Fenômica e integração de transcritômica e metabolômica na análise das respostas de Gliricidia sepium (Jacq.) Steud. E Portulaca oleracea L. ao estresse salino

• Ano de defesa: 2021
• Autor(a) principal: Silva, Thalliton Luiz Carvalho da
• Orientador(a): Souza Junior, Manoel Teixeira
• Banca de defesa: Souza Júnior, Manoel Teixeira, Valadares, Leonardo Fonseca, Sousa, Carlos Antônio Ferreira de, Silva, Vivianny Nayse Belo
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal
• Departamento: Não especifica vinculação com nenhum departamento
• País: brasil
• Palavras-chave em Português: Solos - Salinidade; Multi-ômica; Salinidade; Estresse abiótico; Soils - Salinity; Multi-omics; Abiotic stress
• Área do conhecimento CNPq: Genética Vegetal
• Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/48315

A salinidade do solo é um dos estresses abióticos que mais ameaçam a agricultura. Este estresse está presente em mais de 100 países ao redor do mundo. Devido a estimativa de um aumento populacional mundial para cerca de 9 bilhões de pessoas em 2050 e, consequentemente, um aumento da demanda por produtos agrícolas, a pressão para a utilização dessas áreas tem aumentado. O objetivo geral do presente estudo foi aplicar estratégias de análise individual e integrada de dados ômicos provenientes de transcritômica e metabolômica visando ganhar conhecimento sobre os mecanismos moleculares responsáveis pela tolerância à salinidade observada em Gliricidia sepium e Portulaca oleracea. Para tal, foram utilizados dados do banco de dados “Sal da Terra”, pertencentes ao programa de PD&I de mesmo nome desenvolvido na Embrapa Agroenergia, que contempla dados de fenômica, ionômica, genômica, transcritômica (mRNA e microRNA), metabolômica e proteômica caracterizando a resposta de dendê (Elaeis guineensis), beldroega (Portulaca oleracea) e gliricídia (Gliricidia sepium) ao estresse salino. As amostras do transcritoma foram submetidas a uma análise de RNA-Seq usando uma plataforma Illumina HiSeq e a estratégia “paired-end”, a análise dos dados foi feita com o software OmicsBox versão 1.3. As amostras de metaboloma foram analisadas em um sistema UHPLC equipado com uma coluna de fase reversa. A espectrometria de massa de alta resolução (HRMS) foi realizada em um analisador Q-TOF usando fonte de eletrospray em ESI (+) - MS e ESI (-) - MS. Os dados adquiridos foram pré-processados usando o XCMS Online e posteriormente exportados para o MetaboAnalyst para análises estatísticas, anotação e observação das vias metabólicas. A plataforma Omics Fusion, foi utilizada para realizar a análise integrativa entre transcritos e metabólitos. Os resultados alcançados permitiram correlacionar e diferenciar grupos de plantas submetidas ao estresse salino, revelando genes / transcritos, metabólitos e vias responsivas a este estresse tanto em gliricídia, quanto em beldroega.