Prospecção e caracterização de SNP‟s relacionados à qualidade de carne ovina

• Ano de defesa: 2015
• Autor(a) principal: Esteves, Claudiana
• Orientador(a): Faria, Peter Bitencourt
• Banca de defesa: Peconick, Ana Paula, França, Patrícia Maria de, Livramento, Kalynka Gabriella do
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias
• Departamento: Departamento de Medicina Veterinária
• País: brasil
• Palavras-chave em Português: Polimorfismo; PCR-SSCP; Maciez da carne; Deposição de gordura; Polymorphism; Meat tenderness; Fat deposition
• Área do conhecimento CNPq: Produção Animal
• Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/10844

Objetivou-se com este trabalho, avaliar o polimorfismo por análise de mutações simples (SNP) de sete genes relacionados ao desenvolvimento muscular, à maciez e ao perfil lipídico da carne ovina (Calpastatina - CAST, Miostatina - GDF8, Estearol CoA Dessaturase – SCD, Domínio da Tioesterase – TE, Ácido Graxo Sintase – FASN e Diacilglicerol Aciltransferase -DGAT 1 e 2). Para o experimento, foram utilizados um total de 84 ovinos machos, constituídos em seis grupos genéticos, sendo estes derivados do cruzamento entre as raças: Santa Inês x Santa Inês, Santa Inês x Black Dorper, Santa Inês x White Dorper, Santa Inês x Texel, Santa Inês x Lacaune e Santa Inês x East Friesian. O delineamento foi inteiramente casualizado (DIC), com 6 (seis) tratamentos correspondendo aos cruzamentos com aproximadamente 14 (quatorze) repetições, onde cada animal foi considerado uma repetição. Em busca dos polimorfismos, foram realizadas análises baseadas na técnica PCRSSCP, que revelou diferentes padrões de leituras no gel de poliacrilamida. Os polimorfismos foram identificados a partir do sequenciamento das amostras com o auxílio do software livre Sequence Scanner Software (Applied Biosystems). A técnica de SSCP detectou um padrão único de banda nos genes DGAT-1 e SCD; dois padrões de bandas no gene FASN, três padrões nos genes GDF-8 e TE e quatro padrões nos genes CAST e DGAT-2. No gene CAST foram identificados quatro genótipos (AA, AB, BB e BC) e o sequenciamento identificou dois polimorfismos (c.227A>G; c.383A>G) que resultaram na troca do ácido glutâmico por glicina e treonina por alanina respectivamente. Já, para o gene GDF-8 foram observados três genótipos (DD, DE e FF) e o sequenciamento evidenciou a presença de 4 polimorfismos, nos quais não resultaram trocas de aminoácidos. No gene DGAT-2 foram identificados quatro genótipos (MO, MP, NP e MQ) e o sequenciamento, resultou na presença dois polimorfismos (c.229T>C; c.255T>C) que resultaram na troca da fenilalanina por leucina. No gene FASN, foram identificados dois genótipos (RS e RR). No gene TE, foram identificados três genótipos (TV, TT e UV) e o sequenciamento resultou na presença de 4 polimorfismos. Os genes DGAT-1 e SCD não relevaram, neste estudo, a presença de polimorfismo. Os resultados obtidos indicaram que o gene CAST, o gene GDF8 e o DGAT-2 apresentaram polimorfismos com mudanças na sequência de aminoácidos, podendo ou não resultar mudança na conformação final da proteína. Já, os genes DGAT-1 e SCD não apresentaram padrões diferenciados e nem SNPs e o gene FASN apresentou apenas padrões de bandas diferentes, mas sem SNPs.