Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2009
Autor(a) principal: Souza, Thaís Cristina Silva de
Orientador(a): Cunha, Elaine Fontes Ferreira da
Banca de defesa: Paiva, Luciano Vilela, Freitas, Matheus Puggina de
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Programa de Pós-Graduação: DQI - Programa de Pós-graduação
Departamento: Não Informado pela instituição
País: BRASIL
Palavras-chave em Português:
AIDS
Protease
Inibidor peptídico
HIV-1
QSAR-5/6D
Peptide inhibitor
Área do conhecimento CNPq:
CNPQ_NÃO_INFORMADO
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/1338
Resumo: Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.
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spelling 2013-11-11T11:58:11Z2013-11-11T11:58:11Z201320132009-07-09SOUZA, T. C. S. de. Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease. 2009. 100 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.https://repositorio.ufla.br/handle/1/1338Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.A AIDS é uma doença provocada por um vírus específico, que afeta o sistema de defesa imunológico. HIV-1 protease é um homodímero, que desempenha o papel de "tesoura molecular" ao clivar diversas poliproteínas não funcionais em proteínas menores e funcionais, de forma a produzir proteínas maduras. Segundo o último informativo da The Joint United Nations Programme on HIV/AIDS - UNAIDS (2009), estima-se que vivem com HIV/AIDS 34.000.000 de pessoas em todo o mundo. Estudos quantitativos de relação estrutura-atividade em 5D e 6D (QSAR-5D e 6D), de 46 inibidores peptídicos com grupamento diol vicinal central da HIV-1 protease, foram realizados usando QSAR-5D (RAPTOR, Receptor as Poly Tier Object Representation) e QSAR-6D (QUASAR, The quase-atomistic receptor modeling). Doze compostos, que não fizeram parte dos cálculos na etapa de geração dos modelos, foram usados para validar os métodos QSAR-5D e 6D. Os modelos de QSAR-5D e 6D foram gerados apenas utilizando a metodologia dos mínimos quadrados parciais. O melhor modelo do método QSAR-5D gerou valores de R2Treinamento e R2Teste iguais a 0,944 e 0,793, respectivamente. O melhor modelo do método QSAR-6D gerou valores de R2Treinamento e R2Teste iguais a 0,001 e 0,-0,040, respectivamente. Os métodos servirão, portanto, para mapear os sítios de interação da série de compostos em estudo e propor modificações estruturais com o objetivo de torná-los mais potentes e, conseqüentemente, melhores inibidores da HIV-1 protease.AIDS is a disease provoked by a specific virus, which affects the immunologic defense system. HIV-1 protease is a homodimer, which plays the role of "molecular scissors" in cleaving several non-functional polyproteins into smaller and functional proteins in order to generate mature proteins. According to The Joint United Nations Programme on HIV/AIDS - UNAIDS (2009), latest informative, it is estimated that 34,000,000 persons live with HIV/AIDS all over the world. Quantitative studies of structure-activity relationship on 5D and 6D (QSAR-5D and 6D) of 46 peptide inhibitors with central vicinal diol grouping of HIV-1 protease, were performed by using QSAR-5D (RAPTOR, Receptor as Poly Tier Object Representation) and QSAR-6D (QUASAR, The quase-atomistic receptor modeling). Twelve compounds, which did not make part of the calculations at the step of generating the models, were used to validate the QSAR-5D and 6D methods. The QSAR-5D and 6D models were generated only by utilizing the partial least square methodology. The best model of the QSAR-5D method generated values of R2Training and R2Test equal to 0.944 and 0.793, respectively. The best model of the QSAR-6D method generated values of e R2Training and R2Test equal to 0.001 and 0.-0,040, respectively. Then, the methods will be useful to map the interaction sites of compounds under study and propose structural modifications with the objective of making them more potent and, consequently, better HIV-1 protease inhibitors.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)AgroquímicaUNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDQI - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILCNPQ_NÃO_INFORMADOAIDSProteaseInibidor peptídicoHIV-1QSAR-5/6DProteasePeptide inhibitorEstudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 proteaseQuantitative studies of correlation structure activity of peptides inhibiters of the HIV-1 proteaseinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisCunha, Elaine Fontes Ferreira daPaiva, Luciano VilelaFreitas, Matheus Puggina deSouza, Thaís Cristina Silva deinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLALICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/1bda204c-86df-4c0d-8967-2db1184d5e6d/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADORIGINALDISSERTAÇÃO Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease.pdfDISSERTAÇÃO Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease.pdfapplication/pdf2564037https://repositorio.ufla.br/bitstreams/53824cb7-cbd5-43c1-b836-33367df0d43c/download772655d40381b0f8e92f05c1a6a24af6MD51trueAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease.pdf.txtDISSERTAÇÃO Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease.pdf.txtExtracted texttext/plain103042https://repositorio.ufla.br/bitstreams/0fff9e5b-4565-4039-bb61-f79e26517600/download20e424d7b250d78c75bf8725d76c920dMD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease.pdf.jpgDISSERTAÇÃO Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2602https://repositorio.ufla.br/bitstreams/2d536311-01ca-4a69-9f2d-72ce40a7206d/downloadbad0a0ec5cec209670a67d6309ef063cMD54falseAnonymousREAD1/13382025-08-07 08:01:58.554open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/1338https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-07T11:01:58Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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