A domesticação da aveia implicou na perda de microssatélites?
| Ano de defesa: | 2024 |
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| Tipo de documento: | Tese |
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| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Pelotas
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| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Agronomia
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Brasil
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| Palavras-chave em Português: | |
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Resumo: | A aveia branca é um cereal que vem se destacando com seu potencial na agricultura, principalmente por conta da produção de grãos, que possuem qualidade industrial e com composição química excelentes, como também pelas várias possibilidades de uso. Esse cereal é comumente cultivado nos estados do Sul do Brasil, onde a mesma possui melhor adaptação. Nesse aspecto é uma das culturas que se destaca nos programas de melhoramento, visando o aumento de produtividade e resistência a fatores abióticos e bióticos para melhor adaptação a diversas regiões. A evolução das plantas, evidenciada pela diversidade de seus genomas, reflete a adaptação ao longo de milhões de anos a diferentes ambientes e pressões seletivas. A variabilidade genômica nas plantas impulsiona a inovação evolutiva, permitindo a exploração de novos nichos e a resposta a desafios ambientais, como mudanças climáticas e interações com outras espécies, fundamental para sua sobrevivência e diversificação ao longo do tempo. Os microssatélites são uma ferramenta fundamental para estudos de melhoramento avançado, podendo serem utilizados de diversas formas para otimizar o tempo gasto no desenvolvimento de novas cultivares como também se ter o estudo complexo de regiões dentro dos genomas e estudar regiões intergenicas e genicas .Os objetivos da presente dissertação é caracterizar a presença de microssatélites nos subgenomas da aveia, verificar a distribuição destes miscrossatélites nos diferentes tipos de genes quanto à sua função e comparar a presença destes nos genomas ancestrais comparada com a presença no genoma da aveia hexaploide cultivada. Foi feita a comparação da quantidade de microssatélites presentes em seus genomas AA, CC e DD e estimou-se a perda dessas sequências devido à domesticação e ao processo evolutivo da aveia branca ao decorrer dos anos. Os microssatélites são importantes quando associados a genes envolvidos em processos vitais, no desenvolvimento, na produtividade, resistência e/ou tolerância dentre outros processos. Foram observadas variações entre genomas da Avena sativa comparada as ancestrais Avena longiglumis e Avena insularis, onde demonstraram uma maior perda de microssatélites monômeros e dímeros, como também houve uma conservação de microssatélites dentro de genes entre genomas DD da Avena sativa quando comparada a Avena insularis mostrando uma desuniformidade entre os genomas. A presença diferencial de microssatélites nos genomas ancestrais e na aveia hexaploide cultivada sugere que a seleção ao longo do tempo não foi uniforme nos três genomas da aveia, com reduções mais significativas de microssatélites ocorrendo nos genomas AA e CC, particularmente dentro de genes. |
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2024-08-05T01:49:08Z2024-082024-08-05T01:49:08Z2024-03-04Machado, R. P. A domesticação da aveia implicou na perda de microssatélites? 2024. 68 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2024.http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/13707A aveia branca é um cereal que vem se destacando com seu potencial na agricultura, principalmente por conta da produção de grãos, que possuem qualidade industrial e com composição química excelentes, como também pelas várias possibilidades de uso. Esse cereal é comumente cultivado nos estados do Sul do Brasil, onde a mesma possui melhor adaptação. Nesse aspecto é uma das culturas que se destaca nos programas de melhoramento, visando o aumento de produtividade e resistência a fatores abióticos e bióticos para melhor adaptação a diversas regiões. A evolução das plantas, evidenciada pela diversidade de seus genomas, reflete a adaptação ao longo de milhões de anos a diferentes ambientes e pressões seletivas. A variabilidade genômica nas plantas impulsiona a inovação evolutiva, permitindo a exploração de novos nichos e a resposta a desafios ambientais, como mudanças climáticas e interações com outras espécies, fundamental para sua sobrevivência e diversificação ao longo do tempo. Os microssatélites são uma ferramenta fundamental para estudos de melhoramento avançado, podendo serem utilizados de diversas formas para otimizar o tempo gasto no desenvolvimento de novas cultivares como também se ter o estudo complexo de regiões dentro dos genomas e estudar regiões intergenicas e genicas .Os objetivos da presente dissertação é caracterizar a presença de microssatélites nos subgenomas da aveia, verificar a distribuição destes miscrossatélites nos diferentes tipos de genes quanto à sua função e comparar a presença destes nos genomas ancestrais comparada com a presença no genoma da aveia hexaploide cultivada. Foi feita a comparação da quantidade de microssatélites presentes em seus genomas AA, CC e DD e estimou-se a perda dessas sequências devido à domesticação e ao processo evolutivo da aveia branca ao decorrer dos anos. Os microssatélites são importantes quando associados a genes envolvidos em processos vitais, no desenvolvimento, na produtividade, resistência e/ou tolerância dentre outros processos. Foram observadas variações entre genomas da Avena sativa comparada as ancestrais Avena longiglumis e Avena insularis, onde demonstraram uma maior perda de microssatélites monômeros e dímeros, como também houve uma conservação de microssatélites dentro de genes entre genomas DD da Avena sativa quando comparada a Avena insularis mostrando uma desuniformidade entre os genomas. A presença diferencial de microssatélites nos genomas ancestrais e na aveia hexaploide cultivada sugere que a seleção ao longo do tempo não foi uniforme nos três genomas da aveia, com reduções mais significativas de microssatélites ocorrendo nos genomas AA e CC, particularmente dentro de genes.Oat is a cereal that has been standing out for its potential in agriculture, mainly due to grain production, which boasts excellent industrial quality and chemical composition, as well as various usage possibilities. This cereal is commonly grown in the Southern states of Brazil, where it shows better adaptation. In this aspect, it is one of the crops highlighted in breeding programs, aiming at increased productivity and resistance to abiotic and biotic factors for better adaptation to diverse regions. Plant evolution, evidenced by the diversity of their genomes, reflects adaptation over millions of years to different environments and selective pressures. Genomic variability in plants drives evolutionary innovation, enabling the exploration of new niches and responses to environmental challenges, such as climate change and interactions with other species, crucial for their survival and diversification over time. Microsatellites are a fundamental tool for advanced breeding studies, capable of being used in various ways to optimize the time spent developing new cultivars, as well as conducting complex studies of regions within genomes and studying intergenic and genic regions. The objectives of this dissertation are to characterize the presence of microsatellites in oat subgenomes, verify the distribution of these microsatellites in different types of genes regarding their function, and compare their presence in ancestral genomes with their presence in the cultivated hexaploid oat genome. A comparison was made of the quantity of microsatellites present in their AA, CC, and DD genomes, and the loss of these sequences due to oat domestication and evolutionary processes over the years was estimated. Microsatellites are important when associated with genes involved in vital processes, development, productivity, resistance, and/or tolerance, among others. Variations were observed among genomes of Avena sativa compared to ancestral Avena longiglumis and Avena insularis, where there was a greater loss of monomer and dimer microsatellites, and conservation of microsatellites within genes in the DD genomes of Avena sativa compared to Avena insularis, showing non-uniformity among genomes. The differential presence of microsatellites in ancestral genomes and cultivated hexaploid oat suggests that selection over time was not uniform in the three oat genomes, with more significant reductions of microsatellites occurring in the AA and CC genomes, particularly within genes.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaUFPelBrasilCC BY-NC-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessCIENCIAS AGRARIASAGRONOMIAFITOTECNIAFITOPATOLOGIAAvena sativaAvena insularisAvena longiglumisBreeding plantsSSRsMelhoramento vegetalA domesticação da aveia implicou na perda de microssatélites?Did oat domestication resulted in loss of microsatellites?info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://lattes.cnpq.br/3603788532175756Maia, Luciano Carlos dahttp://lattes.cnpq.br/4440061243085201Oliveira, Antônio Costa deMachado, Rodrigo Pagelreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/13707/2/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD52open accessTEXTDissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdf.txtDissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdf.txtExtracted texttext/plain88554http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/13707/3/Dissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdf.txt29f5a5e4932ac8e4f95dc547f70da9ccMD53open accessTHUMBNAILDissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdf.jpgDissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1210http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/13707/4/Dissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdf.jpgc7483f2a12a26693c57a70bb5b8d1b2dMD54open accessORIGINALDissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdfDissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdfapplication/pdf1711955http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/13707/1/Dissertacao_Rodrigo_Pagel_Machado.pdf16ac97e8d9cdf7cb3a3e9b6a1b033617MD51open accessprefix/137072025-07-29 09:50:21.602open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/13707VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2025-07-29T12:50:21Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false |
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