Mapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo branco

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2014
Autor(a) principal: Lima, Igor Almeida
Orientador(a): Santos, João Bosco dos
Banca de defesa: Garcia, Antônio Augusto Franco, Abreu, Ângela de Fátima Barbosa, Balestre, Márcio, Rodrigues, José Airton Nunes
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Programa de Pós-Graduação: DBI - Departamento de Biologia
Departamento: Não Informado pela instituição
País: BRASIL
Palavras-chave em Português:
Phaseolus vulgaris L.
Sclerotinia sclerotiorum
Desequilíbrio de ligação
QTL’s
Modelo misto
Linkage disequilibrium
Mixed models
Área do conhecimento CNPq:
CNPQ_NÃO_INFORMADO
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/4693
Resumo: Tese apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas, área de concentração em Genética e Melhoramento de Plantas, para a obtenção do título de doutor.
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spelling 2014-12-01T10:48:45Z2014-12-01T10:48:45Z20142014-07-24LIMA, I. A. Mapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo branco. 2014. 64 p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2014.https://repositorio.ufla.br/handle/1/4693Tese apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas, área de concentração em Genética e Melhoramento de Plantas, para a obtenção do título de doutor.The associative mapping by the Linkage Disequilibrium study with the aid of the matrices of population structure and parentage related regions of DNA with interest traits. Among the advantages of this technique are: access exploration of germplasm and lines-elite without the need of the development of controlled populations. It is important to emphasize that the mapping of QTL’s and the association mapping are complementary methodologies. The objective of this study was to confirm/identify new QTL’s for reaction to white mold directly on the lines of VCU trials and ELITE program of bean breeding of the Federal University of Lavras. For reaction to white mold were analyzed 144 lines of the assays: VCU and the ELITE program in four environments. For three crops in the field, it was used design triple square lattice partially unbalanced, and for the fourth environment, in the greenhouse, the randomized block design with two replications. For associative analysis, it was used the mixed model (Q + K). The matrices Q and K are used to contemplate the population structure and parentage respectively in the group of individuals/lines of interest. These matrices were estimated by microsatellite SSR and AFLP markers. It was confirmed some markers linked to QTL’s for reaction to white mold, previously identified in exotic cultivars, including SSR BMd15, BMd20. It was identified other markers such as EagcMcag810 and EaaaMcat655 for reaction to white mold. All these markers were identified directly in the lines used in the breeding program of the Minas Gerais state. Thus, it was confirmed the associative mapping as a technique with great potential to assist in the choice of genitors for future crosses, as well as a tool for achieving greater genetic gains for white mold resistance.O mapeamento associativo pelo estudo do Desequilíbrio de Ligação com o auxílio das matrizes da estrutura da população e de parentesco relaciona regiões do DNA com caracteres de interesse. Entre as vantagens dessa técnica estão: a exploração de acessos de germoplasma e linhagens-elite sem a necessidade do desenvolvimento de populações controladas. É importante enfatizar que o mapeamento de Quantitative Trait Loci (QTL’s) e o mapeamento associativo são metodologias complementares. Objetivou-se com este estudo confirmar/identificar novos QTL’s para reação ao mofo branco diretamente nas linhagens dos ensaios de VCU e do programa ELITE de melhoramento do feijoeiro da Universidade Federal de Lavras. Foram analisadas 144 linhagens dos ensaios VCU e do programa ELITE em quatro ambientes para reação ao mofo branco. Para três safras em campo foi utilizado o delineamento látice quadrado triplo parcialmente desbalanceado, e para o quarto ambiente, em casa de vegetação, o delineamento de blocos casualizados com duas repetições. Para a análise associativa utilizou-se o modelo misto (Q + K). A matriz Q e matriz K são utilizadas para se contemplar a estrutura populacional e de parentesco respectivamente no grupo de indivíduos/linhagens de interesse. Essas matrizes foram estimadas por marcadores microssatélite SSR e AFLP. Confirmaram-se alguns marcadores ligados a QTL’s para reação ao mofo branco, anteriormente identificados em cultivares exóticas, entre eles o SSR BMd15 e o BMd20. Identificou-se outros marcadores tais como EagcMcag810 e EaaaMcat655 para reação ao mofo branco. Todos esses marcadores foram identificados diretamente nas linhagens utilizadas no programa de melhoramento do estado de Minas Gerais. Dessa forma confirmou-se o mapeamento associativo como uma técnica de grande potencial para auxiliar na escolha de genitores para futuros cruzamentos, bem como ferramenta para obtenção de maiores ganhos genéticos para resistência ao mofo branco.Fundação de Amparo à Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG)Genética e Melhoramento de PlantasUNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDBI - Departamento de BiologiaUFLABRASILCNPQ_NÃO_INFORMADOPhaseolus vulgaris L.Sclerotinia sclerotiorumDesequilíbrio de ligaçãoQTL’sModelo mistoLinkage disequilibriumMixed modelsMapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo brancoAssociation mapping for common bean reaction to white moldinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisSantos, João Bosco dosGarcia, Antônio Augusto FrancoAbreu, Ângela de Fátima BarbosaBalestre, MárcioRodrigues, José Airton NunesLima, Igor Almeidainfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLALICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/c8c51f95-0ac9-4ac2-b265-cc58e01e3a44/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD51falseAnonymousREADORIGINALTESE_Mapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo branco.pdfTESE_Mapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo branco.pdfapplication/pdf495179https://repositorio.ufla.br/bitstreams/8cdc18c9-2d78-4b8b-a84b-68d2bab7b7db/download6cf84ae4059dfd8d587bca46def092eaMD52trueAnonymousREADTEXTTESE_Mapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo branco.pdf.txtTESE_Mapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo branco.pdf.txtExtracted texttext/plain99303https://repositorio.ufla.br/bitstreams/b1448a32-569a-4272-ba53-7ca2d2afaf0f/downloadb118682f12a1769dd6c3b030ae84785cMD53falseAnonymousREADTHUMBNAILTESE_Mapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo branco.pdf.jpgTESE_Mapeamento associativo para reação do feijoeiro ao mofo branco.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2736https://repositorio.ufla.br/bitstreams/1fffbafb-1a19-4ab7-8728-2b64ee429269/downloada677cdd681eeaa0dbb501aa3f889f66bMD54falseAnonymousREAD1/46932025-08-06 11:11:02.338open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/4693https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-06T14:11:02Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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