Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2010
Autor(a) principal: Silva, Luiz Gustavo Teixeira da
Orientador(a): Paiva, Luciano Vilela
Banca de defesa: Diniz, Leandro Eugenio Cardamone, Bordallo, Patrícia do Nascimento
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Programa de Pós-Graduação: PPBV - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal
Departamento: Não Informado pela instituição
País: BRASIL
Palavras-chave em Português:
cDNA
Musa spp
Extração de RNA
RT-PCR
Expressão gênica
Banana - Produção
Engenharia genética
Área do conhecimento CNPq:
CNPQ_NÃO_INFORMADO
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/5247
Resumo: Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, área de concentração em Biotecnologia Vegetal, para obtenção do título de “Mestre”.
id UFLA_34f4861693883dc2bbb699eef1d554f4
oai_identifier_str oai:repositorio.ufla.br:1/5247
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling 2015-03-18T11:04:40Z2015-03-18T11:04:40Z20152010-03-29SILVA, L. G. T. da. Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e QPCR. 2010. 70 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2010.https://repositorio.ufla.br/handle/1/5247Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, área de concentração em Biotecnologia Vegetal, para obtenção do título de “Mestre”.A bananeira é uma planta tropical de grande importância econômica. Seu fruto é amplamente consumido em todo mundo e sua produção é de grande impacto social, pois fixa a mão de obra no campo e movimenta a economia local, gerando renda e empregos diretos e indiretos. A bananicultura enfrenta problemas em sua produção ligados aos fatores bióticos, sendo os mais danosos os causados por fungos, e também por fatores abióticos como ventos e déficit hídrico que também interferem no ciclo produtivo da bananeira causando prejuízos em sua produção. Sendo a segunda fruta mais produzida no mundo em 2008 com uma produção de 89.099.503 t (FAO, 2010), a banana apresenta diferentes graus de esterilidade, e isso dificulta os programas de melhoramento convencionais. Neste contexto, o emprego de técnicas de engenharia genética, destacando dentre elas a caracterização de promotores tecido-específicos, desponta como uma alternativa bastante viável, favorecendo a aplicação de técnicas mais refinadas da manipulação do genoma, como emprego da cisgenia que visa o manejo dos genes da própria espécie em questão. No presente trabalho, foi utilizado seqüências gênicas previamente selecionadas através de um virtual screening no banco de dados DATAmusa. Estas sequências permitiram desenhar primers que posteriormente foram submetidos a uma reação em cadeia da polimerase (PCR) utilizando cDNA obtidos do RNA extraído de sete diferentes tecidos de duas cultivares de bananeira, Grande Naine e Prata Anã afim de identifica-las no genoma da bananeira em caráter tecido-específico. Desta forma, identificando a seqüência gênica deduz-se a presença do promotor tecido específico, que a partir de sua caracterização, pode-se avançar pelas novas fronteiras conquistadas com a evolução da engenharia genética, como por exemplo, a cisgenia, que consiste na manipulação do próprio genoma do organismo em estudo.The banana tree is a tropical plant of great economical importance. Its fruit is worldwidely consumed and its production exerts a great social impact, for it keeps the labor on the field which steers the local economy, hence creating income through direct and indirect jobs. The banana crop has been facing many biotic problems mainly caused by fungi as well as by abiotic stress such as winds and drought. Such problems has affected the crops productive cycle thus reducing its production. Being the second most produced fruit in the world 2008, with a 89.099t yield (FAO, 2010), this species presents different degree of sterility which affects the conventional breeding programs. The employment of genetic engineering techniques could be used to solve such problems. Thus, the characterization of promoters that drives the specific tissue gene expression becomes of great importance, for it also allows the use of genes from the same species in a cisgenic approach. In the current work, gene sequences previously selected through virtual screening taken from DATAmusa gene bank, were analyzed. In order to study the promoter expression, these sequences allowed designing primers for PCR reactions having cDNA obtained from seven different tissues collected from Grande Naine and Prata Anã cultivars. Therefore once the tissue gene expression is characterized, we can identify powerful promoters for cisgenic approach.Biotecnologia VegetalUNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASPPBV - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia VegetalUFLABRASILCNPQ_NÃO_INFORMADOcDNAMusa sppExtração de RNART-PCRExpressão gênicaBanana - ProduçãoEngenharia genéticaCaracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCRinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisPaiva, Luciano VilelaDiniz, Leandro Eugenio CardamoneBordallo, Patrícia do NascimentoSilva, Luiz Gustavo Teixeira dainfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLAORIGINALDISSERTACAO_Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR.pdfDISSERTACAO_Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR.pdfapplication/pdf4083177https://repositorio.ufla.br/bitstreams/00714117-242c-4df2-9d76-d3cc85eddae8/download5a7c07d35ec0d86a610b231cb23aa8f4MD51trueAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/bc9d1f06-3b70-4a96-8b9d-34729e2ec91b/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADTEXTDISSERTACAO_Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR.pdf.txtDISSERTACAO_Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR.pdf.txtExtracted texttext/plain102638https://repositorio.ufla.br/bitstreams/c054b655-1da7-4a48-b2d9-bdf7b5fa6667/download1822626cd510f8fcfa6fdc03ea2f2d33MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTACAO_Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR.pdf.jpgDISSERTACAO_Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2668https://repositorio.ufla.br/bitstreams/b9bfc163-7140-4b73-95d6-e30586f2e9ab/download9880ac82838018ed3874b91b6a216b77MD54falseAnonymousREAD1/52472025-08-07 09:46:23.331open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/5247https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-07T12:46:23Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR
title Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR
spellingShingle Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR
Silva, Luiz Gustavo Teixeira da
CNPQ_NÃO_INFORMADO
cDNA
Musa spp
Extração de RNA
RT-PCR
Expressão gênica
Banana - Produção
Engenharia genética
title_short Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR
title_full Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR
title_fullStr Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR
title_full_unstemmed Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR
title_sort Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR
author Silva, Luiz Gustavo Teixeira da
author_facet Silva, Luiz Gustavo Teixeira da
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Paiva, Luciano Vilela
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Diniz, Leandro Eugenio Cardamone
Bordallo, Patrícia do Nascimento
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Luiz Gustavo Teixeira da
contributor_str_mv Paiva, Luciano Vilela
Diniz, Leandro Eugenio Cardamone
Bordallo, Patrícia do Nascimento
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ_NÃO_INFORMADO
topic CNPQ_NÃO_INFORMADO
cDNA
Musa spp
Extração de RNA
RT-PCR
Expressão gênica
Banana - Produção
Engenharia genética
dc.subject.por.fl_str_mv cDNA
Musa spp
Extração de RNA
RT-PCR
Expressão gênica
Banana - Produção
Engenharia genética
description Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, área de concentração em Biotecnologia Vegetal, para obtenção do título de “Mestre”.
publishDate 2010
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2010-03-29
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-18T11:04:40Z
dc.date.available.fl_str_mv 2015-03-18T11:04:40Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2015
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SILVA, L. G. T. da. Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e QPCR. 2010. 70 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2010.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/handle/1/5247
identifier_str_mv SILVA, L. G. T. da. Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e QPCR. 2010. 70 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2010.
url https://repositorio.ufla.br/handle/1/5247
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
dc.publisher.program.fl_str_mv PPBV - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFLA
dc.publisher.country.fl_str_mv BRASIL
publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/bitstreams/00714117-242c-4df2-9d76-d3cc85eddae8/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/bc9d1f06-3b70-4a96-8b9d-34729e2ec91b/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/c054b655-1da7-4a48-b2d9-bdf7b5fa6667/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/b9bfc163-7140-4b73-95d6-e30586f2e9ab/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 5a7c07d35ec0d86a610b231cb23aa8f4
760884c1e72224de569e74f79eb87ce3
1822626cd510f8fcfa6fdc03ea2f2d33
9880ac82838018ed3874b91b6a216b77
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1854947790160920576

Registros relacionados