Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2018
Autor(a) principal: Cardim, Sérgio Tosi
Orientador(a): Garcia, João Luis
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/17998
Resumo: A coccidiose bovina é uma enfermidade de grande importância em rebanhos bovinos ao redor do mundo. Esta enfermidade é causada por protozoários, do gênero Eimeria e afeta principalmente animais com menos de 12 meses, sendo as espécies E. bovis e E. zuernii as de maior importância clínica, podendo causar diarréia severa com sangue em bezerros infectados. O diagnóstico de rotina desta doença é realizado através da observação morofológica dos oocisto, os quais precisam estar esporulados para identificação da espécie envolvida, o que leva em torno de 10 a 15 dias,tornando o mesmo muito laborioso e com necessidade de alto treinamento do leitor, dificuldando um diagnóstico mais rápido e consequente tratamento mais rápido dos animais. Devido as estes fatores, o objetivo deste trabalho foi desenvolver técnicas de qPCR para o diagnóstico do gênero Eimeria e das espécies de maior patogenia, E. bovis e E. zuernii. Para isto foram selecionados o gene 18S rRNA para o gênero Eimeria e o gene ITS-1 para diferenciação das espécies, isto porque o gene 18S tem pouca variabilidade entre as espécies enquanto o gene ITS-1 tem uma alta variabilidade interespecifica, com baixa variabilidade dentro da espécie, visando assim uma alternativa de diagnóstico mais rápida e sensível. As PCRs foram realizadas utilizando SYBR Green como fonte de fluorenscencia. Tanto os primers desenvolvidos para o gênero, quanto os desenvolvidos para a espécie E. zuernii apresentaram alta sensibilidade, tendo a capacidade de amplificar amostrar contendo apenas um oocisto do parasita. Já os primers desenvolvidos para E. bovis apresentaram uma sensibilidade inferior, sendo capazes de detectar positividade em amostras de campo contendo 50 oocistos por grama de fezes. Para avaliação da especificidade das técnicas foram utilizadas amostras contendo Cryptosporidium spp. e Giardia spp., sendo que todas as técnicas apresentaram negatividade tanto para Giardia spp., quanto para Cryptosporidium spp. Baseado nos resultados encontrados neste estudo, conclui-se que os primers desenvolvidos apresentaram alta sensibilidade e especificidade no diagnóstico de Eimeria em bovinos
id UEL_b1242e6794844191d7dc19e0aa679d4e
oai_identifier_str oai:repositorio.uel.br:123456789/17998
network_acronym_str UEL
network_name_str Repositório Institucional da UEL
repository_id_str
spelling Cardim, Sérgio TosiCrhyssafidis, Andréas Lazarosf2b1e28b-c461-4278-bfa7-f075af8ab8f5-1Breganó, Regina Mitsukac18b489b-e8e5-4b24-b4e3-abb87fd9d881-1Guimarães Junior, José da Silvab70fb1ab-c9a9-4908-9092-2a3d8c431432-1Alexey Leon Gomel Bogado135af359-1629-4057-9dd2-1304c5b62699-17c235fa5-3b4a-4653-8800-ab76c49e8ee554c6822e-fbe0-42c1-8a40-3b0ced6c98f0Garcia, João LuisLondrina - PR69 p.2024-10-10T13:44:57Z2024-10-10T13:44:57Z2018-02-28https://repositorio.uel.br/handle/123456789/17998A coccidiose bovina é uma enfermidade de grande importância em rebanhos bovinos ao redor do mundo. Esta enfermidade é causada por protozoários, do gênero Eimeria e afeta principalmente animais com menos de 12 meses, sendo as espécies E. bovis e E. zuernii as de maior importância clínica, podendo causar diarréia severa com sangue em bezerros infectados. O diagnóstico de rotina desta doença é realizado através da observação morofológica dos oocisto, os quais precisam estar esporulados para identificação da espécie envolvida, o que leva em torno de 10 a 15 dias,tornando o mesmo muito laborioso e com necessidade de alto treinamento do leitor, dificuldando um diagnóstico mais rápido e consequente tratamento mais rápido dos animais. Devido as estes fatores, o objetivo deste trabalho foi desenvolver técnicas de qPCR para o diagnóstico do gênero Eimeria e das espécies de maior patogenia, E. bovis e E. zuernii. Para isto foram selecionados o gene 18S rRNA para o gênero Eimeria e o gene ITS-1 para diferenciação das espécies, isto porque o gene 18S tem pouca variabilidade entre as espécies enquanto o gene ITS-1 tem uma alta variabilidade interespecifica, com baixa variabilidade dentro da espécie, visando assim uma alternativa de diagnóstico mais rápida e sensível. As PCRs foram realizadas utilizando SYBR Green como fonte de fluorenscencia. Tanto os primers desenvolvidos para o gênero, quanto os desenvolvidos para a espécie E. zuernii apresentaram alta sensibilidade, tendo a capacidade de amplificar amostrar contendo apenas um oocisto do parasita. Já os primers desenvolvidos para E. bovis apresentaram uma sensibilidade inferior, sendo capazes de detectar positividade em amostras de campo contendo 50 oocistos por grama de fezes. Para avaliação da especificidade das técnicas foram utilizadas amostras contendo Cryptosporidium spp. e Giardia spp., sendo que todas as técnicas apresentaram negatividade tanto para Giardia spp., quanto para Cryptosporidium spp. Baseado nos resultados encontrados neste estudo, conclui-se que os primers desenvolvidos apresentaram alta sensibilidade e especificidade no diagnóstico de Eimeria em bovinosBovine coccidiosis is a disease of great importance in cattle herds around the world. This disease is caused by protozoa of genus Eimeria and mainly affects animals less than 12 months old. E. bovis and E. zuernii species are the most clinically important and can cause severe diarrhea with blood in infected calves. The routine diagnosis of this disease is made through the morphological observation of oocysts, which need to be sporulated to identify the species involved, process can take around 10 to 15 days, making it very laborious and in need of high training of the reader, hindering a faster diagnosis and consequent faster treatment of the animals. Due to these factors, the objective of this study was to develop qPCR techniques for the diagnosis of genus Eimeria and species with greatest pathogenesis, E. bovis and E. zuernii. The 18S rRNA gene for genus Eimeria and the ITS-1 gene for species differentiation were selected because the 18S gene has low variability among the species while the ITS-1 gene has a high interspecific variability with low variability within species, aiming at a faster and more sensitive diagnostic alternative. The PCRs were performed using SYBR Green as a source of fluorenscence. Both primers developed for genus and those developed for E. zuernii species presented high sensitivity, having the ability to amplify sample containing only one oocyst of the parasite. The primers developed for E. bovis had a lower sensitivity and were able to detect positivity in field samples containing 50 oocysts per gram of faeces. To evaluate the specificity of the techniques, samples containing Cryptosporidium spp. and Giardia spp. were used and all of which showed negativity for both. Based on the results found in this study, it was concluded that the primers developed showed high sensitivity and specificity in the diagnosis of Eimeria in cattleporporCiências Agrárias - Medicina VeterináriaCiências Agrárias - Medicina VeterináriaEimeriaqPCRE. bovisE. zuerniiBovine coccidiosisEimeria in cattle - DiagnosisEimeriaqPCRE. bovisE. zuerniiCoccidiose bovinaEimeria em bovinos - DiagnósticoDesenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinosDevelopment of qPCR for diagnosis of Eimeria spp. in cattleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisCCA - Departamento de Clínicas VeterináriasPrograma de Pós-Graduação em Ciência AnimalUniversidade Estadual de Londrina - UEL-1-1reponame:Repositório Institucional da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccessDoutoradoCentro de Ciências AgráriasORIGINALCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T.pdfCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T.pdfTexto completo ID. 190830application/pdf916434https://repositorio.uel.br/bitstreams/68c75a8b-4f53-49c5-939d-5f94e9138e81/downloada1eee8062e7a19caf38ac9b294cc1086MD51CA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T_TERMO.pdfCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T_TERMO.pdfTermo de autorizaçãoapplication/pdf396219https://repositorio.uel.br/bitstreams/6330239f-ac76-4b68-a76b-a232f0ef14f6/downloadd0fa390c72966b7a105e99306bb1f2daMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8555https://repositorio.uel.br/bitstreams/f50f7c4f-7bcd-47a9-91d6-678b855acde0/downloadb0875caec81dd1122312ab77c11250f1MD53TEXTCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T.pdf.txtCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T.pdf.txtExtracted texttext/plain92464https://repositorio.uel.br/bitstreams/32031e09-6f1b-40e3-8551-686ab8d2a7a4/downloade40ac35927861db1ac77a8cdfb379b8bMD54CA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T_TERMO.pdf.txtCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T_TERMO.pdf.txtExtracted texttext/plain2https://repositorio.uel.br/bitstreams/0076c746-8879-4c4e-a75d-0c6d6132db26/downloade1c06d85ae7b8b032bef47e42e4c08f9MD56THUMBNAILCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T.pdf.jpgCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3230https://repositorio.uel.br/bitstreams/94e6a7a8-d67d-4e17-93db-df29f864c60a/downloadf5cad5e86eec4872c461819ab3f26e45MD55CA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T_TERMO.pdf.jpgCA_ANI_Dr_2018_Cardim_Sérgio_T_TERMO.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4612https://repositorio.uel.br/bitstreams/094cff66-35de-4d42-a280-dd8a1196a478/downloadb52627d67b9dce626f43b7d3b7bf72beMD57123456789/179982025-04-17 09:27:35.025open.accessoai:repositorio.uel.br:123456789/17998https://repositorio.uel.brBiblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2025-04-17T12:27:35Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)falseQXV0b3Jpem8gYSBkaXZ1bGdhw6fDo28gbm8gUmVwb3NpdMOzcmlvIGRhIFVuaXZlcnNpZGFkZSBFc3RhZHVhbCBkZSBMb25kcmluYSAocmVwb3NpdG9yaW8udWVsLmJyKSwgZSBwZXJtaXRvIGEgcmVwcm9kdcOnw6NvIHRvdGFsIHBvciBtZWlvIGVsZXRyw7RuaWNvLCBzZW0gcmVzc2FyY2ltZW50byBkb3MgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMgZGEgT2JyYSwgYSBwYXJ0aXIgZGEgZGF0YSBpbmRpY2FkYSBubyBhcnF1aXZvIChiaXRzdHJlYW0pLCBvdSBhdMOpIHF1ZSBtYW5pZmVzdGHDp8OjbyBlbSBzZW50aWRvIGNvbnRyw6FyaW8gZGUgbWluaGEgcGFydGUgZGV0ZXJtaW5lIGEgY2Vzc2HDp8OjbyBkZXN0YSBhdXRvcml6YcOnw6NvLiBEZWNsYXJvLCB0YW1iw6ltLCBxdWUgbWUgcmVzcG9uc2FiaWxpem8gcGVsbyBjb250ZcO6ZG8gZGEgb2JyYSBvYmpldG8gZGVzdGEgYXV0b3JpemHDp8Ojbywgc2VuZG8gZGUgbWluaGEgcmVzcG9uc2FiaWxpZGFkZSBxdWFpc3F1ZXIgbWVkaWRhcyBqdWRpY2lhaXMgb3UgZXh0cmFqdWRpY2lhaXMgY29uY2VybmVudGVzIGFvIGNvbnRlw7pkby4K
dc.title.none.fl_str_mv Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos
dc.title.alternative.none.fl_str_mv Development of qPCR for diagnosis of Eimeria spp. in cattle
title Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos
spellingShingle Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos
Cardim, Sérgio Tosi
Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
Eimeria
qPCR
E. bovis
E. zuernii
Coccidiose bovina
Eimeria em bovinos - Diagnóstico
Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
Eimeria
qPCR
E. bovis
E. zuernii
Bovine coccidiosis
Eimeria in cattle - Diagnosis
title_short Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos
title_full Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos
title_fullStr Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos
title_full_unstemmed Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos
title_sort Desenvolvimento de qPCR para diagnóstico de Eimeria spp. em bovinos
author Cardim, Sérgio Tosi
author_facet Cardim, Sérgio Tosi
author_role author
dc.contributor.banca.none.fl_str_mv Crhyssafidis, Andréas Lazaros
Breganó, Regina Mitsuka
Guimarães Junior, José da Silva
Alexey Leon Gomel Bogado
dc.contributor.author.fl_str_mv Cardim, Sérgio Tosi
dc.contributor.authorID.fl_str_mv 7c235fa5-3b4a-4653-8800-ab76c49e8ee5
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv 54c6822e-fbe0-42c1-8a40-3b0ced6c98f0
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Garcia, João Luis
contributor_str_mv Garcia, João Luis
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
topic Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
Eimeria
qPCR
E. bovis
E. zuernii
Coccidiose bovina
Eimeria em bovinos - Diagnóstico
Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
Eimeria
qPCR
E. bovis
E. zuernii
Bovine coccidiosis
Eimeria in cattle - Diagnosis
dc.subject.por.fl_str_mv Eimeria
qPCR
E. bovis
E. zuernii
Coccidiose bovina
Eimeria em bovinos - Diagnóstico
dc.subject.capes.none.fl_str_mv Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
dc.subject.keywords.none.fl_str_mv Eimeria
qPCR
E. bovis
E. zuernii
Bovine coccidiosis
Eimeria in cattle - Diagnosis
description A coccidiose bovina é uma enfermidade de grande importância em rebanhos bovinos ao redor do mundo. Esta enfermidade é causada por protozoários, do gênero Eimeria e afeta principalmente animais com menos de 12 meses, sendo as espécies E. bovis e E. zuernii as de maior importância clínica, podendo causar diarréia severa com sangue em bezerros infectados. O diagnóstico de rotina desta doença é realizado através da observação morofológica dos oocisto, os quais precisam estar esporulados para identificação da espécie envolvida, o que leva em torno de 10 a 15 dias,tornando o mesmo muito laborioso e com necessidade de alto treinamento do leitor, dificuldando um diagnóstico mais rápido e consequente tratamento mais rápido dos animais. Devido as estes fatores, o objetivo deste trabalho foi desenvolver técnicas de qPCR para o diagnóstico do gênero Eimeria e das espécies de maior patogenia, E. bovis e E. zuernii. Para isto foram selecionados o gene 18S rRNA para o gênero Eimeria e o gene ITS-1 para diferenciação das espécies, isto porque o gene 18S tem pouca variabilidade entre as espécies enquanto o gene ITS-1 tem uma alta variabilidade interespecifica, com baixa variabilidade dentro da espécie, visando assim uma alternativa de diagnóstico mais rápida e sensível. As PCRs foram realizadas utilizando SYBR Green como fonte de fluorenscencia. Tanto os primers desenvolvidos para o gênero, quanto os desenvolvidos para a espécie E. zuernii apresentaram alta sensibilidade, tendo a capacidade de amplificar amostrar contendo apenas um oocisto do parasita. Já os primers desenvolvidos para E. bovis apresentaram uma sensibilidade inferior, sendo capazes de detectar positividade em amostras de campo contendo 50 oocistos por grama de fezes. Para avaliação da especificidade das técnicas foram utilizadas amostras contendo Cryptosporidium spp. e Giardia spp., sendo que todas as técnicas apresentaram negatividade tanto para Giardia spp., quanto para Cryptosporidium spp. Baseado nos resultados encontrados neste estudo, conclui-se que os primers desenvolvidos apresentaram alta sensibilidade e especificidade no diagnóstico de Eimeria em bovinos
publishDate 2018
dc.date.issued.fl_str_mv 2018-02-28
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-10-10T13:44:57Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-10-10T13:44:57Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.uel.br/handle/123456789/17998
url https://repositorio.uel.br/handle/123456789/17998
dc.language.iso.fl_str_mv por
por
language por
dc.relation.confidence.fl_str_mv -1
-1
dc.relation.departament.none.fl_str_mv CCA - Departamento de Clínicas Veterinárias
dc.relation.ppgname.none.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal
dc.relation.institutionname.none.fl_str_mv Universidade Estadual de Londrina - UEL
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.coverage.spatial.none.fl_str_mv Londrina - PR
dc.coverage.extent.none.fl_str_mv 69 p.
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UEL
instname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)
instacron:UEL
instname_str Universidade Estadual de Londrina (UEL)
instacron_str UEL
institution UEL
reponame_str Repositório Institucional da UEL
collection Repositório Institucional da UEL
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.uel.br/bitstreams/68c75a8b-4f53-49c5-939d-5f94e9138e81/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/6330239f-ac76-4b68-a76b-a232f0ef14f6/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/f50f7c4f-7bcd-47a9-91d6-678b855acde0/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/32031e09-6f1b-40e3-8551-686ab8d2a7a4/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/0076c746-8879-4c4e-a75d-0c6d6132db26/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/94e6a7a8-d67d-4e17-93db-df29f864c60a/download
https://repositorio.uel.br/bitstreams/094cff66-35de-4d42-a280-dd8a1196a478/download
bitstream.checksum.fl_str_mv a1eee8062e7a19caf38ac9b294cc1086
d0fa390c72966b7a105e99306bb1f2da
b0875caec81dd1122312ab77c11250f1
e40ac35927861db1ac77a8cdfb379b8b
e1c06d85ae7b8b032bef47e42e4c08f9
f5cad5e86eec4872c461819ab3f26e45
b52627d67b9dce626f43b7d3b7bf72be
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)
repository.mail.fl_str_mv bcuel@uel.br||
_version_ 1856675840377487360