Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense
| Ano de defesa: | 2010 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Não Informado pela instituição
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | http://hdl.handle.net/1884/23960 |
Resumo: | Resumo: Azospirillum brasilense é uma bactéria fixadora de nitrogênio que se associa com diversas plantas agrícolas de interesse comercial como o arroz, o milho e o trigo. É muito estudado por seu potencial como biofertilizante, podendo reduzir a utilização de fertilizantes químicos nitrogenados e consequentemente os danos ao meio ambiente, como a eutrofização de rios e a acidificação do solo. Neste microrganismo os genes responsáveis pela fixação de nitrogênio (genes nif) necessitam de uma proteína ativadora transcricional, a NifA. A proteína NifA tem sua atividade regulada pelos níveis de oxigênio e de íons NH4+ e possui três domínios funcionais. O domínio N-terminal é responsável pelo controle negativo dos níveis intracelulares de nitrogênio; o domínio central interage com o fator sigma-54 da RNA polimerase e possui um motivo de hidrólise de ATP e o domínio C-terminal possui um motivo hélice-volta-hélice responsável pela ligação da proteína ao DNA. Esses domínios são interligados por regiões interdomínio QL (N-terminal e Central) e IDL (Central e C-terminal). Na extremidade final do domínio central e início do interdomínio IDL há um motivo conservado de resíduos de cisteínas provavelmente envolvidos na sensibilidade da proteína ao oxigênio. Neste trabalho a proteína NifA de A. brasilense foi expressa e purificada em uma forma N-truncada fusionada a uma cauda contendo resíduos de histidina e caracterizada em ensaios de ligação ao DNA in vitro e de ativação transcricional in vivo. A proteína recombinante His-NifA N-truncada purificada atingiu 80% de pureza com rendimento de 0,43mg de proteína por litro de cultura. A proteína purificada foi capaz de se ligar à região promotora do gene nifB de Herbaspirillum seropedicae. Ensaios in vivo com a proteína NifA N-truncada contendo ou não cauda de histidina mostraram capacidade de ativar o promotor nifH de Klebsiella pneumoniae a partir de uma fusão nifH::lacZ na ausência de oxigênio. Nossos resultados também indicaram que a NifA N-truncada de A. brasilense parece ser menos sensível ao oxigênio que a NifA N-truncada de H. seropedicae. |
| id |
UFPR_7015eeb04d6a6803774e6325ab709c10 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:acervodigital.ufpr.br:1884/23960 |
| network_acronym_str |
UFPR |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UFPR |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Nishikawa, Caroline YukiUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciencias Biológicas. Programa de Pós-Graduaçao em BioquímicaAraújo, Luíza Maria deChubatsu, Leda Satie2010-06-15T14:12:34Z2010-06-15T14:12:34Z2010-06-15http://hdl.handle.net/1884/23960Resumo: Azospirillum brasilense é uma bactéria fixadora de nitrogênio que se associa com diversas plantas agrícolas de interesse comercial como o arroz, o milho e o trigo. É muito estudado por seu potencial como biofertilizante, podendo reduzir a utilização de fertilizantes químicos nitrogenados e consequentemente os danos ao meio ambiente, como a eutrofização de rios e a acidificação do solo. Neste microrganismo os genes responsáveis pela fixação de nitrogênio (genes nif) necessitam de uma proteína ativadora transcricional, a NifA. A proteína NifA tem sua atividade regulada pelos níveis de oxigênio e de íons NH4+ e possui três domínios funcionais. O domínio N-terminal é responsável pelo controle negativo dos níveis intracelulares de nitrogênio; o domínio central interage com o fator sigma-54 da RNA polimerase e possui um motivo de hidrólise de ATP e o domínio C-terminal possui um motivo hélice-volta-hélice responsável pela ligação da proteína ao DNA. Esses domínios são interligados por regiões interdomínio QL (N-terminal e Central) e IDL (Central e C-terminal). Na extremidade final do domínio central e início do interdomínio IDL há um motivo conservado de resíduos de cisteínas provavelmente envolvidos na sensibilidade da proteína ao oxigênio. Neste trabalho a proteína NifA de A. brasilense foi expressa e purificada em uma forma N-truncada fusionada a uma cauda contendo resíduos de histidina e caracterizada em ensaios de ligação ao DNA in vitro e de ativação transcricional in vivo. A proteína recombinante His-NifA N-truncada purificada atingiu 80% de pureza com rendimento de 0,43mg de proteína por litro de cultura. A proteína purificada foi capaz de se ligar à região promotora do gene nifB de Herbaspirillum seropedicae. Ensaios in vivo com a proteína NifA N-truncada contendo ou não cauda de histidina mostraram capacidade de ativar o promotor nifH de Klebsiella pneumoniae a partir de uma fusão nifH::lacZ na ausência de oxigênio. Nossos resultados também indicaram que a NifA N-truncada de A. brasilense parece ser menos sensível ao oxigênio que a NifA N-truncada de H. seropedicae.application/pdfTesesAzospirillum brasilienseMicroorganismos fixadores de nitrogenioExpressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilenseinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALDissertacao Final-Caroline Yuki Nishikawa.pdfapplication/pdf2401335https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/23960/1/Dissertacao%20Final-Caroline%20Yuki%20Nishikawa.pdf75fcf632f37461950bf47ff3f3898fb3MD51open accessTEXTDissertacao Final-Caroline Yuki Nishikawa.pdf.txtDissertacao Final-Caroline Yuki Nishikawa.pdf.txtExtracted Texttext/plain154746https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/23960/2/Dissertacao%20Final-Caroline%20Yuki%20Nishikawa.pdf.txt4b01134c1dcc38291b34dd6f5fd58c75MD52open accessTHUMBNAILDissertacao Final-Caroline Yuki Nishikawa.pdf.jpgDissertacao Final-Caroline Yuki Nishikawa.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1406https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/23960/3/Dissertacao%20Final-Caroline%20Yuki%20Nishikawa.pdf.jpgd74de3a00740e15a1404b72fca4f6170MD53open access1884/239602016-04-07 03:24:35.449open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/23960Repositório InstitucionalPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestinformacaodigital@ufpr.bropendoar:3082016-04-07T06:24:35Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false |
| dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense |
| title |
Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense |
| spellingShingle |
Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense Nishikawa, Caroline Yuki Teses Azospirillum brasiliense Microorganismos fixadores de nitrogenio |
| title_short |
Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense |
| title_full |
Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense |
| title_fullStr |
Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense |
| title_full_unstemmed |
Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense |
| title_sort |
Expressão e caracterização de uma forma N-Truncada da proteína Nifa de Azospirillum Brasilense |
| author |
Nishikawa, Caroline Yuki |
| author_facet |
Nishikawa, Caroline Yuki |
| author_role |
author |
| dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv |
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciencias Biológicas. Programa de Pós-Graduaçao em Bioquímica Araújo, Luíza Maria de |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Nishikawa, Caroline Yuki |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Chubatsu, Leda Satie |
| contributor_str_mv |
Chubatsu, Leda Satie |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Teses Azospirillum brasiliense Microorganismos fixadores de nitrogenio |
| topic |
Teses Azospirillum brasiliense Microorganismos fixadores de nitrogenio |
| description |
Resumo: Azospirillum brasilense é uma bactéria fixadora de nitrogênio que se associa com diversas plantas agrícolas de interesse comercial como o arroz, o milho e o trigo. É muito estudado por seu potencial como biofertilizante, podendo reduzir a utilização de fertilizantes químicos nitrogenados e consequentemente os danos ao meio ambiente, como a eutrofização de rios e a acidificação do solo. Neste microrganismo os genes responsáveis pela fixação de nitrogênio (genes nif) necessitam de uma proteína ativadora transcricional, a NifA. A proteína NifA tem sua atividade regulada pelos níveis de oxigênio e de íons NH4+ e possui três domínios funcionais. O domínio N-terminal é responsável pelo controle negativo dos níveis intracelulares de nitrogênio; o domínio central interage com o fator sigma-54 da RNA polimerase e possui um motivo de hidrólise de ATP e o domínio C-terminal possui um motivo hélice-volta-hélice responsável pela ligação da proteína ao DNA. Esses domínios são interligados por regiões interdomínio QL (N-terminal e Central) e IDL (Central e C-terminal). Na extremidade final do domínio central e início do interdomínio IDL há um motivo conservado de resíduos de cisteínas provavelmente envolvidos na sensibilidade da proteína ao oxigênio. Neste trabalho a proteína NifA de A. brasilense foi expressa e purificada em uma forma N-truncada fusionada a uma cauda contendo resíduos de histidina e caracterizada em ensaios de ligação ao DNA in vitro e de ativação transcricional in vivo. A proteína recombinante His-NifA N-truncada purificada atingiu 80% de pureza com rendimento de 0,43mg de proteína por litro de cultura. A proteína purificada foi capaz de se ligar à região promotora do gene nifB de Herbaspirillum seropedicae. Ensaios in vivo com a proteína NifA N-truncada contendo ou não cauda de histidina mostraram capacidade de ativar o promotor nifH de Klebsiella pneumoniae a partir de uma fusão nifH::lacZ na ausência de oxigênio. Nossos resultados também indicaram que a NifA N-truncada de A. brasilense parece ser menos sensível ao oxigênio que a NifA N-truncada de H. seropedicae. |
| publishDate |
2010 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2010-06-15T14:12:34Z |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2010-06-15T14:12:34Z |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2010-06-15 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/1884/23960 |
| url |
http://hdl.handle.net/1884/23960 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFPR instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR) instacron:UFPR |
| instname_str |
Universidade Federal do Paraná (UFPR) |
| instacron_str |
UFPR |
| institution |
UFPR |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UFPR |
| collection |
Repositório Institucional da UFPR |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/23960/1/Dissertacao%20Final-Caroline%20Yuki%20Nishikawa.pdf https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/23960/2/Dissertacao%20Final-Caroline%20Yuki%20Nishikawa.pdf.txt https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/23960/3/Dissertacao%20Final-Caroline%20Yuki%20Nishikawa.pdf.jpg |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
75fcf632f37461950bf47ff3f3898fb3 4b01134c1dcc38291b34dd6f5fd58c75 d74de3a00740e15a1404b72fca4f6170 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR) |
| repository.mail.fl_str_mv |
informacaodigital@ufpr.br |
| _version_ |
1847526172549709824 |