População-alvo de ambientes e modelagem da interação de genótipos por ambientes em feijão-comum

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Cruz, Demila Duarte da Mata lattes
Orientador(a): Resende, Rafael Tassinari lattes
Banca de defesa: Resende, Rafael Tassinari lattes, Torga, Paula Pereira lattes, Menezes, Renato de Carvalho lattes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Goiás
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EA)
Departamento: Escola de Agronomia - EA (RMG)
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/14735
Resumo: Environmental variability associated with global climate change imposes significant challenges to agriculture. In this context, understanding the genotype × environment (G × E) interaction becomes essential to develop adapted and stable cultivars with high performance under diverse conditions. Therefore, this study aimed to evaluate the influence of G × E interaction on the productivity of common bean (Phaseolus vulgaris L.) through the analysis of multi-environment trials (METs) conducted by Embrapa Rice and Beans between 2011 and 2018. A total of 424 experimental trials were analyzed, including 241 carioca-type and 183 black-type trials, totaling 87 genotypes evaluated across 71 locations. The Target Population of Environments (TPE) was characterized using the TPEmap function, which, based on geographic polygons, allows parametrizations such as pixel size, buffers, and concavity. This approach enabled the identification of the spatial pattern of experiments and facilitated the integration of genotypic, environmental, and spatial data in envirotyping studies. The estimation of genetic and environmental effects was performed using REML/BLUP mixed linear models, complemented by multivariate analyses such as GGE Biplot and missing data imputation through principal component analysis (PCA). Environmental stratification and the definition of mega-environments allowed grouping locations with similar characteristics based on the presence or absence of G × E interaction and highlighted the influence of geographic distance on phenotypic responses. The analysis of cultivar stability and adaptability was based on a ranking derived from the PRVG, MHPRVG, Lin and Binns, Wi, and FW indices, considering their specificities, and revealed distinct behavioral patterns across growing seasons. The results underscore the fundamental role of integrated statistical modeling and spatial analysis in cultivar recommendation, guiding common bean breeding strategies in the face of environmental heterogeneity.
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In this context, understanding the genotype × environment (G × E) interaction becomes essential to develop adapted and stable cultivars with high performance under diverse conditions. Therefore, this study aimed to evaluate the influence of G × E interaction on the productivity of common bean (Phaseolus vulgaris L.) through the analysis of multi-environment trials (METs) conducted by Embrapa Rice and Beans between 2011 and 2018. A total of 424 experimental trials were analyzed, including 241 carioca-type and 183 black-type trials, totaling 87 genotypes evaluated across 71 locations. The Target Population of Environments (TPE) was characterized using the TPEmap function, which, based on geographic polygons, allows parametrizations such as pixel size, buffers, and concavity. This approach enabled the identification of the spatial pattern of experiments and facilitated the integration of genotypic, environmental, and spatial data in envirotyping studies. The estimation of genetic and environmental effects was performed using REML/BLUP mixed linear models, complemented by multivariate analyses such as GGE Biplot and missing data imputation through principal component analysis (PCA). Environmental stratification and the definition of mega-environments allowed grouping locations with similar characteristics based on the presence or absence of G × E interaction and highlighted the influence of geographic distance on phenotypic responses. The analysis of cultivar stability and adaptability was based on a ranking derived from the PRVG, MHPRVG, Lin and Binns, Wi, and FW indices, considering their specificities, and revealed distinct behavioral patterns across growing seasons. The results underscore the fundamental role of integrated statistical modeling and spatial analysis in cultivar recommendation, guiding common bean breeding strategies in the face of environmental heterogeneity.A variabilidade ambiental associada às mudanças climáticas globais impõe desafios significativos à agricultura. Diante desse cenário, compreender a interação entre genótipos × ambientes (G × A) torna-se essencial para desenvolver cultivares adaptadas e estáveis, com alto desempenho em diferentes condições. Para tanto, este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar a influência da interação G × A na produtividade do feijão-comum (Phaseolus vulgaris L.) por meio da análise de ensaios multiambientais (METs) conduzidos pela Embrapa Arroz e Feijão entre 2011 e 2018. Foram analisados 424 ensaios experimentais, sendo 241 ensaios do tipo carioca e 183 do tipo preto, totalizando 87 genótipos avaliados em 71 locais. A População Alvo de Ambientes (TPE, do inglês Target Population of Environments) foi caracterizada utilizando a função TPEmap, a qual, com base em polígonos geográficos, permite parametrizações como tamanho do pixel, buffers e concavidade. Essa abordagem possibilitou a identificação do padrão espacial dos experimentos e facilitou a integração dos dados genotípicos, ambientais e espaciais em estudos de ambientômica. A estimativa dos efeitos genéticos e ambientais foi realizada por meio de modelos lineares mistos REML/BLUP, complementada por análises multivariadas, como o GGE Biplot, e pela imputação de dados ausentes utilizando análise por componentes principais (PCA). A estratificação ambiental e a delimitação de mega-ambientes possibilitaram agrupar locais com características semelhantes, com base na presença ou ausência da interação G × A, além de evidenciar a influência da distância geográfica nas respostas fenotípicas. A análise de estabilidade e adaptabilidade das cultivares foi baseada em um ranqueamento a partir dos índices PRVG, MHPRVG, Lin e Binns, Wi e FW, considerando-se suas particularidades, e revelou padrões distintos de comportamento entre as safras. Os resultados destacam o papel fundamental da modelagem estatística integrada à análise espacial para a recomendação de cultivares, direcionando as estratégias de melhoramento do feijão frente à heterogeneidade ambiental.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade Federal de GoiásPrograma de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EA)UFGBrasilEscola de Agronomia - EA (RMG)http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessPhaseolus vulgaris L.TPEmap functionAmbientômicaModelos lineares mistosEnvirotypingLinear mixed modelsCIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIAPopulação-alvo de ambientes e modelagem da interação de genótipos por ambientes em feijão-comumTarget Population of Environments and Modeling of Genotype- by-Environment Interaction in Common Beaninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFGinstname:Universidade Federal de Goiás (UFG)instacron:UFGLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/27b950e5-a28b-4058-a1a6-8013d57252f6/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALDissertação - Demila Duarte da Mata Cruz - 2025.pdfDissertação - Demila Duarte da Mata Cruz - 2025.pdfapplication/pdf5194973https://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/68d895bb-7be8-4468-890a-166bd5fe9842/download51f2bb8d1c0e222e975a9992f3e8a2c8MD52CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8805https://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/1ce757e5-bee4-47d6-8ca1-31a3d8d4ced2/download4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347MD52tede/147352025-09-24 16:07:36.523http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Acesso Abertoopen.accessoai:repositorio.bc.ufg.br:tede/14735https://repositorio.bc.ufg.br/tedeRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.bc.ufg.br/tedeserver/oai/requestgrt.bc@ufg.bropendoar:oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/12342025-09-24T19:07:36Repositório Institucional da UFG - Universidade Federal de Goiás (UFG)falseTk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=
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