Estudo de epidemiologia molecular de Shigella spp. revela a possível origem clonal de amostras multirresistentes a antibióticos
| Ano de defesa: | 2004 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-15032024-153458/ |
Resumo: | O gênero Shigella pertence à família Enterobacteriaceae. Ele é divido em 4 \"espécies\" patogênicas para o homem, de acordo com características bioquímicas e antigênicas: S. sonnei, S. boydii, S. flexneri e S. dysenteriae. Essa divisão é apenas didática, pois experimentos de hibridação de DNA sugerem que o gênero é composto por uma única espécie que também compreenderia Escherichia coli. Shigella spp é freqüentemente associada a infecções intestinais denominadas shiguelose ou disenteria bacilar. Na região de Ribeirão Preto existe um quadro endêmico de casos de Shigella spp. No período de janeiro de 1999 a fevereiro de 2000, foram isoladas 64 amostras de Shigella spp. pela Unidade de Emergência do Hospital das Clínicas de Ribeirão Preto, as quais foram caracterizadas quanto à \"espécie\" e tiveram sua sensibilidade a antibióticos analisada, revelando que 35,13% das amostras eram multirresistentes. Foram também analisadas seis amostras de S. dysenteriae e uma de S. boydii cedidas pelo Instituto Adolfo Lutz de Ribeirão Preto. No presente trabalho a tipagem molecular de tais amostras foi realizada utilizando a técnica de PCR de elementos repetitivos, com iniciadores específicos para as seqüências ERIC e REP, e tipagem por ribotipagem, para verificar se tais metodologias seriam eficientes na discriminação das amostras e identificar diferenças genotípicas entre as quatro \"espécies\" de Shigella spp. Tal análise revelou que REP e ERIC-PCR foram mais eficientes do que ribotipagem na discriminação das amostras analisadas e revelou também que S. sonnei e S. flexneri compartilham mais características em comum entre si do que essas em relação a S. dysenteríae e S. boydii. Os dados ainda sugerem uma possível origem clonal de amostras multirresistentes, já que estas apresentaram grande similaridade genética. O presente trabalho revelou também através do ERIC-PCR uma região do genoma destas bactérias conservada entre as amostras de Shigella spp. que poderia ser utilizada para fins diagnósticos. A função biológica das seqüências ERIC ainda é muito especulativa e desconhecida. Os resultados aqui descritos sugerem a existência de uma pressão seletiva para manter essas seqüências ERIC intactas em uma região específica do genoma. Portanto, uma melhor caracterização desta região genômica poderia revelar a significância biológica das seqüências ERIC. |
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Estudo de epidemiologia molecular de Shigella spp. revela a possível origem clonal de amostras multirresistentes a antibióticosMolecular epidemiology study of Shigella spp. reveals the possible clonal origin of multidrug-resistant samplesAntibiotic susceptibilityERIC-PCRERIC-PCRMolecular typingMultirresistênciaREP-PCRREP-PCRRibotipagemRibotypingSensibilidade a antibióticosShigellaShigellaTipagem molecularO gênero Shigella pertence à família Enterobacteriaceae. Ele é divido em 4 \"espécies\" patogênicas para o homem, de acordo com características bioquímicas e antigênicas: S. sonnei, S. boydii, S. flexneri e S. dysenteriae. Essa divisão é apenas didática, pois experimentos de hibridação de DNA sugerem que o gênero é composto por uma única espécie que também compreenderia Escherichia coli. Shigella spp é freqüentemente associada a infecções intestinais denominadas shiguelose ou disenteria bacilar. Na região de Ribeirão Preto existe um quadro endêmico de casos de Shigella spp. No período de janeiro de 1999 a fevereiro de 2000, foram isoladas 64 amostras de Shigella spp. pela Unidade de Emergência do Hospital das Clínicas de Ribeirão Preto, as quais foram caracterizadas quanto à \"espécie\" e tiveram sua sensibilidade a antibióticos analisada, revelando que 35,13% das amostras eram multirresistentes. Foram também analisadas seis amostras de S. dysenteriae e uma de S. boydii cedidas pelo Instituto Adolfo Lutz de Ribeirão Preto. No presente trabalho a tipagem molecular de tais amostras foi realizada utilizando a técnica de PCR de elementos repetitivos, com iniciadores específicos para as seqüências ERIC e REP, e tipagem por ribotipagem, para verificar se tais metodologias seriam eficientes na discriminação das amostras e identificar diferenças genotípicas entre as quatro \"espécies\" de Shigella spp. Tal análise revelou que REP e ERIC-PCR foram mais eficientes do que ribotipagem na discriminação das amostras analisadas e revelou também que S. sonnei e S. flexneri compartilham mais características em comum entre si do que essas em relação a S. dysenteríae e S. boydii. Os dados ainda sugerem uma possível origem clonal de amostras multirresistentes, já que estas apresentaram grande similaridade genética. O presente trabalho revelou também através do ERIC-PCR uma região do genoma destas bactérias conservada entre as amostras de Shigella spp. que poderia ser utilizada para fins diagnósticos. A função biológica das seqüências ERIC ainda é muito especulativa e desconhecida. Os resultados aqui descritos sugerem a existência de uma pressão seletiva para manter essas seqüências ERIC intactas em uma região específica do genoma. Portanto, uma melhor caracterização desta região genômica poderia revelar a significância biológica das seqüências ERIC.The genus Shigella is a member of the Enterobacteriacea family. lt is divided in 4 patogenic \"species\", according to biochemicals and antigenic characteristics: S. sonnei, S. boydii, S. flexneri e S. dysenteriae. This division is merely didactic, since DNA hybridization experiments have shown that the genus is composed of only one especie which would also include E. coli. Shigella spp. is frequently associated to intestinal infections, also called shigelosis or bacillar dysentery. ln the Ribeirão Preto area, Shigella spp. is an endemic microorganism. From january 1999 to february 2000 there were 64 isolates of Shigella spp. registered by the Unidade de Emergência of the Hospital das Clinicas, which were characterized at the \"species\" level, and by antibiogram, revealing that 35,13% of them were multiresistant samples (MR). Six isolates of S. dysenteriae and one of S. boydii, offered by the Instituto Adolfo Lutz de Ribeirão Preto were also analized. ln the present work, these samples were analized by different molecular typing methods, which included repetitive elements PGR, using the ERIC and REP primers, and typing by ribotyping. These methods were used to determine the similarity existing between these isolates and to analize whether these methods are efficient in discriminating the four Shigella spp. \"species\" in different groups. The analysis revealed that REP and ERIC-PCR were more efficient than ribotyping in discriminating the different isolates, and also revealed that S. sonnei and S. flexneri are more related than with S. dysenteriae and S. boydii. The data also suggest a possible clonal origin of the multiresistant isolates, since they share a great deal of genetic similarity. The present work showed that the ERIC-PCR amplifications revealed a conserved region on the Shigella spp. genoma that could possibly be used as a diagnostic marker. The biological function of ERIC sequences is a matter of speculation and it is presently unknown. The results here described suggested the existence of a selective pressure to maintain ERIC sequences intact in a specific genomic region. Thus, a better characterization of this genomic region could reveal the biological significance of the ERIC sequences.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPBrocchi, MarceloAcrani, Gustavo Olszanski2004-11-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-15032024-153458/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-03-15T18:58:02Zoai:teses.usp.br:tde-15032024-153458Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-03-15T18:58:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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