Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Cadena Mantilla, Diego Fernando
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: spa
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://dspace.unila.edu.br/handle/123456789/8605
Resumo: Disertación de maestría presentada al PPG-BC (Programa de Pos-Grado en Biociencias), del ILACVN (Instituto Latino-Americano de Ciencias de la Vida y de la Naturaleza), de la UNILA (Universidad Federal de la Integración Latino-Americana), como requisito parcial para obtener el título de Magister en Ciencias.
id UNIL_c8bba9428ec286e11c21efa0568f8e81
oai_identifier_str oai:dspace.unila.edu.br:123456789/8605
network_acronym_str UNIL
network_name_str Repositório Institucional da UNILA
repository_id_str
spelling Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.bancos molecularesDNA barcodingbiomonitoreoarroyos.Disertación de maestría presentada al PPG-BC (Programa de Pos-Grado en Biociencias), del ILACVN (Instituto Latino-Americano de Ciencias de la Vida y de la Naturaleza), de la UNILA (Universidad Federal de la Integración Latino-Americana), como requisito parcial para obtener el título de Magister en Ciencias.Secuenciar y analizar el ADN ha revolucionado la conservación y el monitoreo de la biodiversidad. Técnicas como el DNA barcoding y la metagenómica permiten la identificación de especies a partir de muestras ambientales sin requerir observación directa o cultivo en laboratorio. Estas técnicas son cruciales para detectar especies raras, invasoras o en peligro, y para evaluar la efectividad de las acciones de conservación mediante el seguimiento pre y post-intervención. El eDNA metabarcoding se destaca como una herramienta eficaz para la identificación de especies de peces utilizando el marcador molecular 12S. A pesar de sus ventajas, enfrenta desafíos como la ausencia de parámetros estandarizados y la falta de bases de datos completas. Este estudio desarrolló un protocolo optimizado de eDNA metabarcoding para monitorear peces en arroyos, superando problemas relacionados con el volumen de agua y el almacenamiento de muestras. Establecimos que filtrar 1.2 litros de agua, en dos etapas, a través de membranas de 0.70 y 0.45 µm es óptimo para recuperar comunidades de peces. El marcador NeoFish demostró una mejor resolución taxonómica, identificando un mayor número de especies con una alta coincidencia respecto a los estudios tradicionales. Sin embargo, la carencia de secuencias referencia para muchas especies neotropicales limita la precisión del método. Asi, se creó un banco de datos con secuencias de 46 nuevas especies para actualizar los registros globales, a partir del diseño de dos nuevos cebadores Forward y un cebador Reverse para el secuenciamiento de las secuencias 12S referencia enfocado en la ictiofauna regional. El eDNA metabarcoding reveló un mayor número de especies en comparación con los métodos tradicionales, aunque no todas las especies fueron identificadas, con mayor resolución con el banco de datos creado. Ambos métodos coincidieron en la identificación de especies abundantes, pero el eDNA detectó especies adicionales que no fueron capturadas o resultaron difíciles de capturar con métodos tradicionales. Este estudio subraya que, aunque el eDNA metabarcoding es una herramienta poderosa para la evaluación de la biodiversidad y su eficacia está condicionada por la calidad y exhaustividad de las bases de datos de referencia.2024-10-31T19:59:30Z2024-10-31T19:59:30Z2024info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfMANTILLA, Diego Fernando Cadena. 2024. Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding. Asesores: SCHNEIDER, Carlos Henrique (asesor); PEREIRA, Luiz Henrique (co-asesor). 119 h.. Disertación (Maestría) - PPG-BC (Programa de Postgrado en Biociencias), UNILA (Universidad Federal de la Integración Latinoamericana), Foz do Iguaçu.https://dspace.unila.edu.br/handle/123456789/8605Cadena Mantilla, Diego Fernando info:eu-repo/semantics/openAccessspareponame:Repositório Institucional da UNILAinstname:Universidade Federal da Integração Latino-Americana (UNILA)instacron:UNILA2024-11-03T06:00:57Zoai:dspace.unila.edu.br:123456789/8605Repositório InstitucionalPUBhttp://dspace.unila.edu.br/oai/requestopendoar:36362024-11-03T06:00:57Repositório Institucional da UNILA - Universidade Federal da Integração Latino-Americana (UNILA)false
dc.title.none.fl_str_mv Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.
title Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.
spellingShingle Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.
Cadena Mantilla, Diego Fernando
bancos moleculares
DNA barcoding
biomonitoreo
arroyos.
title_short Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.
title_full Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.
title_fullStr Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.
title_full_unstemmed Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.
title_sort Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding.
author Cadena Mantilla, Diego Fernando
author_facet Cadena Mantilla, Diego Fernando
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Cadena Mantilla, Diego Fernando
dc.subject.por.fl_str_mv bancos moleculares
DNA barcoding
biomonitoreo
arroyos.
topic bancos moleculares
DNA barcoding
biomonitoreo
arroyos.
description Disertación de maestría presentada al PPG-BC (Programa de Pos-Grado en Biociencias), del ILACVN (Instituto Latino-Americano de Ciencias de la Vida y de la Naturaleza), de la UNILA (Universidad Federal de la Integración Latino-Americana), como requisito parcial para obtener el título de Magister en Ciencias.
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2024-10-31T19:59:30Z
2024-10-31T19:59:30Z
2024
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv MANTILLA, Diego Fernando Cadena. 2024. Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding. Asesores: SCHNEIDER, Carlos Henrique (asesor); PEREIRA, Luiz Henrique (co-asesor). 119 h.. Disertación (Maestría) - PPG-BC (Programa de Postgrado en Biociencias), UNILA (Universidad Federal de la Integración Latinoamericana), Foz do Iguaçu.
https://dspace.unila.edu.br/handle/123456789/8605
identifier_str_mv MANTILLA, Diego Fernando Cadena. 2024. Desarrollo de un paquete tecnológico de monitoreo ambiental de peces basado en eDNA metabarcoding. Asesores: SCHNEIDER, Carlos Henrique (asesor); PEREIRA, Luiz Henrique (co-asesor). 119 h.. Disertación (Maestría) - PPG-BC (Programa de Postgrado en Biociencias), UNILA (Universidad Federal de la Integración Latinoamericana), Foz do Iguaçu.
url https://dspace.unila.edu.br/handle/123456789/8605
dc.language.iso.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNILA
instname:Universidade Federal da Integração Latino-Americana (UNILA)
instacron:UNILA
instname_str Universidade Federal da Integração Latino-Americana (UNILA)
instacron_str UNILA
institution UNILA
reponame_str Repositório Institucional da UNILA
collection Repositório Institucional da UNILA
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNILA - Universidade Federal da Integração Latino-Americana (UNILA)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1824953269130100736