Emprego do eDNA metabarcoding na investigação da biodiversidade de peixes de um reservatório urbano
| Ano de defesa: | 2024 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Minas Gerais
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://hdl.handle.net/1843/75909 |
Resumo: | Biodiversity monitoring in aquatic environments is essential for ecosystem conservation and sustainable natural resource management. The use of non-invasive methods, such as environmental DNA (eDNA) metabarcoding, has emerged as an effective and promising alternative for studying aquatic species diversity. In this context, this project developed eDNA metabarcoding protocols for monitoring fish fauna in Lagoa dos Ingleses, a Neotropical freshwater artificial lake.. We also compared different eDNA collection methodologies and assessed their effectiveness for biodiversity elucidation. The choice of Lagoa dos Ingleses, an artificial lake located in Nova Lima, Minas Gerais, Brazil, as a model for improving fish monitoring is strategic, as it is an easily accessible site with a reduced fish fauna. The results indicate that the methodology can identify native, endemic, and introduced species, and provide information on the temporal and spatial variation of species occurrence in the reservoir. We identified 44 possible species, belonging to 39 genera and 22 families. We observed that the choice of the monitoring protocol influences the results, with Sterivex filters recovering the identification of more species, even with a smaller volume of filtered water. The sampling design employed was crucial, as the spatial and temporal variation of the species required monitoring of multiple points in different seasons to obtain a more complete picture of the reservoir's biodiversity. |
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2024-09-03T15:22:04Z2025-09-09T00:00:13Z2024-09-03T15:22:04Z2024-03-22https://hdl.handle.net/1843/75909Biodiversity monitoring in aquatic environments is essential for ecosystem conservation and sustainable natural resource management. The use of non-invasive methods, such as environmental DNA (eDNA) metabarcoding, has emerged as an effective and promising alternative for studying aquatic species diversity. In this context, this project developed eDNA metabarcoding protocols for monitoring fish fauna in Lagoa dos Ingleses, a Neotropical freshwater artificial lake.. We also compared different eDNA collection methodologies and assessed their effectiveness for biodiversity elucidation. The choice of Lagoa dos Ingleses, an artificial lake located in Nova Lima, Minas Gerais, Brazil, as a model for improving fish monitoring is strategic, as it is an easily accessible site with a reduced fish fauna. The results indicate that the methodology can identify native, endemic, and introduced species, and provide information on the temporal and spatial variation of species occurrence in the reservoir. We identified 44 possible species, belonging to 39 genera and 22 families. We observed that the choice of the monitoring protocol influences the results, with Sterivex filters recovering the identification of more species, even with a smaller volume of filtered water. The sampling design employed was crucial, as the spatial and temporal variation of the species required monitoring of multiple points in different seasons to obtain a more complete picture of the reservoir's biodiversity.CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorporUniversidade Federal de Minas GeraisRegião NeotropicalBiomonitoramentoDNA AmbientalIctiofaunaReservatório UrbanoMetabarcodingGenéticaMonitoramento BiológicoDNA ambientalOsteichthyesEmprego do eDNA metabarcoding na investigação da biodiversidade de peixes de um reservatório urbanoUsing eDNA metabarcoding to investigate the biodiversity of fish in an urban reservoirinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisGabriel Antônio Mendes de Britoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGhttp://lattes.cnpq.br/8573247637516819Daniel Cardoso de Carvalhohttp://lattes.cnpq.br/0351531509597193Heron Oliveira HilárioBruno Henrique SaranholiPatricia Sanae SujiiO monitoramento da biodiversidade em ambientes aquáticos é fundamental para a conservação dos ecossistemas e para o manejo sustentável dos recursos naturais. A utilização de métodos não invasivos, como o metabarcoding de DNA ambiental (eDNA), tem se mostrado uma alternativa eficaz e promissora para o estudo da diversidade de espécies aquáticas. Neste contexto, neste projeto desenvolvemos protocolos de eDNA metabarcoding para o monitoramento da ictiofauna na Lagoa dos Ingleses, um reservatório artificial de água doce na região Neotropical. Além disso, comparamos metodologias distintas de coleta de DNA ambiental e avaliamos sua efetividade para elucidação da biodiversidade. A escolha da Lagoa dos Ingleses, localizada em Nova Lima, Minas Gerais, Brasil, como modelo para o aperfeiçoamento do monitoramento de peixes é estratégica, pois é um local de fácil acesso com uma ictiofauna reduzida. Os resultados indicam que a metodologia tem a capacidade de realizar a identificação de espécies nativas, endêmicas e introduzidas, além de fornecer informações sobre a variação temporal e espacial da ocorrência de espécies no reservatório. Identificamos 44 espécies, pertencentes a 39 gêneros e 22 famílias. Observamos que a escolha do protocolo de monitoramento influencia nos resultados, com os filtros Sterivex recuperando a identificação de mais espécies, mesmo com menor volume de água filtrada. O desenho amostral empregado foi crucial, pois a variação espacial e temporal das espécies exigiu monitoramento de múltiplos pontos em diferentes temporadas para uma obtenção mais completa da biodiversidade do reservatório.https://orcid.org/0000-0002-1260-5993BrasilICB - DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA GERALPrograma de Pós-Graduação em GenéticaUFMGORIGINALdissertacao_GAMB_genetica_versaofinal_18abr.pdfapplication/pdf16876674https://repositorio.ufmg.br//bitstreams/7af1fcba-2633-4966-8b35-3a57e0f98bab/downloadb2279b1eeb9354ea27f117927f304c96MD51trueAnonymousREADLICENSElicense.txttext/plain2118https://repositorio.ufmg.br//bitstreams/1752f21c-c804-4218-81f0-0a2de80e3ce0/downloadcda590c95a0b51b4d15f60c9642ca272MD52falseAnonymousREAD1843/759092025-09-08 21:00:13.466open.accessoai:repositorio.ufmg.br:1843/75909https://repositorio.ufmg.br/Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oairepositorio@ufmg.bropendoar:2025-09-09T00:00:13Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)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 |
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