Campylobacter jejuni: análise in silico de genomas para caracterização do perfil de genes de virulência e do sistema CRISPR-Cas em nível global

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Panzenhagen, Pedro Henrique Nunes
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://app.uff.br/riuff/handle/1/40717
Resumo: Campylobacter é uma das causas mais comuns de doenças diarreicas bacterianas em todo o mundo. São de interesse particular para a saúde publica, pois constantemente causam elevado número de infecções veiculadas por alimentos de origem animal. Entre as mais de trinta espécies descritas, Campylobacter jejuni (C. jejuni) é o mais comumente isolado de fontes fecais de aves sendo responsável por quase 90% dos casos das infecções causadas por Campylobacter em humanos. O interesse pelo estudo de C. jejuni aumentou nos últimos anos por causa da sua importância como patógeno e da facilidade ao acesso a novas tecnologias genéticas, principalmente o sequenciamento de nova geração capaz de sequenciar de forma eficaz o genoma bacteriano. Além disso, a biologia de C. jejuni é um tema intrigante e desafiador para comunidade médico-científica pois mecanismos perspicazes e interessantes de sobrevivência relacionados à transmissão e virulência dessa espécie ainda não foram descobertos e revelados detalhadamente como em outras bactérias. Esse estudo teve como objetivo geral caracterizar em um âmbito global o repertório de genes de virulência e investigar a possível correlação entre o sistema CRISPRCas e o aumento da resistência antimicrobiana identificada nos genomas de mais de 40.000 estirpes depositadas em banco de genomas públicos. Nesse propósito, detectamos uma notável diversidade na ocorrência de genes de virulência clinicamente relevantes para C. jejuni, em especial pela ausência total ou parcial dos genes essenciais flaA e flaB em um grande número de genomas de todos os continentes. Também demonstramos uma diferença significativa na distribuição de CRISPR-Cas entre genomas de estipes sem resistência antimicrobiana e estirpes com resistência a múltiplas drogas, fomentando os indícios de que o sistema CRISPR-Cas também está relacionado com o aumento da resistência antimicrobiana em C. jejuni. De maneira geral, os resultados desse estudo trouxeram evidencias inéditas sobre a virulência e o sistema CRISPR-Cas de C. jejuni apontando questões que podem ser discutidas e devem ser investigadas mais detalhadamente por toda a comunidade médico-científica com interesse no assunto.
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O interesse pelo estudo de C. jejuni aumentou nos últimos anos por causa da sua importância como patógeno e da facilidade ao acesso a novas tecnologias genéticas, principalmente o sequenciamento de nova geração capaz de sequenciar de forma eficaz o genoma bacteriano. Além disso, a biologia de C. jejuni é um tema intrigante e desafiador para comunidade médico-científica pois mecanismos perspicazes e interessantes de sobrevivência relacionados à transmissão e virulência dessa espécie ainda não foram descobertos e revelados detalhadamente como em outras bactérias. Esse estudo teve como objetivo geral caracterizar em um âmbito global o repertório de genes de virulência e investigar a possível correlação entre o sistema CRISPRCas e o aumento da resistência antimicrobiana identificada nos genomas de mais de 40.000 estirpes depositadas em banco de genomas públicos. Nesse propósito, detectamos uma notável diversidade na ocorrência de genes de virulência clinicamente relevantes para C. jejuni, em especial pela ausência total ou parcial dos genes essenciais flaA e flaB em um grande número de genomas de todos os continentes. Também demonstramos uma diferença significativa na distribuição de CRISPR-Cas entre genomas de estipes sem resistência antimicrobiana e estirpes com resistência a múltiplas drogas, fomentando os indícios de que o sistema CRISPR-Cas também está relacionado com o aumento da resistência antimicrobiana em C. jejuni. De maneira geral, os resultados desse estudo trouxeram evidencias inéditas sobre a virulência e o sistema CRISPR-Cas de C. jejuni apontando questões que podem ser discutidas e devem ser investigadas mais detalhadamente por toda a comunidade médico-científica com interesse no assunto.Campylobacter is one of the most common causes of bacterial diarrheal disease worldwide. They are of particular interest to public health, as they constantly cause a high number of foodborne infections. Among the more than thirty described species, the genus Campylobacter jejuni (C. jejuni) is the most commonly isolated from fecal sources, accounting for almost 90% of cases of infections caused by Campylobacter. The interest in the study of C. jejuni has increased in recent years because of its importance as a pathogen and the ease of access to new genetic technologies, especially next-generation sequencing capable of efficiently sequencing the bacterial genome. Furthermore, the biology of C. jejuni is an intriguing and challenging topic for the medical-scientific community because insightful and interesting survival mechanisms related to the transmission and virulence of this species have not yet been discovered and revealed in detail as in other bacteria. This study aimed to characterize the repertoire of virulence genes in a global scope and investigate the possible correlation between the CRISPR-Cas system and the increase in antimicrobial resistance identified in the genomes of more than 40,000 strains deposited in a public genomes database. To this end, we detected a remarkable diversity in the occurrence of clinically relevant virulence genes for C. jejuni, especially due to the total or partial absence of the essential genes flaA and flaB in a large number of genomes from all continents. We also demonstrated a significant difference in the distribution of CRISPR-Cas between genomes of strains without antimicrobial resistance and strains with multidrug resistance, furthering the evidence that the CRISPR-Cas system is also related to increased antimicrobial resistance in C. jejuni. In general, the results of this study brought unprecedented evidence on the virulence and the CRISPR-Cas system of C. jejuni, pointing out issues that can be discussed and that still can and should be investigated in more detail by the entire medicalscientific community with an interest in the field.66 f.Conte Júnior, Carlos Adamhttp://lattes.cnpq.br/6146781658944580Duque, Sheila da Silvahttp://lattes.cnpq.br/0411078194879223Aquino, Maria Helena Cosendey dehttp://lattes.cnpq.br/5312071022205725Alves, Fernando Joaquim Xavierhttp://lattes.cnpq.br/6464142423604727Pereira, Virginia Léo de Almeidahttp://lattes.cnpq.br/0129521821359619Alviano, Daniela Saleshttp://lattes.cnpq.br/2663274097733982Ferrari, Rafaela Gomeshttp://lattes.cnpq.br/1862579382379992http://lattes.cnpq.br/5723015460487567Panzenhagen, Pedro Henrique Nunes2025-11-04T12:55:23Z2025-11-04T12:55:23Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfPANZENHAGEN, Pedro Henrique Nunes. 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