Caracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiro

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: Campos, Kátia Regina de Andrade lattes
Orientador(a): Souza, Elaine Aparecida de
Banca de defesa: Pereira, Fernanda Aparecida Castro, Costa, Maria Cristina Mendes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas
Departamento: Departamento de Biologia
País: brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/55250
Resumo: No feijoeiro comum, o gênero Colletotrichum está entre os fitopatógenos economicamente importantes para a cultura. Várias espécies de Colletotrichum têm sido isoladas do feijoeiro. A técnica molecular de Rep-PCR vem sendo utilizada como alternativa na identificação de fitopatógenos e em estudos de variabilidade genética pela obtenção de fingerprint e pode ser uma alternativa promissora na diferenciação de fungos do gênero Colletotrichum. Portanto, o objetivo deste trabalho é caracterizar isolados de Colletotrichum spp do feijoeiro por meio de da técnica de Rep-PCR e verificar a ocorrência de "switching" de colônias minus e plus. Foram utilizados isolados de C. lindemuthianum, C. sojae, C. karstii e C. plurivorum. A análise molecular foi realizada pela técnica Rep-PCR utilizando primers BOX, ERIC e REP, para obtenção de fingerprint. A caracterização morfológica foi realizada quanto ao tipo de colônia. Foi realizado o teste de compatibilidade sexual entre os isolados. Todos os primers utilizados neste estudo foram capazes de amplificar o DNA genômico e gerar perfis de banda com reprodutibilidade para todos os isolados testados. O marcador BOX revelou uma quantidade de polimorfismo muito baixa, o que impossibilitou a diferenciação das espécies por meio deste marcador. O marcador ERIC gerou polimorfismo, mas em uma quantidade também insuficiente para configurar a diferenciação eficiente dessas espécies. Levando-se em consideração as espécies em estudo, apenas o marcador REP foi capaz de detectar polimorfismo interespecífico e que apresentaram melhor resultado. Na análise de compatibilidade sexual, somente as combinações UFLA 13-1A x UFLA13-2A e UFLA13-1A x UFLA15-5 promoveram a formação de peritécios com ascos e ascósporos na linha de contato entre as colônias, sugerindo compatibilidade sexual. As progênies oriundas do cruzamento entre UFLA13-1A e UFLA13-2A na análise molecular, confirmaram os dados da análise individual de cada genitor, ou seja, ambos os genitores apresentaram o mesmo perfil para todos os marcadores utilizados. Portanto, estes marcadores não são adequados para verificar a ocorrência de cruzamento entre estes isolados. No entanto, o primer REP reproduziu um padrão de banda nas progênies de ambos os genitores (UFLA 13-1A e UFLA 15-5) as quais estão presentes em todas as progênies evidenciando a ocorrência de cruzamento entres estes isolados. A técnica utilizando o primer REP permitiu a diferenciação entre os isolados avaliados e evidenciou a ocorrência de cruzamento. A presença de colônias periteciais Plus e Minus, e conidiais evidencia a ocorrência de mudança de plus para minus no isolado UFLA 13-A1 em monocultivo e em cruzamento com UFLA15-5.
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spelling 2022-09-30T20:00:30Z2022-09-30T20:00:30Z2022-09-302022-06-30CAMPOS, K. R. de A. Caracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiro. 2022. 51 p. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2022.https://repositorio.ufla.br/handle/1/55250No feijoeiro comum, o gênero Colletotrichum está entre os fitopatógenos economicamente importantes para a cultura. Várias espécies de Colletotrichum têm sido isoladas do feijoeiro. A técnica molecular de Rep-PCR vem sendo utilizada como alternativa na identificação de fitopatógenos e em estudos de variabilidade genética pela obtenção de fingerprint e pode ser uma alternativa promissora na diferenciação de fungos do gênero Colletotrichum. Portanto, o objetivo deste trabalho é caracterizar isolados de Colletotrichum spp do feijoeiro por meio de da técnica de Rep-PCR e verificar a ocorrência de "switching" de colônias minus e plus. 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Na análise de compatibilidade sexual, somente as combinações UFLA 13-1A x UFLA13-2A e UFLA13-1A x UFLA15-5 promoveram a formação de peritécios com ascos e ascósporos na linha de contato entre as colônias, sugerindo compatibilidade sexual. As progênies oriundas do cruzamento entre UFLA13-1A e UFLA13-2A na análise molecular, confirmaram os dados da análise individual de cada genitor, ou seja, ambos os genitores apresentaram o mesmo perfil para todos os marcadores utilizados. Portanto, estes marcadores não são adequados para verificar a ocorrência de cruzamento entre estes isolados. No entanto, o primer REP reproduziu um padrão de banda nas progênies de ambos os genitores (UFLA 13-1A e UFLA 15-5) as quais estão presentes em todas as progênies evidenciando a ocorrência de cruzamento entres estes isolados. A técnica utilizando o primer REP permitiu a diferenciação entre os isolados avaliados e evidenciou a ocorrência de cruzamento. A presença de colônias periteciais Plus e Minus, e conidiais evidencia a ocorrência de mudança de plus para minus no isolado UFLA 13-A1 em monocultivo e em cruzamento com UFLA15-5.In common bean, the genus Colletotrichum is among the economically important phytopathogen groups for the crop. Several species of Colletotrichum have been isolated from common bean. Molecular techniques have been used as an alternative in the identification of phytopathogens. The REP PCR technique has been used in studies of genetic variability by obtaining fingerprints for fungi and may be a promising alternative in the differentiation of fungi of the genus Colletotrichum. The objective of this work is to characterize Colletotrichum spp isolates from common bean using Rep-PCR markers and to verify the occurrence of "switching" of minus and plus colonies. Isolates of C. lindemuthianum, C. soyae, C. karstii and C. plurivorum were used. Molecular analysis was performed using the Rep-PCR technique using BOX, ERIC and REP primers to obtain a fingerprint. The morphological characterization was carried out regarding the type of colony. The sexual compatibility test between the isolates was performed. All primers used in this study were able to amplify genomic DNA and generate band profiles with reproducibility for all isolates tested. The BOX marker revealed a very low amount of polymorphism, which made it impossible to differentiate the species using this marker. The ERIC marker generated polymorphism, but in an amount that was also insufficient to configure the efficient differentiation of these species. Taking into account the species under study, it can be observed that only the REP marker was able to detect interspecific polymorphism and that they presented better results. In the analysis of sexual compatibility, only the combinations UFLA 13-1A x UFLA13-2A and UFLA13-1A x UFLA15-5 promoted the formation of perithecia with asci and ascospores in the contact line between the colonies, suggesting sexual compatibility. The progenies from the cross between UFLA13-1A and UFLA13-2A in the molecular analysis, confirmed the data of the individual analysis of each parent, that is, both parents showed the same profile for all the markers used. Therefore, these markers are not suitable for verifying the occurrence of outcrossing between these isolates. However, the REP primer reproduced a band pattern in the progenies of both parents, for the contact line formed between UFLA 13-1A and UFLA 15-5, which are present in all progenies, evidencing the occurrence of crossing between these isolates. The technique using the REP primer allowed the differentiation between the evaluated isolates and evidenced the occurrence of crossing. The presence of plus and minus peritetial colonies, and conidials evidence the occurrence of a change from plus to minus in the UFLA 13-A1 isolate in monoculture and in crosses with UFLA15-5.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de PlantasUFLAbrasilDepartamento de BiologiaGenética VegetalMarcadores Rep-PCRColletotrichumSwitchingRep-PCR markersCaracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisSouza, Elaine Aparecida dePereira, Fernanda Aparecida CastroCosta, Maria Cristina Mendeshttp://lattes.cnpq.br/6396319595133397Campos, Kátia Regina de Andradeinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLALICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/233e5563-f796-4f96-8be9-67f1af2acd81/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD51falseAnonymousREADORIGINALDISSERTAÇÃO_Caracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiro.pdfDISSERTAÇÃO_Caracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiro.pdfapplication/pdf1240995https://repositorio.ufla.br/bitstreams/e0c1c1c2-a25d-482d-b906-98daf7a1a924/download957ec908fd4c8ec92d005a03138e2a8aMD52trueAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO_Caracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiro.pdf.txtDISSERTAÇÃO_Caracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiro.pdf.txtExtracted texttext/plain86872https://repositorio.ufla.br/bitstreams/cd4b49a4-4956-49cd-bbf4-2d0c038a745d/downloadb183c4f5f59b7a77d4c64e93e02ba1dbMD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO_Caracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiro.pdf.jpgDISSERTAÇÃO_Caracterização molecular e morfológica de isolados de Colletotricuhm spp. associadas ao feijoeiro.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3260https://repositorio.ufla.br/bitstreams/7cc093d5-7770-4ca6-926b-fbd8c0946545/downloadb0e7836f7cbcf6f47a972502c549929aMD54falseAnonymousREAD1/552502025-08-06 11:15:45.576open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/55250https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-06T14:15:45Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)falseREVDTEFSQcOHw4NPIERFIERJU1RSSUJVScOHw4NPIE7Dg08tRVhDTFVTSVZBCk8gcmVmZXJpZG8gYXV0b3I6CmEpIERlY2xhcmEgcXVlIG8gZG9jdW1lbnRvIGVudHJlZ3VlIMOpIHNldSB0cmFiYWxobyBvcmlnaW5hbCwgZSBxdWUKZGV0w6ltIG8gZGlyZWl0byBkZSBjb25jZWRlciBvcyBkaXJlaXRvcyBjb250aWRvcyBuZXN0YSBsaWNlbsOnYS4KRGVjbGFyYSB0YW1iw6ltIHF1ZSBhIGVudHJlZ2EgZG8gZG9jdW1lbnRvIG7Do28gaW5mcmluZ2UsIHRhbnRvIHF1YW50bwpsaGUgw6kgcG9zc8OtdmVsIHNhYmVyLCBvcyBkaXJlaXRvcyBkZSBxdWFscXVlciBvdXRyYSBwZXNzb2Egb3UKZW50aWRhZGUuCmIpIFNlIG8gZG9jdW1lbnRvIGVudHJlZ3VlIGNvbnTDqW0gbWF0ZXJpYWwgZG8gcXVhbCBuw6NvIGRldMOpbSBvcwpkaXJlaXRvcyBkZSBhdXRvciwgZGVjbGFyYSBxdWUgb2J0ZXZlIGF1dG9yaXphw6fDo28gZG8gZGV0ZW50b3IgZG9zCmRpcmVpdG9zIGRlIGF1dG9yIHBhcmEgY29uY2VkZXIgw6AgVW5pdmVyc2lkYWRlIEZlZGVyYWwgZGUgTGF2cmFzIG9zCmRpcmVpdG9zIHJlcXVlcmlkb3MgcG9yIGVzdGEgbGljZW7Dp2EsIGUgcXVlIGVzc2UgbWF0ZXJpYWwgY3Vqb3MKZGlyZWl0b3Mgc8OjbyBkZSB0ZXJjZWlyb3MgZXN0w6EgY2xhcmFtZW50ZSBpZGVudGlmaWNhZG8gZSByZWNvbmhlY2lkbwpubyB0ZXh0byBvdSBjb250ZcO6ZG8gZG8gZG9jdW1lbnRvIGVudHJlZ3VlLiBTZSBvIGRvY3VtZW50byBlbnRyZWd1ZSDDqQpiYXNlYWRvIGVtIHRyYWJhbGhvIGZpbmFuY2lhZG8gb3UgYXBvaWFkbyBwb3Igb3V0cmEgaW5zdGl0dWnDp8OjbyBxdWUKbsOjbyBhIFVuaXZlcnNpZGFkZSBGZWRlcmFsIGRlIExhdnJhcywgZGVjbGFyYSBxdWUgY3VtcHJpdSBxdWFpc3F1ZXIKb2JyaWdhw6fDtWVzIGV4aWdpZGFzIHBlbG8gcmVzcGVjdGl2byBjb250cmF0byBvdSBhY29yZG8uCgo=
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