Caracterização molecular dos Orthobunyavirus do grupo C

• Ano de defesa: 2015
• Autor(a) principal: Carla do Amaral Pinto
• Orientador(a): Paulo César Peregrino Ferreira
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Minas Gerais
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Microbiologia
• Departamento: ICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA
• País: Brasil
• Palavras-chave em Português: Microbiologia
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/1843/35516

Os vírus Caraparu (CARV), Apeu (APEUV) e Itaqui (ITQV) são arbovírus do sorogrupo C pertencentes ao gênero Orthobunyavirus da família Bunyaviridae. Estes vírus foram isolados pela primeira vez na Amazônia brasileira na década de 50 e a sua infecção em seres humanos é caracterizada por febre alta, mialgia e fotofobia, com 4-5 dias de duração. O genoma dos membros do sorogrupo C é constituídos por três segmentos de RNA de fita simples de polaridade negativa denominados S (~1000 pb), M (~4500 pb) e L (~7000 b). Estes vírus apresentam potencial de emergência como patógenos humanos. Contudo, estudos envolvendo os Orthobunyavirus do grupo C são escassos e suas características moleculares são pouco conhecidas, o que dificulta sua identificação e correta classificação. Até o momento, apenas sequências genômicas parciais para APEUV e ITQV foram caracterizadas e as relações genéticas entre estes vírus são ainda muito pouco conhecidas. O objetivo deste trabalho é realizar a caracterização molecular dos vírus do grupo C CARV, APEUV e ITQV através do sequenciamento dos seus segmentos genômicos e utilizar os dados obtidos para desenvolver um ensaio de PCR que permita identificar e diferenciar estas três amostras virais. Foi possível concluir o hequenciamento do segmento L de CARV e APEUV e obter sequências parciais para os segmentos M e L do ITQV e segmento M de CARV e APEUV. A caracterização do segmento L do APEUV revelou que a RdRp deste membro do sorogrupo C possui todas as regiões conservadas anteriormente descritas para os Orthobunyavirus, como as regiões 3 e 4, além do domínio “cap-snatching” originalmente descrito para o vírus Influenza. As análises revelararam que as relações genéticas existentes entre as três amostras do sorogrupo C (CARV, APEUV e ÌTQV) são diferentes quando os segmentos L e M são analisados. Os dados obtidos para a 26 RdRp das três amostras analisadas sugerem que o segmento L de CARV e ITQV possuem uma origem em comum, a qual não é compartilhada pelo segmento L do APEUV. Por outro lado, os dados obtidos para a poliproteína sugerem uma origem em comum para o segmento M de CARV e APEUV, a qual não seria compartilhada pelo segmento M do ITQV. Visto que o ICTV utiliza como critério de especição as reações cruzadas nas provas sorológicas que reconhecem as glicoproteínas de superfície, uma classificação baseada na sequência da RdRp, sendo esta a proteína mais conservada e melhor caracterizada dentro do gênero Orthobunyavirus, seria mais adequada.