Investigação do perfil de expressão de isoformas de p53 em linhagens celulares de leucemia linfoblástica aguda de células precursoras b (lla-b)
| Ano de defesa: | 2026 |
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Resumo: | A leucemia linfoblástica aguda de linhagem B (LLA-B) é uma neoplasia hematológica marcada por elevada heterogeneidade biológica e molecular. Embora o gene TP53 exerça papel central no controle do estresse celular, mutações estruturais nesse gene são raras ao diagnóstico na LLA-B pediátrica, indicando que mecanismos regulatórios alternativos possam modular a via p53. Nesse contexto, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar, de forma descritiva, o perfil de expressão das isoformas de p53 em amostras de pacientes com LLA-B e em um modelo celular in vitro. Foram analisados dados de RNA-seq de uma coorte pública do consórcio TARGET, descrevendo-se os níveis de expressão, a frequência de detecção das isoformas e sua distribuição entre subtipos moleculares e parâmetros clínicos selecionados. Observou-se ampla variabilidade interindividual nos níveis de expressão das isoformas. As isoformas canônicas p53α e Δ133p53α apresentaram expressão detectável na maioria dos pacientes (>90%), enquanto isoformas como Δ133p53γ foram detectadas em uma fração menor da coorte (≈30%). Não foram observadas diferenças estatisticamente significativas nos níveis de expressão entre os subtipos moleculares avaliados, nem para a maioria dos parâmetros clínicos analisados. Em relação ao primeiro evento clínico, a isorma Δ133p53α apresentou níveis de expressão significativamente mais elevados em pacientes com evento (p = 0,029). No modelo celular RS4;11, identificou-se a expressão de todas as isoformas estudadas, com destaque nos níveis de expressão para as isoformas Δ40p53 e p53β. Em conjunto, os resultados indicam que as isoformas de p53 estão expressas já ao diagnóstico da LLA-B pediátrica, exibindo variação quantitativa no nível de expressão dessas pacientes, mas não haja havendo associação com os subtipos moleculares clássicos e demais parâmetros clínicos avaliados, fornecendo uma base descritiva para investigações funcionais futuras quanto ao potencial papel dessas isoformas nessa na LLA-B. |
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Nesse contexto, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar, de forma descritiva, o perfil de expressão das isoformas de p53 em amostras de pacientes com LLA-B e em um modelo celular in vitro. Foram analisados dados de RNA-seq de uma coorte pública do consórcio TARGET, descrevendo-se os níveis de expressão, a frequência de detecção das isoformas e sua distribuição entre subtipos moleculares e parâmetros clínicos selecionados. Observou-se ampla variabilidade interindividual nos níveis de expressão das isoformas. As isoformas canônicas p53α e Δ133p53α apresentaram expressão detectável na maioria dos pacientes (>90%), enquanto isoformas como Δ133p53γ foram detectadas em uma fração menor da coorte (≈30%). Não foram observadas diferenças estatisticamente significativas nos níveis de expressão entre os subtipos moleculares avaliados, nem para a maioria dos parâmetros clínicos analisados. Em relação ao primeiro evento clínico, a isorma Δ133p53α apresentou níveis de expressão significativamente mais elevados em pacientes com evento (p = 0,029). No modelo celular RS4;11, identificou-se a expressão de todas as isoformas estudadas, com destaque nos níveis de expressão para as isoformas Δ40p53 e p53β. Em conjunto, os resultados indicam que as isoformas de p53 estão expressas já ao diagnóstico da LLA-B pediátrica, exibindo variação quantitativa no nível de expressão dessas pacientes, mas não haja havendo associação com os subtipos moleculares clássicos e demais parâmetros clínicos avaliados, fornecendo uma base descritiva para investigações funcionais futuras quanto ao potencial papel dessas isoformas nessa na LLA-B.B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) is a hematological malignancy characterized by marked biological and molecular heterogeneity. Although TP53 plays a central role in cellular stress response, structural mutations in this gene are rare at diagnosis in pediatric B-ALL, suggesting that alternative regulatory mechanisms may modulate the p53 pathway. This study aimed to descriptively characterize the expression profile of p53 isoforms in pediatric B-ALL patient samples and in an in vitro cellular model. RNA-seq data from a public TARGET cohort were analyzed to determine isoform expression levels, detection frequency, and distribution across molecular subtypes and selected clinical parameters. A broad interindividual variability in isoform expression levels was observed. The canonical isoforms p53α and Δ133p53α were detectable in more than 90% of patients, whereas Δ133p53γ was detected in approximately 30% of cases. No statistically significant differences in expression levels were identified among molecular subtypes or for most clinical parameters analyzed. Regarding first clinical event, Δ133p53α showed significantly higher expression levels in patients who experienced an event (p = 0.029), a finding interpreted within the exploratory nature of the study. In the RS4;11 cell line, all evaluated isoforms were expressed, with higher relative expression levels of Δ40p53 and p53β. Together, these findings indicate that p53 isoforms are expressed at diagnosis in pediatric B-ALL, display quantitative variability among patients, and are not associated with classical molecular subtypes or most clinical parameters, providing a descriptive framework for future functional investigations.71 p.CC-BY-NCinfo:eu-repo/semantics/openAccessInvestigação do perfil de expressão de isoformas de p53 em linhagens celulares de leucemia linfoblástica aguda de células precursoras b (lla-b)Investigation of the expression profile of p53 isoforms in cell lines of B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (B-ALL)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisleucemia linfoblástica agudaTP53isoformas de p53bioinformáticaRT-qPCRNeoplasiaGenes TP53Gene P53Gene supressoracute lymphoblastic leukemiap53 isoformsTP53bioinformaticsRT- qPCRMestrado acadêmicoUniversidade Federal FluminenseInstituto BiomédicoPrograma de Pós-Graduação em Ciências Biomédicas (Fisiologia e Farmacologia)2026Niterói, RJObjetivo 3. Assegurar uma vida saudável e promover o bem-estar para todos, em todas as idadesporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFFORIGINALDISSERTAÇÃO_Priscila Brandão.pdfDISSERTAÇÃO_Priscila Brandão.pdfDissertaçãoapplication/pdf1244498https://app.uff.br/riuff/bitstream/1/44009/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O_Priscila%20Brand%c3%a3o.pdfb45f56ad3a89719339fa54b064029f81MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81866https://app.uff.br/riuff/bitstream/1/44009/2/license.txt43cd690d6a359e86c1fe3d5b7cba0c9bMD521/440092026-08-17 11:49:47.485oai:app.uff.br:1/44009TElDRU7Dh0EgREUgRElTVFJJQlVJw4fDg08gTsODTy1FWENMVVNJVkEKCkNvbSBhIGFwcmVzZW50YcOnw6NvIGRlc3RhIGxpY2Vuw6dhLCB2b2PDqiAobyBhdXRvciAoZXMpIG91IG8gdGl0dWxhciBkb3MgZGlyZWl0b3MgZGUgYXV0b3IpIGNvbmNlZGUgYW8gUmVwb3NpdMOzcmlvIApJbnN0aXR1Y2lvbmFsIG8gZGlyZWl0byBuw6NvLWV4Y2x1c2l2byBkZSByZXByb2R1emlyLCAgdHJhZHV6aXIgKGNvbmZvcm1lIGRlZmluaWRvIGFiYWl4byksIGUvb3UgZGlzdHJpYnVpciBhIApzdWEgcHVibGljYcOnw6NvIChpbmNsdWluZG8gbyByZXN1bW8pIHBvciB0b2RvIG8gbXVuZG8gbm8gZm9ybWF0byBpbXByZXNzbyBlIGVsZXRyw7RuaWNvIGUgZW0gcXVhbHF1ZXIgbWVpbywgaW5jbHVpbmRvIG9zIApmb3JtYXRvcyDDoXVkaW8gb3UgdsOtZGVvLgoKVm9jw6ogY29uY29yZGEgcXVlIG8gRGVwb3NpdGEgcG9kZSwgc2VtIGFsdGVyYXIgbyBjb250ZcO6ZG8sIHRyYW5zcG9yIGEgc3VhIHB1YmxpY2HDp8OjbyBwYXJhIHF1YWxxdWVyIG1laW8gb3UgZm9ybWF0byAKcGFyYSBmaW5zIGRlIHByZXNlcnZhw6fDo28uCgpWb2PDqiB0YW1iw6ltIGNvbmNvcmRhIHF1ZSBvIERlcG9zaXRhIHBvZGUgbWFudGVyIG1haXMgZGUgdW1hIGPDs3BpYSBkZSBzdWEgcHVibGljYcOnw6NvIHBhcmEgZmlucyBkZSBzZWd1cmFuw6dhLCBiYWNrLXVwIAplIHByZXNlcnZhw6fDo28uCgpWb2PDqiBkZWNsYXJhIHF1ZSBhIHN1YSBwdWJsaWNhw6fDo28gw6kgb3JpZ2luYWwgZSBxdWUgdm9jw6ogdGVtIG8gcG9kZXIgZGUgY29uY2VkZXIgb3MgZGlyZWl0b3MgY29udGlkb3MgbmVzdGEgbGljZW7Dp2EuIApWb2PDqiB0YW1iw6ltIGRlY2xhcmEgcXVlIG8gZGVww7NzaXRvIGRhIHN1YSBwdWJsaWNhw6fDo28gbsOjbywgcXVlIHNlamEgZGUgc2V1IGNvbmhlY2ltZW50bywgaW5mcmluZ2UgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMgCmRlIG5pbmd1w6ltLgoKQ2FzbyBhIHN1YSBwdWJsaWNhw6fDo28gY29udGVuaGEgbWF0ZXJpYWwgcXVlIHZvY8OqIG7Do28gcG9zc3VpIGEgdGl0dWxhcmlkYWRlIGRvcyBkaXJlaXRvcyBhdXRvcmFpcywgdm9jw6ogZGVjbGFyYSBxdWUgCm9idGV2ZSBhIHBlcm1pc3PDo28gaXJyZXN0cml0YSBkbyBkZXRlbnRvciBkb3MgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMgcGFyYSBjb25jZWRlciBhbyBEZXBvc2l0YSBvcyBkaXJlaXRvcyBhcHJlc2VudGFkb3MgCm5lc3RhIGxpY2Vuw6dhLCBlIHF1ZSBlc3NlIG1hdGVyaWFsIGRlIHByb3ByaWVkYWRlIGRlIHRlcmNlaXJvcyBlc3TDoSBjbGFyYW1lbnRlIGlkZW50aWZpY2FkbyBlIHJlY29uaGVjaWRvIG5vIHRleHRvIApvdSBubyBjb250ZcO6ZG8gZGEgcHVibGljYcOnw6NvIG9yYSBkZXBvc2l0YWRhLgoKQ0FTTyBBIFBVQkxJQ0HDh8ODTyBPUkEgREVQT1NJVEFEQSBURU5IQSBTSURPIFJFU1VMVEFETyBERSBVTSBQQVRST0PDjU5JTyBPVSBBUE9JTyBERSBVTUEgQUfDik5DSUEgREUgRk9NRU5UTyBPVSBPVVRSTyAKT1JHQU5JU01PLCBWT0PDiiBERUNMQVJBIFFVRSBSRVNQRUlUT1UgVE9ET1MgRSBRVUFJU1FVRVIgRElSRUlUT1MgREUgUkVWSVPDg08gQ09NTyBUQU1Cw4lNIEFTIERFTUFJUyBPQlJJR0HDh8OVRVMgCkVYSUdJREFTIFBPUiBDT05UUkFUTyBPVSBBQ09SRE8uCgpPIERlcG9zaXRhIHNlIGNvbXByb21ldGUgYSBpZGVudGlmaWNhciBjbGFyYW1lbnRlIG8gc2V1IG5vbWUgKHMpIG91IG8ocykgbm9tZShzKSBkbyhzKSBkZXRlbnRvcihlcykgZG9zIGRpcmVpdG9zIAphdXRvcmFpcyBkYSBwdWJsaWNhw6fDo28sIGUgbsOjbyBmYXLDoSBxdWFscXVlciBhbHRlcmHDp8OjbywgYWzDqW0gZGFxdWVsYXMgY29uY2VkaWRhcyBwb3IgZXN0YSBsaWNlbsOnYS4KRepositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202026-08-17T14:49:47Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false |
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Investigação do perfil de expressão de isoformas de p53 em linhagens celulares de leucemia linfoblástica aguda de células precursoras b (lla-b) Brandão, Priscila Oliveira Lacê leucemia linfoblástica aguda TP53 isoformas de p53 bioinformática RT-qPCR Neoplasia Genes TP53 Gene P53 Gene supressor acute lymphoblastic leukemia p53 isoforms TP53 bioinformatics RT- qPCR |
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