Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro
| Ano de defesa: | 2023 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Centro de Ciências Agrárias - CCA
Brasil UFERSA Universidade Federal Rural do Semi-Árido Programa de Pós-Graduação em Fitotecnia |
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | http://lattes.cnpq.br/2079609001869001 http://lattes.cnpq.br/2050952817764684 http://lattes.cnpq.br/5986626995999424 https://doi.org/10.21708/bdtd.ppgfito.tese.11988 https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/11988 |
Resumo: | objetivo deste estudo foi o de caracterizar, em nível morfológico e molecular, isolados de C. tenuissimum, causador da mancha marrom, a sua interação com aboboreira e meloeiro, por meio de análises de patogenicidade, e avaliar o efeito de óleos essenciais no crescimento in vitro do patógeno. Para isso, foram coletadas folhas de abóbora e melancia, e folhas e frutos de meloeiro com lesões necróticas moderadas a severas, em regiões produtoras do Rio Grande do Norte, Brasil. Um total de doze isolados (quatro de abóbora, um de melancia e sete de melão) foram obtidos a partir de folhas e frutos sintomáticos. Os isolados foram submetidos a análises morfológicas em microscópio óptico e de varredura, extração de DNA de pelo método SDS, sequenciamento do DNA com os primers ITS 1 e 2 e, de parte do gene TEF1α, análise filogenética pelo método da Análise de Máxima Verossimilhança e análise da diversidade genética com 19 marcadores ISSR e dez RAPD. O potencial patogênico dos isolados em plantas de abóbora e melão foi avaliado em casa-de-vegetação pela metodologia de suspensões de esporos (106 conídios/ml−1). Para avaliar o controle do crescimento in vitro de dois isolados distantes geneticamente, foram testados três óleos essenciais: canela cássia (Cinnamomum cassia), capim limão (Cymbopogon citratus) e manjericão (Ocimum basilicum), em duas contrações (0,125% e 0,5%) cada. No estudo da diversidade genética ambos os marcadores ISSR e RAPD foram eficazes na identificação de similaridade genética dos isolados, e produziram polimorfismo percentual 98% e 100%, respectivamente. A análise do dendrograma em conjunto indicou a formação de oito grupos principais, onde o coeficiente de similaridade genética variou de 0,21 (CMX02 e CML10) a 0,48 (CML07 e CML08). Todos os isolados apresentaram potencial patogenico para as plantas de abóbora e melão, variando na severidade. Na avaliação in vitro, canela cássia e capim limão inibiram 100% do crescimento dos isolados CML06 e CML07, enquanto que óleo de manjericão a 0,125% inibiram 84% e 78%, respectivamente. O isolado CML07 também apresentou na análise de similaridade em conjunto a maior distância genética dos demais isolados, sugerindo, dessa forma, que esse isolado possui genes que atuam de forma diferenciada, e que a presença da variação genética observada pode estar associada à maior incidência da doença. Este é o primeiro relato do patógeno em áreas produtoras no Rio Grande do Norte e no Brasil para Cucurbitáceas |
| id |
UFER_5bad9ab733fe7007d934d65b2fa14066 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufersa.edu.br:prefix/11988 |
| network_acronym_str |
UFER |
| network_name_str |
Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semiárido (RDU) |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitroMorphological and molecular characterization of Cladosporium tenuissimum and the effect of essential oils on its growth in vitroCIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIACucumis Melo L.ISSRRAPDCucurbitáceasmancha foliarCucumis Melo L.ISSRRAPDCucurbitaceaeleaf spotobjetivo deste estudo foi o de caracterizar, em nível morfológico e molecular, isolados de C. tenuissimum, causador da mancha marrom, a sua interação com aboboreira e meloeiro, por meio de análises de patogenicidade, e avaliar o efeito de óleos essenciais no crescimento in vitro do patógeno. Para isso, foram coletadas folhas de abóbora e melancia, e folhas e frutos de meloeiro com lesões necróticas moderadas a severas, em regiões produtoras do Rio Grande do Norte, Brasil. Um total de doze isolados (quatro de abóbora, um de melancia e sete de melão) foram obtidos a partir de folhas e frutos sintomáticos. Os isolados foram submetidos a análises morfológicas em microscópio óptico e de varredura, extração de DNA de pelo método SDS, sequenciamento do DNA com os primers ITS 1 e 2 e, de parte do gene TEF1α, análise filogenética pelo método da Análise de Máxima Verossimilhança e análise da diversidade genética com 19 marcadores ISSR e dez RAPD. O potencial patogênico dos isolados em plantas de abóbora e melão foi avaliado em casa-de-vegetação pela metodologia de suspensões de esporos (106 conídios/ml−1). Para avaliar o controle do crescimento in vitro de dois isolados distantes geneticamente, foram testados três óleos essenciais: canela cássia (Cinnamomum cassia), capim limão (Cymbopogon citratus) e manjericão (Ocimum basilicum), em duas contrações (0,125% e 0,5%) cada. No estudo da diversidade genética ambos os marcadores ISSR e RAPD foram eficazes na identificação de similaridade genética dos isolados, e produziram polimorfismo percentual 98% e 100%, respectivamente. A análise do dendrograma em conjunto indicou a formação de oito grupos principais, onde o coeficiente de similaridade genética variou de 0,21 (CMX02 e CML10) a 0,48 (CML07 e CML08). Todos os isolados apresentaram potencial patogenico para as plantas de abóbora e melão, variando na severidade. Na avaliação in vitro, canela cássia e capim limão inibiram 100% do crescimento dos isolados CML06 e CML07, enquanto que óleo de manjericão a 0,125% inibiram 84% e 78%, respectivamente. O isolado CML07 também apresentou na análise de similaridade em conjunto a maior distância genética dos demais isolados, sugerindo, dessa forma, que esse isolado possui genes que atuam de forma diferenciada, e que a presença da variação genética observada pode estar associada à maior incidência da doença. Este é o primeiro relato do patógeno em áreas produtoras no Rio Grande do Norte e no Brasil para CucurbitáceasThe objectives of this study were to characterize morphologically and molecularly isolates of C. tenuissimum, which causes brown spot, to verify its interaction with gourd and melon, through pathogenicity analysis, and to evaluate the effect of essential oils on the in vitro growth of pathogen. For this, pumpkin and watermelon leaves, and melon leaves and fruits with moderate to severe necrotic lesions were collected in producing regions of Rio Grande do Norte, Brazil. A total of twelve isolates (four from pumpkin, one from watermelon and seven from melon) were obtained from symptomatic leaves and fruits. The isolates were submitted to morphological analyzes in optical and scanning microscopes, DNA extraction by the SDS method, DNA sequencing with primers ITS 1 and 2 and, of part of the TEF1α gene, phylogenetic analysis by the Maximum Likelihood Analysis method and genetic diversity analysis with 19 ISSR and ten RAPD markers. The pathogenic potential of isolates from pumpkin and melon plants was evaluated in a greenhouse using the spore suspension methodology (106 conidia/ml−1). To evaluate the in vitro growth control of two genetically distant isolates, three essential oils, cassia cinnamon (Cinnamomum cassia), lemon grass (Cymbopogon citratus) and basil (Ocimum basilicum), were tested in two contractions (0.125% and 0.5 %) each. In the study of genetic diversity, both ISSR and RAPD markers were effective in identifying the genetic similarity of the isolates, and produced percentage polymorphism 98% and 100%, respectively. The analysis of the dendrogram together indicated the formation of eight main groups, where the coefficient of genetic similarity ranged from 0.21 (CMX02 and CML10) to 0.48 (CML07 and CML08). All isolates showed pathogenic potential for pumpkin and melon plants, varying in severity. In the in vitro evaluation, cassia cinnamon and lemongrass inhibited 100% of the growth of isolates CML06 and CML07 while basil oil at 0.125% inhibited 84% and 78%, respectively. The CML07 isolate also showed a greater genetic distance from the other isolates in the joint similarity analysis, suggesting that this isolate has genes that act differently, and that the presence of the observed genetic variation may be associated with a higher incidence of the disease. This is the first report of the pathogen in producing areas in Rio Grande do Norte and Brazil for Cucurbitaceae59 p.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior – CAPESCentro de Ciências Agrárias - CCABrasilUFERSAUniversidade Federal Rural do Semi-ÁridoPrograma de Pós-Graduação em FitotecniaHolanda, Ioná Santos AraújoAmbrósio, Márcia Michelle de QueirozHolanda, Ioná Santos AraújoSilveira, Lindomar Maria daNegreiros, Andreia Mitsa PaivaBordallo, Patrícia do NascimentoMarbach, Phellippe Arthur SantosGomes, Izabelle Rodrigues Ferreira2024-11-01T14:53:14Z2024-11-01T14:53:14Z2023-07-14info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionpdfapplication/pdfhttp://lattes.cnpq.br/2079609001869001http://lattes.cnpq.br/2050952817764684GOMES, Izabelle Rodrigues Ferreira. Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro. 2023. 59 f. Tese (Doutorado em Fitotecnia) – Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA). Mossoró-RN, 2023.http://lattes.cnpq.br/5986626995999424https://doi.org/10.21708/bdtd.ppgfito.tese.11988https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/11988Mossoróinfo:eu-repo/semantics/openAccessUFERSAAttribution-ShareAlike 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/br/porreponame:Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semiárido (RDU)instname:Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)instacron:UFERSA2024-12-11T23:18:43Zoai:repositorio.ufersa.edu.br:prefix/11988Repositório Institucionalhttps://repositorio.ufersa.edu.br/PUBhttps://repositorio.ufersa.edu.br/server/oai/requestrepositorio@ufersa.edu.br || admrepositorio@ufersa.edu.bropendoar:2024-12-11T23:18:43Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semiárido (RDU) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro Morphological and molecular characterization of Cladosporium tenuissimum and the effect of essential oils on its growth in vitro |
| title |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro |
| spellingShingle |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro Gomes, Izabelle Rodrigues Ferreira CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA Cucumis Melo L. ISSR RAPD Cucurbitáceas mancha foliar Cucumis Melo L. ISSR RAPD Cucurbitaceae leaf spot |
| title_short |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro |
| title_full |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro |
| title_fullStr |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro |
| title_full_unstemmed |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro |
| title_sort |
Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro |
| author |
Gomes, Izabelle Rodrigues Ferreira |
| author_facet |
Gomes, Izabelle Rodrigues Ferreira |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Holanda, Ioná Santos Araújo Ambrósio, Márcia Michelle de Queiroz Holanda, Ioná Santos Araújo Silveira, Lindomar Maria da Negreiros, Andreia Mitsa Paiva Bordallo, Patrícia do Nascimento Marbach, Phellippe Arthur Santos |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Gomes, Izabelle Rodrigues Ferreira |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA Cucumis Melo L. ISSR RAPD Cucurbitáceas mancha foliar Cucumis Melo L. ISSR RAPD Cucurbitaceae leaf spot |
| topic |
CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA Cucumis Melo L. ISSR RAPD Cucurbitáceas mancha foliar Cucumis Melo L. ISSR RAPD Cucurbitaceae leaf spot |
| description |
objetivo deste estudo foi o de caracterizar, em nível morfológico e molecular, isolados de C. tenuissimum, causador da mancha marrom, a sua interação com aboboreira e meloeiro, por meio de análises de patogenicidade, e avaliar o efeito de óleos essenciais no crescimento in vitro do patógeno. Para isso, foram coletadas folhas de abóbora e melancia, e folhas e frutos de meloeiro com lesões necróticas moderadas a severas, em regiões produtoras do Rio Grande do Norte, Brasil. Um total de doze isolados (quatro de abóbora, um de melancia e sete de melão) foram obtidos a partir de folhas e frutos sintomáticos. Os isolados foram submetidos a análises morfológicas em microscópio óptico e de varredura, extração de DNA de pelo método SDS, sequenciamento do DNA com os primers ITS 1 e 2 e, de parte do gene TEF1α, análise filogenética pelo método da Análise de Máxima Verossimilhança e análise da diversidade genética com 19 marcadores ISSR e dez RAPD. O potencial patogênico dos isolados em plantas de abóbora e melão foi avaliado em casa-de-vegetação pela metodologia de suspensões de esporos (106 conídios/ml−1). Para avaliar o controle do crescimento in vitro de dois isolados distantes geneticamente, foram testados três óleos essenciais: canela cássia (Cinnamomum cassia), capim limão (Cymbopogon citratus) e manjericão (Ocimum basilicum), em duas contrações (0,125% e 0,5%) cada. No estudo da diversidade genética ambos os marcadores ISSR e RAPD foram eficazes na identificação de similaridade genética dos isolados, e produziram polimorfismo percentual 98% e 100%, respectivamente. A análise do dendrograma em conjunto indicou a formação de oito grupos principais, onde o coeficiente de similaridade genética variou de 0,21 (CMX02 e CML10) a 0,48 (CML07 e CML08). Todos os isolados apresentaram potencial patogenico para as plantas de abóbora e melão, variando na severidade. Na avaliação in vitro, canela cássia e capim limão inibiram 100% do crescimento dos isolados CML06 e CML07, enquanto que óleo de manjericão a 0,125% inibiram 84% e 78%, respectivamente. O isolado CML07 também apresentou na análise de similaridade em conjunto a maior distância genética dos demais isolados, sugerindo, dessa forma, que esse isolado possui genes que atuam de forma diferenciada, e que a presença da variação genética observada pode estar associada à maior incidência da doença. Este é o primeiro relato do patógeno em áreas produtoras no Rio Grande do Norte e no Brasil para Cucurbitáceas |
| publishDate |
2023 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2023-07-14 2024-11-01T14:53:14Z 2024-11-01T14:53:14Z |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| format |
doctoralThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/2079609001869001 http://lattes.cnpq.br/2050952817764684 GOMES, Izabelle Rodrigues Ferreira. Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro. 2023. 59 f. Tese (Doutorado em Fitotecnia) – Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA). Mossoró-RN, 2023. http://lattes.cnpq.br/5986626995999424 https://doi.org/10.21708/bdtd.ppgfito.tese.11988 https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/11988 |
| url |
http://lattes.cnpq.br/2079609001869001 http://lattes.cnpq.br/2050952817764684 http://lattes.cnpq.br/5986626995999424 https://doi.org/10.21708/bdtd.ppgfito.tese.11988 https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/11988 |
| identifier_str_mv |
GOMES, Izabelle Rodrigues Ferreira. Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro. 2023. 59 f. Tese (Doutorado em Fitotecnia) – Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA). Mossoró-RN, 2023. |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess UFERSA Attribution-ShareAlike 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/br/ |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
UFERSA Attribution-ShareAlike 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/br/ |
| dc.format.none.fl_str_mv |
pdf application/pdf |
| dc.coverage.none.fl_str_mv |
Mossoró |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Centro de Ciências Agrárias - CCA Brasil UFERSA Universidade Federal Rural do Semi-Árido Programa de Pós-Graduação em Fitotecnia |
| publisher.none.fl_str_mv |
Centro de Ciências Agrárias - CCA Brasil UFERSA Universidade Federal Rural do Semi-Árido Programa de Pós-Graduação em Fitotecnia |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semiárido (RDU) instname:Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA) instacron:UFERSA |
| instname_str |
Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA) |
| instacron_str |
UFERSA |
| institution |
UFERSA |
| reponame_str |
Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semiárido (RDU) |
| collection |
Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semiárido (RDU) |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semiárido (RDU) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio@ufersa.edu.br || admrepositorio@ufersa.edu.br |
| _version_ |
1866169354883694592 |