Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2019
Autor(a) principal: Souza Neto, Júlio Nino de
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/1147767409158974
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7321
Resumo: Derrames acidentais de petróleo podem ter consequências catastróficas em ambientes naturais. No entanto, algumas populações nativas de bactérias podem prosperar nestas condições, utilizando componentes do petróleo bruto em seu metabolismo. Esta capacidade natural das bactérias pode ser usada na obtenção de informações genéticas e metabólicas para contribuir com o desenvolvimento de novas tecnologias de biorremediação, como, por exemplo, na limpeza de resíduos industriais. Assim, nesta pesquisa foi investigado o potencial de biodegradação da Acinetobacter junii SB132, por procedimentos experimentais e análises genômicas, para entender seus mecanismos de interação, absorção e metabolização de compostos hidrofóbicos do óleo diesel. Esta cepa bacteriana, previamente isolada por seleção em substrato contendo petróleo e identificada por análises morfológicas e moleculares, teve a capacidade de crescer em óleo diesel como sua única fonte de carbono e energia. Além disso, em testes laboratoriais foram observadas camadas de emulsão entre o sobrenadante de cultura, livre de células, e compostos hidrofóbicos. Adicionalmente, células frescas, livres de óleo, foram capazes de aderir aos substratos hidrofóbicos, bem como formar biofilme sobre a superfície de placa de poliestireno. O rascunho do genoma desta bactéria teve um tamanho de 3,5 Mb, tamanho este equivalente aos genomas das cepas deste gênero depositados no GenBank, e sua anotação revelou subsistemas relacionados ao metabolismo de hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos. Assim, é possível que a A. junii SB132 utilize mecanismos de adesão celular, via formação de biofilme, para entrar em contato com os substratos hidrofóbicos presentes no óleo diesel e, assim, poder metabolizá-los pelas vias de degradação destes compostos.
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spelling Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicosGenomic characterization of diesel degrading Acinetobacter junii SB132 and its interaction with hydrophobic substratesGenômicaBactériasBiodegradaçãoCIÊNCIAS BIOLÓGICAS: GENÉTICA: GENÉTICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOSGenomaBioinformáticaPoluenteBiofilmeDerrames acidentais de petróleo podem ter consequências catastróficas em ambientes naturais. No entanto, algumas populações nativas de bactérias podem prosperar nestas condições, utilizando componentes do petróleo bruto em seu metabolismo. Esta capacidade natural das bactérias pode ser usada na obtenção de informações genéticas e metabólicas para contribuir com o desenvolvimento de novas tecnologias de biorremediação, como, por exemplo, na limpeza de resíduos industriais. Assim, nesta pesquisa foi investigado o potencial de biodegradação da Acinetobacter junii SB132, por procedimentos experimentais e análises genômicas, para entender seus mecanismos de interação, absorção e metabolização de compostos hidrofóbicos do óleo diesel. Esta cepa bacteriana, previamente isolada por seleção em substrato contendo petróleo e identificada por análises morfológicas e moleculares, teve a capacidade de crescer em óleo diesel como sua única fonte de carbono e energia. Além disso, em testes laboratoriais foram observadas camadas de emulsão entre o sobrenadante de cultura, livre de células, e compostos hidrofóbicos. Adicionalmente, células frescas, livres de óleo, foram capazes de aderir aos substratos hidrofóbicos, bem como formar biofilme sobre a superfície de placa de poliestireno. O rascunho do genoma desta bactéria teve um tamanho de 3,5 Mb, tamanho este equivalente aos genomas das cepas deste gênero depositados no GenBank, e sua anotação revelou subsistemas relacionados ao metabolismo de hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos. Assim, é possível que a A. junii SB132 utilize mecanismos de adesão celular, via formação de biofilme, para entrar em contato com os substratos hidrofóbicos presentes no óleo diesel e, assim, poder metabolizá-los pelas vias de degradação destes compostos.Accidental spills of crude oil can have catastrophic consequences in natural environments. However, some native bacterial populations can thrive under these conditions by utilizing crude oil components in their metabolism. This natural ability of bacteria can be used to gather genetic and metabolic information to contribute to the development of new bioremediation technologies, such as cleaning industrial waste. Thus, this research investigated the biodegradation potential of Acinetobacter junii SB132, by experimental procedures and genomic analyzes, to understand its mechanisms of interaction, absorption and metabolization of hydrophobic compounds of diesel oil. This bacterial strain, previously isolated by selection on petroleum-containing substrate and identified by morphological and molecular analysis, had the ability to grow in diesel oil as sole carbon and energy source. In addition, in laboratory tests, emulsion layers were observed between cell free culture supernatant and hydrophobic compounds. Additionally, fresh oil-free cells were able to adhere to hydrophobic substrates as well as form a biofilm on the polystyrene plate surface. Its genome draft had a size of 3.5 Mb, which is equivalent to the genomes of the Acinetobacter strains deposited in GenBank, in which the annotation revealed subsystems related to the metabolism of aliphatic and aromatic hydrocarbons. Thus, it is possible that A. junii SB132 uses cell adhesion mechanisms, through biofilm formation, to contact the hydrophobic substrates present in diesel oil and so be able to metabolize them through the degradation pathways of these compounds.CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do AmazonasNos campos "áreas de conhecimento de acordo com o CNPq", poderia ter um link que direcionasse para esta lista de áreas.Universidade Federal do AmazonasInstituto de Ciências BiológicasBrasilUFAMPrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaAndrade, Edmar Vaz dehttp://lattes.cnpq.br/4691893433367918Brigido, Marcelo de Macedohttp://lattes.cnpq.br/2482060270236527Neiva, Márciahttp://lattes.cnpq.br/4524897490719405Nascimento, Alessandra Karisa Costa Lima dohttp://lattes.cnpq.br/1351738158354765Souza Neto, Júlio Nino dehttp://lattes.cnpq.br/11477674091589742019-08-21T13:59:26Z2019-07-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfSOUZA NETO, Júlio Nino. Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos. 2019. 153 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019.https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7321porhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2019-08-22T05:03:46Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/7321Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922019-08-22T05:03:46Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false
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