação do fruto A disponibilidade de promotores específicos é uma importante ferramenta biotecnológica para direcionar a expressão de genes para os frutos sem interferir em outros processos metabólicos das plantasDissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularAbstract: The maturation of coffee fruits is a physiological and biochemical process that changes color, flavor, aroma and texture These processes involve the expression of different enzymes and proteins such as expansins, responsible for promoting the cell wall expansion The characterization of expression pattern of expansions (CaExp1, CaExp2, CaExp3) in different fruit tissues in coffee instigate the interest in the promoter region of these genes Thus, this study aimed to clone the promoter regions of genes, CaExp1, CaExp2 and CaExp3 in two cultivars of C arabica: IAPAR 59 and 59 IAPAR Graúdo in order to compare in silico these promoter regions and to validate the function of the promoter (ProCaExp2) Promoter fragments were generated using the Genome Walker kit and ligated to PCR 21-TOPO vector These sequences were compared using the databases: PLACE, RegSite, MatInspector and PlantCare The ProCaExp2 was fused to the GUSA gene and inserted via A tumefaciens in tomato In silico analysis of the promoters revealed the presence of motifs responsive to light in the four promoters analysed Furthermore, we also detected the presence of motifs for growth regulators such as ethylene and auxin in ProCaExp2; and ABA, brassinosteroids and GA in ProCaExp1 and ProCaExp3 The histochemical analysis of the GUSA gene was accomplished in different stages of development in transformed and non transformed plants The expression of gene GUSA demonstrated that the ProCaExp2 drives the gene expression to the endosperm before the beginning of maturation and for the endosperm and pericarp during maturation of the fruit The availability of specific promoters is an important biotechnological tool to direct the expression of genes for fruit without interfering with other metabolic processes of plantsporCaféMelhoramento genéticoGenéticaExpressãoCaféBreedingExpressionRipeningMolecular cloningPlants - CoffeeGenesClonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabicainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisMestradoGenética e Biologia MolecularCentro de Ciências BiológicasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular-1600reponame:Repositório Institucional da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccess157820vtls000176356SIMvtls000176356http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls00017635664.00SIMhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls0001763563082.pdf123456789/2402 - Mestrado - Genética e Biologia MolecularORIGINAL3082.pdfapplication/pdf2003652https://repositorio.uel.br/bitstreams/ddf5ae63-e01d-4b5c-93e8-29df6aeaa2cb/download963189dec7a166e918d817896eec39fcMD51LICENCElicence.txttext/plain263https://repositorio.uel.br/bitstreams/1f7fdd0c-5e8b-43c4-bab3-fe190c528169/download753f376dfdbc064b559839be95ac5523MD52TEXT3082.pdf.txt3082.pdf.txtExtracted texttext/plain187626https://repositorio.uel.br/bitstreams/ed09b30b-5c2d-4cf8-a003-37dcca2c00a6/download02756f4c95f8ec06d5b6cccd4b015f84MD53THUMBNAIL3082.pdf.jpg3082.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3590https://repositorio.uel.br/bitstreams/26fd8eaf-0e11-4c5e-9035-abce98b8fe8a/downloadcab260a3079e553a2a0246b6f54e3d56MD54123456789/135302025-04-03 16:18:42.215open.accessoai:repositorio.uel.br:123456789/13530https://repositorio.uel.brBiblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2025-04-03T19:18:42Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica
title Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica
spellingShingle Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica
Silva, Nathalia Volpi e
Café
Melhoramento genético
Genética
Expressão
Café
Breeding
Expression
Ripening
Molecular cloning
Plants - Coffee
Genes
title_short Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica
title_full Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica
title_fullStr Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica
title_full_unstemmed Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica
title_sort Clonagem e caracterização de promotores de três isoformas de expansinas de Coffea arabica
author Silva, Nathalia Volpi e
author_facet Silva, Nathalia Volpi e
author_role author
dc.contributor.banca.pt_BR.fl_str_mv Abdelnoor, Ricardo Vilela
Molinari, Hugo Bruno Correa
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Nathalia Volpi e
dc.contributor.authorID.fl_str_mv 627e8866-237a-4e0a-8516-b19e70c935bd
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv c9f9acd9-3cfa-4505-95f1-c40b664767eb
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Pereira, Luiz Filipe Protasio
contributor_str_mv Pereira, Luiz Filipe Protasio
dc.subject.por.fl_str_mv Café
Melhoramento genético
Genética
Expressão
Café
Breeding
Expression
Ripening
Molecular cloning
Plants - Coffee
Genes
topic Café
Melhoramento genético
Genética
Expressão
Café
Breeding
Expression
Ripening
Molecular cloning
Plants - Coffee
Genes
description Resumo: A maturação de frutos do cafeeiro é um processo bioquímico e fisiológico que altera cor, sabor aroma e textura Esses processos envolvem a expressão de diferentes enzimas e proteínas tais como as expansinas, responsáveis por promoverem o relaxamento da parede celular A caracterização do padrão de expressão de expansinas do cafeeiro (CaExp1, 2 e 3) em diferentes tecidos do fruto despertou o interesse no estudo da região promotora desses genes Deste modo este trabalho teve por objetivo clonar as regiões promotoras dos genes, CaExp1, CaExp2 e CaExp3 de C arabica em duas cultivares IAPAR 59 e IAPAR 59 Graúdo; comparar e caracterizar in silico as regiões promotoras assim como validar a função do promotor (ProCaExp2) Os fragmentos dos promotores foram gerados utilizando o kit Genome Walker e ligados ao vetor PCR 21–TOPO As sequencias foram comparadas utilizando os bancos de dados: PLACE, RegSite, MatInspector e PlantCare A análise in silico dos promotores revelou a presença de motivos de resposta a luminosidade nos quatro promotores Também foi observada a presença de motivos para fitorreguladores como etileno e auxina no ProCaExp2 e ABA, Brassinosteróides e GA nos ProCaExp1 e ProCaExp3 O ProCaExp2 foi fusionado ao gene GUSA e inserido via A tumefaciens no tomateiro A análise histomíquica do gene GUSA foi realizada em diferentes tecidos das plantas transformadas e controles não transformados A análise da expressão do gene GUSA demonstrou que o ProCaExp2 direciona a expressão do gene para o endosperma antes do início da maturação e para o endosperma e polpa durante a maturação do fruto A disponibilidade de promotores específicos é uma importante ferramenta biotecnológica para direcionar a expressão de genes para os frutos sem interferir em outros processos metabólicos das plantas
publishDate 2024
dc.date.defesa.pt_BR.fl_str_mv 15.02.2012
dc.date.created.fl_str_mv 2012.00
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-05-01T14:15:51Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-05-01T14:15:51Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.uel.br/handle/123456789/13530
url https://repositorio.uel.br/handle/123456789/13530
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.confidence.fl_str_mv -1
600
dc.relation.coursedegree.pt_BR.fl_str_mv Mestrado
dc.relation.coursename.pt_BR.fl_str_mv Genética e Biologia Molecular
dc.relation.departament.pt_BR.fl_str_mv Centro de Ciências Biológicas
dc.relation.ppgname.pt_BR.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.coverage.spatial.pt_BR.fl_str_mv Londrina
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UEL
instname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)
instacron:UEL
instname_str Universidade Estadual de Londrina (UEL)
instacron_str UEL
institution UEL
reponame_str Repositório Institucional da UEL
collection Repositório Institucional da UEL
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.uel.br/bitstreams/ddf5ae63-e01d-4b5c-93e8-29df6aeaa2cb/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/1f7fdd0c-5e8b-43c4-bab3-fe190c528169/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/ed09b30b-5c2d-4cf8-a003-37dcca2c00a6/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/26fd8eaf-0e11-4c5e-9035-abce98b8fe8a/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 963189dec7a166e918d817896eec39fc
753f376dfdbc064b559839be95ac5523
02756f4c95f8ec06d5b6cccd4b015f84
cab260a3079e553a2a0246b6f54e3d56
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)
repository.mail.fl_str_mv bcuel@uel.br||
_version_ 1865915219106070528