Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos
| Ano de defesa: | 2019 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Outros Autores: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas Brasil UFAM Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia |
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7321 |
Resumo: | Derrames acidentais de petróleo podem ter consequências catastróficas em ambientes naturais. No entanto, algumas populações nativas de bactérias podem prosperar nestas condições, utilizando componentes do petróleo bruto em seu metabolismo. Esta capacidade natural das bactérias pode ser usada na obtenção de informações genéticas e metabólicas para contribuir com o desenvolvimento de novas tecnologias de biorremediação, como, por exemplo, na limpeza de resíduos industriais. Assim, nesta pesquisa foi investigado o potencial de biodegradação da Acinetobacter junii SB132, por procedimentos experimentais e análises genômicas, para entender seus mecanismos de interação, absorção e metabolização de compostos hidrofóbicos do óleo diesel. Esta cepa bacteriana, previamente isolada por seleção em substrato contendo petróleo e identificada por análises morfológicas e moleculares, teve a capacidade de crescer em óleo diesel como sua única fonte de carbono e energia. Além disso, em testes laboratoriais foram observadas camadas de emulsão entre o sobrenadante de cultura, livre de células, e compostos hidrofóbicos. Adicionalmente, células frescas, livres de óleo, foram capazes de aderir aos substratos hidrofóbicos, bem como formar biofilme sobre a superfície de placa de poliestireno. O rascunho do genoma desta bactéria teve um tamanho de 3,5 Mb, tamanho este equivalente aos genomas das cepas deste gênero depositados no GenBank, e sua anotação revelou subsistemas relacionados ao metabolismo de hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos. Assim, é possível que a A. junii SB132 utilize mecanismos de adesão celular, via formação de biofilme, para entrar em contato com os substratos hidrofóbicos presentes no óleo diesel e, assim, poder metabolizá-los pelas vias de degradação destes compostos. |
| id |
UFAM_7ca27af1ffd2e4cfa44e1b4056b0204d |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/7321 |
| network_acronym_str |
UFAM |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicosGenomic characterization of diesel degrading Acinetobacter junii SB132 and its interaction with hydrophobic substratesGenômicaBactériasBiodegradaçãoCIÊNCIAS BIOLÓGICAS: GENÉTICA: GENÉTICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOSGenomaBioinformáticaPoluenteBiofilmeDerrames acidentais de petróleo podem ter consequências catastróficas em ambientes naturais. No entanto, algumas populações nativas de bactérias podem prosperar nestas condições, utilizando componentes do petróleo bruto em seu metabolismo. Esta capacidade natural das bactérias pode ser usada na obtenção de informações genéticas e metabólicas para contribuir com o desenvolvimento de novas tecnologias de biorremediação, como, por exemplo, na limpeza de resíduos industriais. Assim, nesta pesquisa foi investigado o potencial de biodegradação da Acinetobacter junii SB132, por procedimentos experimentais e análises genômicas, para entender seus mecanismos de interação, absorção e metabolização de compostos hidrofóbicos do óleo diesel. Esta cepa bacteriana, previamente isolada por seleção em substrato contendo petróleo e identificada por análises morfológicas e moleculares, teve a capacidade de crescer em óleo diesel como sua única fonte de carbono e energia. Além disso, em testes laboratoriais foram observadas camadas de emulsão entre o sobrenadante de cultura, livre de células, e compostos hidrofóbicos. Adicionalmente, células frescas, livres de óleo, foram capazes de aderir aos substratos hidrofóbicos, bem como formar biofilme sobre a superfície de placa de poliestireno. O rascunho do genoma desta bactéria teve um tamanho de 3,5 Mb, tamanho este equivalente aos genomas das cepas deste gênero depositados no GenBank, e sua anotação revelou subsistemas relacionados ao metabolismo de hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos. Assim, é possível que a A. junii SB132 utilize mecanismos de adesão celular, via formação de biofilme, para entrar em contato com os substratos hidrofóbicos presentes no óleo diesel e, assim, poder metabolizá-los pelas vias de degradação destes compostos.Accidental spills of crude oil can have catastrophic consequences in natural environments. However, some native bacterial populations can thrive under these conditions by utilizing crude oil components in their metabolism. This natural ability of bacteria can be used to gather genetic and metabolic information to contribute to the development of new bioremediation technologies, such as cleaning industrial waste. Thus, this research investigated the biodegradation potential of Acinetobacter junii SB132, by experimental procedures and genomic analyzes, to understand its mechanisms of interaction, absorption and metabolization of hydrophobic compounds of diesel oil. This bacterial strain, previously isolated by selection on petroleum-containing substrate and identified by morphological and molecular analysis, had the ability to grow in diesel oil as sole carbon and energy source. In addition, in laboratory tests, emulsion layers were observed between cell free culture supernatant and hydrophobic compounds. Additionally, fresh oil-free cells were able to adhere to hydrophobic substrates as well as form a biofilm on the polystyrene plate surface. Its genome draft had a size of 3.5 Mb, which is equivalent to the genomes of the Acinetobacter strains deposited in GenBank, in which the annotation revealed subsystems related to the metabolism of aliphatic and aromatic hydrocarbons. Thus, it is possible that A. junii SB132 uses cell adhesion mechanisms, through biofilm formation, to contact the hydrophobic substrates present in diesel oil and so be able to metabolize them through the degradation pathways of these compounds.CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do AmazonasNos campos "áreas de conhecimento de acordo com o CNPq", poderia ter um link que direcionasse para esta lista de áreas.Universidade Federal do AmazonasInstituto de Ciências BiológicasBrasilUFAMPrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaAndrade, Edmar Vaz dehttp://lattes.cnpq.br/4691893433367918Brigido, Marcelo de Macedohttp://lattes.cnpq.br/2482060270236527Neiva, Márciahttp://lattes.cnpq.br/4524897490719405Nascimento, Alessandra Karisa Costa Lima dohttp://lattes.cnpq.br/1351738158354765Souza Neto, Júlio Nino dehttp://lattes.cnpq.br/11477674091589742019-08-21T13:59:26Z2019-07-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfSOUZA NETO, Júlio Nino. Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos. 2019. 153 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019.https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7321porhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2019-08-22T05:03:46Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/7321Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922019-08-22T05:03:46Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos Genomic characterization of diesel degrading Acinetobacter junii SB132 and its interaction with hydrophobic substrates |
| title |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos |
| spellingShingle |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos Souza Neto, Júlio Nino de Genômica Bactérias Biodegradação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS: GENÉTICA: GENÉTICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS Genoma Bioinformática Poluente Biofilme |
| title_short |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos |
| title_full |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos |
| title_fullStr |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos |
| title_full_unstemmed |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos |
| title_sort |
Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos |
| author |
Souza Neto, Júlio Nino de |
| author_facet |
Souza Neto, Júlio Nino de http://lattes.cnpq.br/1147767409158974 |
| author_role |
author |
| author2 |
http://lattes.cnpq.br/1147767409158974 |
| author2_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Andrade, Edmar Vaz de http://lattes.cnpq.br/4691893433367918 Brigido, Marcelo de Macedo http://lattes.cnpq.br/2482060270236527 Neiva, Márcia http://lattes.cnpq.br/4524897490719405 Nascimento, Alessandra Karisa Costa Lima do http://lattes.cnpq.br/1351738158354765 |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Souza Neto, Júlio Nino de http://lattes.cnpq.br/1147767409158974 |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Genômica Bactérias Biodegradação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS: GENÉTICA: GENÉTICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS Genoma Bioinformática Poluente Biofilme |
| topic |
Genômica Bactérias Biodegradação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS: GENÉTICA: GENÉTICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS Genoma Bioinformática Poluente Biofilme |
| description |
Derrames acidentais de petróleo podem ter consequências catastróficas em ambientes naturais. No entanto, algumas populações nativas de bactérias podem prosperar nestas condições, utilizando componentes do petróleo bruto em seu metabolismo. Esta capacidade natural das bactérias pode ser usada na obtenção de informações genéticas e metabólicas para contribuir com o desenvolvimento de novas tecnologias de biorremediação, como, por exemplo, na limpeza de resíduos industriais. Assim, nesta pesquisa foi investigado o potencial de biodegradação da Acinetobacter junii SB132, por procedimentos experimentais e análises genômicas, para entender seus mecanismos de interação, absorção e metabolização de compostos hidrofóbicos do óleo diesel. Esta cepa bacteriana, previamente isolada por seleção em substrato contendo petróleo e identificada por análises morfológicas e moleculares, teve a capacidade de crescer em óleo diesel como sua única fonte de carbono e energia. Além disso, em testes laboratoriais foram observadas camadas de emulsão entre o sobrenadante de cultura, livre de células, e compostos hidrofóbicos. Adicionalmente, células frescas, livres de óleo, foram capazes de aderir aos substratos hidrofóbicos, bem como formar biofilme sobre a superfície de placa de poliestireno. O rascunho do genoma desta bactéria teve um tamanho de 3,5 Mb, tamanho este equivalente aos genomas das cepas deste gênero depositados no GenBank, e sua anotação revelou subsistemas relacionados ao metabolismo de hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos. Assim, é possível que a A. junii SB132 utilize mecanismos de adesão celular, via formação de biofilme, para entrar em contato com os substratos hidrofóbicos presentes no óleo diesel e, assim, poder metabolizá-los pelas vias de degradação destes compostos. |
| publishDate |
2019 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2019-08-21T13:59:26Z 2019-07-19 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| format |
doctoralThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
SOUZA NETO, Júlio Nino. Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos. 2019. 153 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7321 |
| identifier_str_mv |
SOUZA NETO, Júlio Nino. Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos. 2019. 153 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019. |
| url |
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7321 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal do Amazonas Instituto de Ciências Biológicas Brasil UFAM Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal do Amazonas Instituto de Ciências Biológicas Brasil UFAM Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM instname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM) instacron:UFAM |
| instname_str |
Universidade Federal do Amazonas (UFAM) |
| instacron_str |
UFAM |
| institution |
UFAM |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM) |
| repository.mail.fl_str_mv |
ddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.br |
| _version_ |
1851781293534085120 |