Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis
| Ano de defesa: | 2024 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Não Informado pela instituição
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.uel.br/handle/123456789/9004 |
Resumo: | Resumo: Anticarsia gemmatalis Hübner, 1818, (Lepidoptera: Erebidae) ou lagarta-da-soja, é um dos desfolhadores mais comum da soja no Brasil, sendo que as d-endotoxinas produzidas pelo Bacillus thuringiensis Berliner (Bacillales: Bacillaceae) (Bt) têm sido amplamente utilizadas como bioinseticida para o seu controle O modo de ação destas toxinas é bem caracterizado em lepidópteros, no entanto existem muitas questões a respeito dos mecanismos de resistência às toxinas Bt Dessa forma, o presente trabalho teve como objetivo comparar o padrão de expressão gênica para a identificação de locos candidatos ao mecanismo de resistência à linhagem Bacillus thuringiensis subsp kurstaki HD-73, produtora da proteína bioinseticida Cry1Ac em A gemmmatalis Para tanto, o RNA total de linhagens suscetíveis e resistentes de A gemmatalis desafiadas com essa bactéria foi extraído e sequenciado via Illumina® Hiseq 25 Os 241776712 reads paired-end de 126 pb gerados foram montados em 25757 transcritos Desses, 179 apresentaram alinhamentos significativos com as proteínas do banco de dados de proteínas não-redundantes do NCBI A análise de expressão diferencial entre as linhagens de A gemmatalis resistentes e suscetíveis à Bt HD-73 identificou 422 transcritos expressos diferencialmente (log2 fold change = 2 e padj < ,1), dos quais 195 foram regulados positivamente e 227 regulados negativamente nas lagartas resistentes Os genes regulados negativamente nas linhagens resistentes estão relacionados principalmente a atividades proteolíticas, incluindo a tripsina, a quimotripsina e a carboxipeptidase, que participam do processo de ativação das protoxinas Cry de Bt Por outro lado, os genes regulados positivamente são, em sua maioria, envolvidos com processos de desintoxicação, incluindo a esterase, genes que desencadeiam respostas imunes inatas, tal como a lectina do tipo C e a hemolin, bem como genes que regulam a defesa contra patógenos, como os inibidores de proteases, que podem atuar inibindo proteases endógenas ou fatores de virulência de patógenos Este estudo apresenta as primeiras informações do transcriptoma de Anticarsia gemmatalis utilizando novas tecnologias de sequenciamento, e corrobora com a hipótese de uma base genética complexa das respostas fisiológicas e dos mecanismos de resistência selecionados mediante a utilização de Bt |
| id |
UEL_e5b4f3a70562a1acfc4e447d80a2507f |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.uel.br:123456789/9004 |
| network_acronym_str |
UEL |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UEL |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Pezenti, Larissa ForimPontes, Rose Gomes Monnerat Solon de22b800fb-4331-47a5-8f53-adb4eac8b752-1Pereira, Luiz Filipe Protasioa05c63c2-bc00-462c-99af-253008ec369e-1Souza, Rogério Fernandes [Coorientador]2b5d83e3-4033-4d94-a2bd-f6484fb29a73-18c6c9194-53f8-44d9-8131-8b421331179b32fb7f6e-dbb7-4f9e-8197-ff450181d651Rosa, Renata da [Orientador]Londrina2024-05-01T11:46:13Z2024-05-01T11:46:13Z2017.0023.02.2017https://repositorio.uel.br/handle/123456789/9004Resumo: Anticarsia gemmatalis Hübner, 1818, (Lepidoptera: Erebidae) ou lagarta-da-soja, é um dos desfolhadores mais comum da soja no Brasil, sendo que as d-endotoxinas produzidas pelo Bacillus thuringiensis Berliner (Bacillales: Bacillaceae) (Bt) têm sido amplamente utilizadas como bioinseticida para o seu controle O modo de ação destas toxinas é bem caracterizado em lepidópteros, no entanto existem muitas questões a respeito dos mecanismos de resistência às toxinas Bt Dessa forma, o presente trabalho teve como objetivo comparar o padrão de expressão gênica para a identificação de locos candidatos ao mecanismo de resistência à linhagem Bacillus thuringiensis subsp kurstaki HD-73, produtora da proteína bioinseticida Cry1Ac em A gemmmatalis Para tanto, o RNA total de linhagens suscetíveis e resistentes de A gemmatalis desafiadas com essa bactéria foi extraído e sequenciado via Illumina® Hiseq 25 Os 241776712 reads paired-end de 126 pb gerados foram montados em 25757 transcritos Desses, 179 apresentaram alinhamentos significativos com as proteínas do banco de dados de proteínas não-redundantes do NCBI A análise de expressão diferencial entre as linhagens de A gemmatalis resistentes e suscetíveis à Bt HD-73 identificou 422 transcritos expressos diferencialmente (log2 fold change = 2 e padj < ,1), dos quais 195 foram regulados positivamente e 227 regulados negativamente nas lagartas resistentes Os genes regulados negativamente nas linhagens resistentes estão relacionados principalmente a atividades proteolíticas, incluindo a tripsina, a quimotripsina e a carboxipeptidase, que participam do processo de ativação das protoxinas Cry de Bt Por outro lado, os genes regulados positivamente são, em sua maioria, envolvidos com processos de desintoxicação, incluindo a esterase, genes que desencadeiam respostas imunes inatas, tal como a lectina do tipo C e a hemolin, bem como genes que regulam a defesa contra patógenos, como os inibidores de proteases, que podem atuar inibindo proteases endógenas ou fatores de virulência de patógenos Este estudo apresenta as primeiras informações do transcriptoma de Anticarsia gemmatalis utilizando novas tecnologias de sequenciamento, e corrobora com a hipótese de uma base genética complexa das respostas fisiológicas e dos mecanismos de resistência selecionados mediante a utilização de BtDissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularAbstract: Anticarsia gemmatalis Hübner, 1818, (Lepidoptera: Erebidae) or velvetbean caterpillar, is one of the most common defoliants of soybeans in Brazil, and the d-endotoxins produced by Bacillus thuringiensis Berliner (Bacillales: Bacillaceae) (Bt) have been widely used as a bio-insecticide for their control The mode of action of these toxins is well characterized in Lepidoptera, however there are many questions regarding the mechanisms of development of resistance to Bt toxins Thus, the present work had as objective to compare the gene expression pattern for the identification of candidate genes for the resistance mechanism to the Bacillus thuringiensis subsp kurstaki HD-73 strain, which produces the bioinseticida Cry1Ac protein in A gemmmatalis To that end, total RNA from susceptible and resistant A gemmatalis strains challenged with this bacterium was extracted and sequenced by Illumina® Hiseq 25 The 241,776,712 paired-end 126-bp reads generated were assembled into 25,757 transcripts Of these, 17,9 showed significant alignments with the NCBI non-redundant protein database proteins Differential expression analysis between resistant and susceptible strains of A gemmatalis identified 422 differentially expressed transcripts (log2 fold change = 2 and padj <1), of which 195 were down-regulated and 227 down-regulated in resistant velvetbean caterpillars The negatively regulated genes in the resistant strains are related to proteolytic activities, including trypsin, chymotrypsin and carboxypeptidase, which participate in the activation process Cry protoxins On the other hand, positively regulated genes are involved in detoxification processes, including esterase, genes that trigger innate immune responses, such as type C lectin and hemolin, as well as genes that regulate defense against pathogens, such as protease inhibitors, which may act to inhibit endogenous proteases or pathogen virulence factors This study presents the first information of the transcriptome of Anticarsia gemmatalis using new sequencing technologies and corroborates the hypothesis of a complex genetic basis of the physiological responses and mechanisms of resistance selected through the use of BtporLagarta da sojaAnticarsia gemmatalis - LinhagemBacillus thuringiensisCepa HD-73Bacillus thurigiensisAnálise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisMestradoGenética e Biologia MolecularCentro de Ciências BiológicasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular-1-1reponame:Repositório Institucional da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccess7520vtls000225976SIMvtls000225976http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls00022597664.00SIMhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls0002259766505.pdf123456789/2402 - Mestrado - Genética e Biologia MolecularORIGINAL6505.pdfapplication/pdf2982396https://repositorio.uel.br/bitstreams/030ce07b-8b5a-4a54-861e-ab00a23b52d4/download29019eb031a8fc62449410dc67281e0aMD51LICENCElicence.txttext/plain263https://repositorio.uel.br/bitstreams/b524506c-2e36-49fc-a9bd-368ea82337e7/download753f376dfdbc064b559839be95ac5523MD52TEXT6505.pdf.txt6505.pdf.txtExtracted texttext/plain166224https://repositorio.uel.br/bitstreams/75d207c5-22ce-4525-a67e-ae1262cc165e/downloade9a7abc04f6d4e72e66c3a2b2191feffMD53THUMBNAIL6505.pdf.jpg6505.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3948https://repositorio.uel.br/bitstreams/b56c9162-c270-459c-87a9-b803f175697d/download969eb76b38f6c92e720056506147665fMD54123456789/90042024-07-12 01:20:25.896open.accessoai:repositorio.uel.br:123456789/9004https://repositorio.uel.brBiblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2024-07-12T04:20:25Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)false |
| dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis |
| title |
Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis |
| spellingShingle |
Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis Pezenti, Larissa Forim Lagarta da soja Anticarsia gemmatalis - Linhagem Bacillus thuringiensis Cepa HD-73 Bacillus thurigiensis |
| title_short |
Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis |
| title_full |
Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis |
| title_fullStr |
Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis |
| title_full_unstemmed |
Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis |
| title_sort |
Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis desafiadas com a cepa HD-73 de Bacillus thuringiensis |
| author |
Pezenti, Larissa Forim |
| author_facet |
Pezenti, Larissa Forim |
| author_role |
author |
| dc.contributor.banca.pt_BR.fl_str_mv |
Pontes, Rose Gomes Monnerat Solon de Pereira, Luiz Filipe Protasio |
| dc.contributor.coadvisor.pt_BR.fl_str_mv |
Souza, Rogério Fernandes [Coorientador] |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Pezenti, Larissa Forim |
| dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
8c6c9194-53f8-44d9-8131-8b421331179b |
| dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv |
32fb7f6e-dbb7-4f9e-8197-ff450181d651 |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Rosa, Renata da [Orientador] |
| contributor_str_mv |
Rosa, Renata da [Orientador] |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Lagarta da soja Anticarsia gemmatalis - Linhagem Bacillus thuringiensis Cepa HD-73 Bacillus thurigiensis |
| topic |
Lagarta da soja Anticarsia gemmatalis - Linhagem Bacillus thuringiensis Cepa HD-73 Bacillus thurigiensis |
| description |
Resumo: Anticarsia gemmatalis Hübner, 1818, (Lepidoptera: Erebidae) ou lagarta-da-soja, é um dos desfolhadores mais comum da soja no Brasil, sendo que as d-endotoxinas produzidas pelo Bacillus thuringiensis Berliner (Bacillales: Bacillaceae) (Bt) têm sido amplamente utilizadas como bioinseticida para o seu controle O modo de ação destas toxinas é bem caracterizado em lepidópteros, no entanto existem muitas questões a respeito dos mecanismos de resistência às toxinas Bt Dessa forma, o presente trabalho teve como objetivo comparar o padrão de expressão gênica para a identificação de locos candidatos ao mecanismo de resistência à linhagem Bacillus thuringiensis subsp kurstaki HD-73, produtora da proteína bioinseticida Cry1Ac em A gemmmatalis Para tanto, o RNA total de linhagens suscetíveis e resistentes de A gemmatalis desafiadas com essa bactéria foi extraído e sequenciado via Illumina® Hiseq 25 Os 241776712 reads paired-end de 126 pb gerados foram montados em 25757 transcritos Desses, 179 apresentaram alinhamentos significativos com as proteínas do banco de dados de proteínas não-redundantes do NCBI A análise de expressão diferencial entre as linhagens de A gemmatalis resistentes e suscetíveis à Bt HD-73 identificou 422 transcritos expressos diferencialmente (log2 fold change = 2 e padj < ,1), dos quais 195 foram regulados positivamente e 227 regulados negativamente nas lagartas resistentes Os genes regulados negativamente nas linhagens resistentes estão relacionados principalmente a atividades proteolíticas, incluindo a tripsina, a quimotripsina e a carboxipeptidase, que participam do processo de ativação das protoxinas Cry de Bt Por outro lado, os genes regulados positivamente são, em sua maioria, envolvidos com processos de desintoxicação, incluindo a esterase, genes que desencadeiam respostas imunes inatas, tal como a lectina do tipo C e a hemolin, bem como genes que regulam a defesa contra patógenos, como os inibidores de proteases, que podem atuar inibindo proteases endógenas ou fatores de virulência de patógenos Este estudo apresenta as primeiras informações do transcriptoma de Anticarsia gemmatalis utilizando novas tecnologias de sequenciamento, e corrobora com a hipótese de uma base genética complexa das respostas fisiológicas e dos mecanismos de resistência selecionados mediante a utilização de Bt |
| publishDate |
2024 |
| dc.date.defesa.pt_BR.fl_str_mv |
23.02.2017 |
| dc.date.created.fl_str_mv |
2017.00 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2024-05-01T11:46:13Z |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2024-05-01T11:46:13Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.uel.br/handle/123456789/9004 |
| url |
https://repositorio.uel.br/handle/123456789/9004 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.confidence.fl_str_mv |
-1 -1 |
| dc.relation.coursedegree.pt_BR.fl_str_mv |
Mestrado |
| dc.relation.coursename.pt_BR.fl_str_mv |
Genética e Biologia Molecular |
| dc.relation.departament.pt_BR.fl_str_mv |
Centro de Ciências Biológicas |
| dc.relation.ppgname.pt_BR.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.coverage.spatial.pt_BR.fl_str_mv |
Londrina |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UEL instname:Universidade Estadual de Londrina (UEL) instacron:UEL |
| instname_str |
Universidade Estadual de Londrina (UEL) |
| instacron_str |
UEL |
| institution |
UEL |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UEL |
| collection |
Repositório Institucional da UEL |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.uel.br/bitstreams/030ce07b-8b5a-4a54-861e-ab00a23b52d4/download https://repositorio.uel.br/bitstreams/b524506c-2e36-49fc-a9bd-368ea82337e7/download https://repositorio.uel.br/bitstreams/75d207c5-22ce-4525-a67e-ae1262cc165e/download https://repositorio.uel.br/bitstreams/b56c9162-c270-459c-87a9-b803f175697d/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
29019eb031a8fc62449410dc67281e0a 753f376dfdbc064b559839be95ac5523 e9a7abc04f6d4e72e66c3a2b2191feff 969eb76b38f6c92e720056506147665f |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL) |
| repository.mail.fl_str_mv |
bcuel@uel.br|| |
| _version_ |
1856675839329959936 |