Análise fenotípica e genotípica de enterobactérias produtoras de B-lactamases de espectro estendido (ESBL) associadas a colonização de neonatos em um hospital universitário no Rio de Janeiro.
| Ano de defesa: | 2024 |
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Resumo: | Introdução: A disseminação de bactérias multirresistentes em ambientes hospitalares tornou-se um problema de saúde pública de alcance global. Atualmente, o tratamento de infecções causadas por bactérias Gram-negativas que produzem β-lactamases de espectro estendido (ESBL) é limitado. Os genes que codificam essas enzimas são capazes de disseminar com facilidade entre os microrganismos, dificultando o controle e tratamento das infecções hospitalares. As espécies bacterianas Gram-negativas, especialmente as com perfis de resistência aos antimicrobianos, têm importante papel na colonização e na infecção de pacientes nas diferentes unidades e estabelecimentos de saúde com impactos mais sérios em pacientes vulneráveis como os neonatos. Objetivo geral: caracterizar fenotípica e genotipicamente amostras de bacilos Gram-negativos (BGN) obtidas a partir de swabs retais de vigilância provenientes de pacientes neonatos no Hospital Universitário Antônio Pedro no período de fevereiro de 2021 a fevereiro de 2022. Objetivos específicos: Identificar as amostras bacterianas recuperadas a partir do swab de vigilância; caracterizar o perfil de resistência frente aos diferentes grupos de antimicrobianos; caracterizar a produção fenotípica de ESBLe a produção de carbapenemases e detectar os principais determinantes genéticos, possivelmente relacionados com a produção de ESBL e carbapenemases nas amostras estudadas. Material e Métodos: Após o isolamento, as amostras bacterianas tiveram seu perfil de suscetibilidade e identificação realizada por automação (Phoenix BD), que posteriormente, foi confirmada por Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight (MALDI-TOF-MS). As amostras foram submetidas ao Teste de Sinergismo de Duplo-Disco (TSDD) para detecção fenotípica da produção de ESBL. Foi realizado PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) para alguns genes mais frequentemente relacionados à produção de ESBL e de carbapenemases: blaCTX-M, blaSHV, blaTEM, blaOXA-48, blaKPC, blaNDM. Foram realizados os testes: método de inativação do carbapenêmico modificado (mCIM) e NG-Carba 5 para a detecção de carbapenemases (OXA-48, KPC, NDM, VIM e IMP) nas sete amostras resistentes ao ertapenem. Resultados: Das 427 amostras de colonização, isoladas a partir de swabs retais de neonatos atendidos na UTI Neonatal, 46 (11%) amostras foram consideradas produtoras de ESBL. A distribuição das espécies identificadas com maior frequência, pelo Phoenix BDTM, foi a seguinte: Enterobacter cloacae (N=12; 26%), Klebsiella pneumoniae e Klebsiella aerogenes (N=10; 22%, ambas) e Escherichia coli (N=7; 15%). Já as mais identificadas através do MALDI-TOF MS, foram as espécies Klebsiella aerogenes e Enterobacter cloacae (N=10; 22%, ambas), Escherichia coli (N=7; 15%) e Klebsiella pneumoniae (N=6; 13%). As taxas de resistência à Ampicilina/Sulbactam (85%) e Ceftriaxona (83%) foram as mais altas, seguida pela Piperacilina/Tazobactam (50%), Cefepime (39%) e Ceftazidima (35%); 15% (N=7) das amostras demostraram resistência ao Ertapenem. O fenótipo ESBL foi detectado em 37% (17/46) das amostras, sendo E. coli a espécie mais frequente (7/17; 41%), seguida de K. pneumoniae (6/17; 35%). O fenótipo de produção de carbapenemases, de acordo com o método do mCIM, foi detectado em três (43%) das sete amostras testadas. Conclusões: O gene de maior prevalência foi o gene blaCTX-M, presente em 15 amostras (33%), seguido do gene blaSHV, presente em seis amostras (13%) e o gene blaTEM está presente em cinco amostras (11%). Não foram encontradas amostras produtoras de KPC, NDM-1 e OXA-48 pelo PCR e que foi confirmado pelo teste NG-Carba. Nosso estudo revelou que 11% das 427 amostras pesquisadas foram produtoras de ESBL e que essas bactérias circulantes na UTIN do HUAP apresentam maior prevalência do gene CTX-M, demonstrando a importância das culturas de vigilância no monitoramento da colonização neonatal visando à contenção da disseminação de bactérias com esses mecanismos de resistência, reduzindo assim infecções futuras. |
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Análise fenotípica e genotípica de enterobactérias produtoras de B-lactamases de espectro estendido (ESBL) associadas a colonização de neonatos em um hospital universitário no Rio de Janeiro.Bactérias gram-negativasNeonatosColonizaçãoESBLNeonatologiaMicrobiologia médicaInfecção por bactérias gram-negativasInfecção hospitalarUTI neonatalProdução intelectualGram-negative bacteriaNeonatesColonizationESBLIntrodução: A disseminação de bactérias multirresistentes em ambientes hospitalares tornou-se um problema de saúde pública de alcance global. Atualmente, o tratamento de infecções causadas por bactérias Gram-negativas que produzem β-lactamases de espectro estendido (ESBL) é limitado. Os genes que codificam essas enzimas são capazes de disseminar com facilidade entre os microrganismos, dificultando o controle e tratamento das infecções hospitalares. As espécies bacterianas Gram-negativas, especialmente as com perfis de resistência aos antimicrobianos, têm importante papel na colonização e na infecção de pacientes nas diferentes unidades e estabelecimentos de saúde com impactos mais sérios em pacientes vulneráveis como os neonatos. Objetivo geral: caracterizar fenotípica e genotipicamente amostras de bacilos Gram-negativos (BGN) obtidas a partir de swabs retais de vigilância provenientes de pacientes neonatos no Hospital Universitário Antônio Pedro no período de fevereiro de 2021 a fevereiro de 2022. Objetivos específicos: Identificar as amostras bacterianas recuperadas a partir do swab de vigilância; caracterizar o perfil de resistência frente aos diferentes grupos de antimicrobianos; caracterizar a produção fenotípica de ESBLe a produção de carbapenemases e detectar os principais determinantes genéticos, possivelmente relacionados com a produção de ESBL e carbapenemases nas amostras estudadas. 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A distribuição das espécies identificadas com maior frequência, pelo Phoenix BDTM, foi a seguinte: Enterobacter cloacae (N=12; 26%), Klebsiella pneumoniae e Klebsiella aerogenes (N=10; 22%, ambas) e Escherichia coli (N=7; 15%). Já as mais identificadas através do MALDI-TOF MS, foram as espécies Klebsiella aerogenes e Enterobacter cloacae (N=10; 22%, ambas), Escherichia coli (N=7; 15%) e Klebsiella pneumoniae (N=6; 13%). As taxas de resistência à Ampicilina/Sulbactam (85%) e Ceftriaxona (83%) foram as mais altas, seguida pela Piperacilina/Tazobactam (50%), Cefepime (39%) e Ceftazidima (35%); 15% (N=7) das amostras demostraram resistência ao Ertapenem. O fenótipo ESBL foi detectado em 37% (17/46) das amostras, sendo E. coli a espécie mais frequente (7/17; 41%), seguida de K. pneumoniae (6/17; 35%). O fenótipo de produção de carbapenemases, de acordo com o método do mCIM, foi detectado em três (43%) das sete amostras testadas. Conclusões: O gene de maior prevalência foi o gene blaCTX-M, presente em 15 amostras (33%), seguido do gene blaSHV, presente em seis amostras (13%) e o gene blaTEM está presente em cinco amostras (11%). Não foram encontradas amostras produtoras de KPC, NDM-1 e OXA-48 pelo PCR e que foi confirmado pelo teste NG-Carba. Nosso estudo revelou que 11% das 427 amostras pesquisadas foram produtoras de ESBL e que essas bactérias circulantes na UTIN do HUAP apresentam maior prevalência do gene CTX-M, demonstrando a importância das culturas de vigilância no monitoramento da colonização neonatal visando à contenção da disseminação de bactérias com esses mecanismos de resistência, reduzindo assim infecções futuras.Introduction: The spread of multidrug-resistant bacteria in hospital environments has become a global public health issue. Currently, the treatment of infections caused by Gram-negative bacteria producing extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) is limited. The genes encoding these enzymes can easily spread among microorganisms, making the control and treatment of hospital infections challenging. Gram-negative bacterial species, especially those with antimicrobial resistance profiles, play a crucial role in the colonization and infection of patients in various healthcare units and facilities, with more severe impacts on vulnerable patients such as neonates. General Objective: To phenotypically and genotypically characterize samples of Gram-negative bacilli (GNB) obtained from surveillance rectal swabs of neonatal patients at the University Hospital Antônio Pedro from February 2021 to February 2022. Specific Objectives: Identify bacterial samples recovered from the surveillance swab; characterize the resistance profile against different groups of antimicrobials; characterize the phenotypic production of ESBL and carbapenemases and detect the main genetic determinants possibly related to the production of ESBL and carbapenemases in the studied samples. Materials and Methods: After isolation, the bacterial samples had their susceptibility profile and identification performed by automation (Phoenix BD), which was subsequently confirmed by MALDI-TOF. The samples underwent the Double-Disc Synergy Test (DDST) for phenotypic detection of ESBL production. PCR (Polymerase Chain Reaction) was conducted for some genes most frequently associated with ESBL and carbapenemase production: blaCTX-M, blaSHV, blaTEM, blaOXA-48, blaKPC, blaNDM. The Modified Carbapenem Inactivation Method (mCIM) and the NG-Carba 5, for the detection of carbapenemases (OXA-48, KPC, NDM, VIM, and IMP), tests were performed in the seven isolates resistant to ertapenem. Results: Of the 427 colonization samples obtained from rectal swabs of neonates in the Neonatal Intensive Care Unit (NICU), 46 (11%) samples were identified as ESBL producers. The distribution of the most frequently identified species using Phoenix BD TM was as follows: Enterobacter cloacae (N=12; 26%), Klebsiella pneumoniae and Klebsiella aerogenes (N=10; 22% each), and Escherichia coli (N=7; 15%). Through MALDI-TOF MS, the most frequently identified species were Klebsiella aerogenes and Enterobacter cloacae (N=10; 22%, both), followed by Escherichia coli (N=7; 15%) and Klebsiella pneumoniae (N=6; 13%). The highest resistance rates were observed for Ampicillin/Sulbactam (85%) and Ceftriaxone (83%), followed by Piperacillin/Tazobactam (50%), Cefepime (39%), and Ceftazidime (35%); 15% of the samples demonstrated resistance to Ertapenem. The ESBL phenotype was detected in 37% (17/46) of the samples, with E. coli being the most common species (7/17; 41%), followed by K. pneumoniae (6/17; 35%). The carbapenemase production phenotype was detected in three (43%) of the seven isolates tested. Conclusions: The most prevalent gene was blaCTX-M, present in 15 samples (33%), followed by blaSHV, present in six samples (13%), and blaTEM, present in five samples (11%). No samples producing KPC, NDM-1, and OXA-48 were identified by PCR, and this was further confirmed by the NG-Carba test. Our study revealed that 11% of the 427 samples examined produced ESBL, and these bacteria circulating in the HUAP NICU have a higher prevalence of the CTX-M gene. This underscores the importance of surveillance cultures in monitoring neonatal colonization to contain the spread of bacteria with these resistance mechanisms, thereby reducing future infections.64 f.Xavier, Analucia Rampazzohttp://lattes.cnpq.br/1450682878713091Chagas, Thiago Pavoni Gomeshttp://lattes.cnpq.br/6666508861219415Fialho, Susana Cristina Aidé Vivianihttp://lattes.cnpq.br/3599851303319012Souza, Cláudia Rezende Vieira de Mendonçahttp://lattes.cnpq.br/9742270645420446Pellegrino, Flávia Lúcia Piffano Costahttp://lattes.cnpq.br/3356811239031225http://lattes.cnpq.br/0419577660154595Vaz, Suzana dos Santos2024-08-01T18:07:26Z2024-08-01T18:07:26Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfVAZ, Suzana dos Santos. Análise fenotípica e genotípica de enterobactérias produtoras de B-lactamases de espectro estendido (ESBL) associadas a colonização de neonatos em um hospital universitário no Rio de Janeiro. 2024. 64 f. 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