Proteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeído

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Gonçalves, Michelle Carlota lattes
Orientador(a): Piccoli, Roberta Hilsdorf
Banca de defesa: Dorneles, Elaine Maria Seles, Pereira, Alcilene de Abreu, Souza, Angelica Cristina de, Silva, Monique Suela
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Lavras
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Microbiologia Agrícola
Departamento: Departamento de Biologia
País: brasil
Palavras-chave em Português:
Bactérias patogênicas
Antimicrobianos naturais
Adaptação microbiana
Bioinformática
Paintomics
Pathogenic bacterias
Natural antimicrobial
Microbial adaptation
Bioinformatics
Área do conhecimento CNPq:
Microbiologia Agrícola
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/48572
Resumo: Este estudo analisou comparativamente a resposta adaptativa da bactéria patogênica Escherichia coli Enteropatogênica (EPEC) frente ao cinamaldeído, componente majoritário do óleo essencial de canela (Cinnamomum cassia) como alternativa aos antimicrobianos convencionalmente utilizados. Objetivou identificar quais proteínas, bem como mecanismos adaptativos estão envolvidas na resposta de EPEC ao estresse quando submetida a dose subletal do antimicrobiano favorecendo a adaptação da bactéria a doses antes consideradas letais. Após análises em nanoUPLC-MSE foram identificadas 196 proteínas distribuídas entre os grupos experimentais e dessas, 107 foram diferencialmente expressas, dentre as quais, 13 foram superexpressas (p>0, 95) e 94 subexpressas (p<0, 05) nas células adaptadas. Das proteìnas reguladas positivamente, a maioria é citoplasmática e perfazem proteinase relacionadas a processos metabólicos celulares, como lipoproteína de ancoragem de peptídeoglicano (lpp), chaperona envolvidas na resposta ao estresse (ClpB; groL; ahpC), proteinas envolvidas na catálise de reações enzimáticas acelerando reações metabólicas (pgi; pflB; grcA; deoD; gapA; tdcE), metabolismo de carboidratos, aminoácidos (Cada), proteína envolvida na regulação da homeostase (trxA) e uma proteína que ainda não foi caracterizada (yfcZ). Enquanto isso, proteinase relacionadas a tradução, biossíntese lipídica, condensação cromossômica, processos biossintéticos da acetil-CoA, transporte de prótons acoplados a síntese de ATP, ligação de ácido nucleico, biossíntese de proteínas e de carboidratos e divisão celular foram reguladas negativamente, condizendo que agentes extressantes afetam os processos celulares, contribuindo para adaptação. Os resultados obtidos neste estudo mostraram que EPEC apresentou alterações metabólicas significativas quando em presença do antimicrobiano cinamaldeído.
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spelling 2021-12-01T21:07:20Z2021-12-01T21:07:20Z2021-12-012021-09-30GONÇALVES, M. C. Proteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeído. 2021. 85 p. Tese (Doutorado em Microbiologia Agrícola) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2021.https://repositorio.ufla.br/handle/1/48572Este estudo analisou comparativamente a resposta adaptativa da bactéria patogênica Escherichia coli Enteropatogênica (EPEC) frente ao cinamaldeído, componente majoritário do óleo essencial de canela (Cinnamomum cassia) como alternativa aos antimicrobianos convencionalmente utilizados. Objetivou identificar quais proteínas, bem como mecanismos adaptativos estão envolvidas na resposta de EPEC ao estresse quando submetida a dose subletal do antimicrobiano favorecendo a adaptação da bactéria a doses antes consideradas letais. Após análises em nanoUPLC-MSE foram identificadas 196 proteínas distribuídas entre os grupos experimentais e dessas, 107 foram diferencialmente expressas, dentre as quais, 13 foram superexpressas (p>0, 95) e 94 subexpressas (p<0, 05) nas células adaptadas. Das proteìnas reguladas positivamente, a maioria é citoplasmática e perfazem proteinase relacionadas a processos metabólicos celulares, como lipoproteína de ancoragem de peptídeoglicano (lpp), chaperona envolvidas na resposta ao estresse (ClpB; groL; ahpC), proteinas envolvidas na catálise de reações enzimáticas acelerando reações metabólicas (pgi; pflB; grcA; deoD; gapA; tdcE), metabolismo de carboidratos, aminoácidos (Cada), proteína envolvida na regulação da homeostase (trxA) e uma proteína que ainda não foi caracterizada (yfcZ). Enquanto isso, proteinase relacionadas a tradução, biossíntese lipídica, condensação cromossômica, processos biossintéticos da acetil-CoA, transporte de prótons acoplados a síntese de ATP, ligação de ácido nucleico, biossíntese de proteínas e de carboidratos e divisão celular foram reguladas negativamente, condizendo que agentes extressantes afetam os processos celulares, contribuindo para adaptação. Os resultados obtidos neste estudo mostraram que EPEC apresentou alterações metabólicas significativas quando em presença do antimicrobiano cinamaldeído.This study comparatively analyzed the adaptive response of the pathogenic Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) against cinnamaldehyde, the major component of cinnamon essential oil (Cinnamomum cassia) as an alternative to conventionally used antimicrobials. It aimed to identify which proteins, as well as adaptive mechanisms, are involved in the EPEC response to stress when subjected to a sublethal dose of the antimicrobial, favoring the adaptation of the bacteria to doses previously considered lethal. After analysis in nanoUPLC-MSE, 196 proteins were identified, distributed among the experimental groups, and of these, 107 were differentially expressed, among which 13 were overexpressed (p>0.95) and 94 underexpressed (p<0.05) in adapted cells. Of the up-regulated proteins, most are cytoplasmic and make up proteinase related to cellular metabolic processes, such as peptide-glycan anchoring lipoprotein (lpp), chaperone involved in the stress response (ClpB; groL; ahpC), proteins involved in the catalysis of enzymatic reactions accelerating metabolic reactions (pgi; pflB; grcA; deoD; gapA; tdcE), carbohydrate metabolism, amino acids (Cada), protein involved in the regulation of homeostasis (trxA) and a protein that has not yet been characterized (yfcZ). Meanwhile, translation-related proteinase, lipid biosynthesis, chromosomal condensation, acetyl-CoA biosynthetic processes, proton transport coupled to ATP synthesis, nucleic acid binding, protein and carbohydrate biosynthesis, and cell division were down-regulated, meaning that stressful agents affect cellular processes, contributing to adaptation. The results obtained in this study showed that EPEC presented significant metabolic alterations when in the presence of the antimicrobial cinnamaldehyde.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em Microbiologia AgrícolaUFLAbrasilDepartamento de BiologiaMicrobiologia AgrícolaBactérias patogênicasAntimicrobianos naturaisAdaptação microbianaBioinformáticaPaintomicsPathogenic bacteriasNatural antimicrobialMicrobial adaptationBioinformaticsProteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeídoProteomics of enteropathogenic escherichia coli in response to cinamaldehydeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisPiccoli, Roberta HilsdorfDorneles, Elaine Maria SelesPereira, Alcilene de AbreuSouza, Angelica Cristina deSilva, Monique Suelahttp://lattes.cnpq.br/0340389194015034Gonçalves, Michelle Carlotainfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLALICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/bca406d9-c395-4bb4-abef-08defac3b18a/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD51falseAnonymousREADORIGINALTESE_Proteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeído.pdfTESE_Proteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeído.pdfapplication/pdf2350757https://repositorio.ufla.br/bitstreams/076e7582-8c15-41f3-81a9-3c23d827a53d/downloada0192f1743ba620cc44f3f7360871841MD52trueAnonymousREADTEXTTESE_Proteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeído.pdf.txtTESE_Proteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeído.pdf.txtExtracted texttext/plain102486https://repositorio.ufla.br/bitstreams/7eb1d1aa-226b-422b-84b5-e23ab30f3945/downloadffea08ca364055d9d2f61c7114869bb3MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILTESE_Proteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeído.pdf.jpgTESE_Proteômica de Escherichia coli Enteropatogênica em resposta ao cinamaldeído.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3258https://repositorio.ufla.br/bitstreams/de050bfc-47b5-4474-b812-7c9a633cf407/download6e7e94792d73fe0f738abbfb7647796dMD54falseAnonymousREAD1/485722025-08-06 11:16:56.563open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/48572https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-06T14:16:56Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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