Avaliação da variabilidade genética em Tayassu Tacaju (cateto) e Tayassu Pecari (queixada) por meio da utilização de marcadores microssatélites
| Ano de defesa: | 2006 |
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Resumo: | Orientador : Prof. Dr. Ives José Sbalqueiro |
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Freitas, Thales Renato Ochotorena de, 1954-Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaSbalqueiro, Ives Jose, 1947-Silva, Roxane Wirschum2024-11-25T19:46:11Z2024-11-25T19:46:11Z2006https://hdl.handle.net/1884/24267Orientador : Prof. Dr. Ives José SbalqueiroCo-Orientador: Prof. dr. Thales R.O. de FreitasDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 23/02/2006Bibliografia: fls. 54-59Resumo: Os porcos-do-mato, catetos (Tayassu tajacu) e queixadas (Tayassu pecari), são nativos da fauna brasileira e possuem grande importância na alimentação das populações humanas, principalmente das indígenas, além dos criadouros com fins de manutenção, reprodução e exploração comercial. Nos últimos anos, estes animais estão sendo criados e comercializados, pois a carne é saborosa e, portanto, muito apreciada. Entretanto, existe pouca informação a respeito da genética populacional destes animais. O presente trabalho visou avaliar a variabilidade genética em populações de catetos e queixadas mantidas em cativeiro por meio da utilização de marcadores microssatélites. Para tal propósito, foram utilizados seis iniciadores desenvolvidos para porco doméstico (Sus scrofa scrofa), que amplificaram em ambas espécies. A visualização dos alelos foi realizada em gel de poliacrilamida não-desnaturante 10%, revelando a presença de cinco locos polimórficos e um monomórfico. Entre os locos polimórficos, foi observada alta diversidade alélica, sendo de quatro a dezesseis alelos em catetos e de três a dez alelos em queixadas. Porém, a variabilidade genética foi considerada baixa, tendo em vista a alta incidência de indivíduos homozigotos em ambas espécies e em todos os locos, exceto o loco ACTG2 (queixadas), o qual apresentou excesso de heterozigotos. Os valores do conteúdo de informações polimórficas (PIC), foram considerados, em ambas espécies e em todos os locos, altamente informativos. A probabilidade de exclusão combinada (PEC) foi considerada alta e satisfatória em catetos (99,48%) quando se conhece um dos parentais e, em queixadas, a probabilidade de exclusão combinada considerando toda a amostra, foi considerada alta quando se conhece um dos parentais (95,53%), porém não satisfatória para a realização deste tipo de teste. Através do cálculo de Fst, pôde-se verificar que as populações de catetos (Fst=0,042) e queixadas (Fst=0,1387) não estão estruturadas, ou seja, há fluxo gênico entre elas, sendo que a variabilidade encontrada está dentro e não entre as populações. Já quando comparadas as duas espécies, percebeu-se a estruturação, não havendo fluxo gênico entre elas. Os valores de Fis, exceto no loco ACTG2 (queixadas), o qual apresentou valor negativo (-0,0275), nos demais os locos e em ambas espécies (0,1985 a 0,9284 em catetos e 0,3621 a 0,4754 em queixadas), revelaram um alto índice de homozigose, causada, provavelmente, por endocruzamento. O presente trabalho constatou o sucesso da amplificação heteróloga em catetos e queixadas utilizando iniciadores de porco doméstico, confirmando os dados da literatura e fornecendo esultados inéditos a este respeito, bem como em relação à variabilidade genética encontrada nestes animais. Além disso, foram apresentadas proposições que visam a otimização da criação destes animais nos cativeiros.Abstract: Wild pigs, Collared peccary (Tayassu tajacu) and White-lipped peccary (Tayassu pecari) are native species of brazilian fauna which have high social and economic importance. Both are important as alimentary item among native human populations. In the last years, the meat from these animals has become much appreciated and so they have been utilized as a commercial product. However, little information regarding the population genetics of these animals exists. The goal of the present report was to analyze the genetic variability with microsatellites markers in Whitelipped peccary and Collared peccary. Six primers developed for domestic pig (Sus scrofa scrofa) were successfully used regarding amplification, in both species. The visualization of the alleles was carried out on a not-denaturing 10% polyacrylamide gel, showing the presence of five polymorphic loci and one monomorphic locus. Among the polymorphic loci high allelic variability was observed in Collared peccary (from four to 16 alleles) and also in White-lipped peccary (from three to ten alleles). However the genetic variability was considered low due to the high frequency of homozigotes animals in both species and in all loci, except in the locus ACTG2 (White-lipped peccary). The values of the polymorphic information content (PIC) were considered highly informative in both species, in all the loci. The probability of paternity exclusion was considered high and satisfactory in Collared peccaries (99,48%), when one knows one of the parental individuals. In White-lipped peccaries, the probability of paternity exclusion taking all the sample was also considered high when one of the parental individuals is known (95,53%), however not satisfactory for performing this type of test. The Fst shows that populations of Collared peccary (Fst=0,042) and White-lipped peccaries (Fst=0,1387) are not structured, i.e. there is genetic flow among populations of each species tyresulting in a within-populations genetic variability. When compared the two species, however, there is no genic flow between them. The values of Fis in both species and in all loci (0,1985 to 0,9284 in Collared and 0,3621 to 0,4754 in White-lipped peccaries), except in ACTG2 (Whitelipped peccary), which presented negative value (-0,0275), revealed a high index of homozygotes observed, being this one probably caused for the inbreeding. The present study showed the success of the heterologous amplification in Collared and White-lipped peccaries using primers of domestic pig, confirming the results already in the literature and providing new data mainly in relation to the genetic variability in these animals. Moreover, we were able to propose some optimization for maintaining these animals in captivity.68f. : il. [algumas color.], grafs., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalTesesSuino selvagemGenetica de populaçoesGenéticaAnimais silvestresAvaliação da variabilidade genética em Tayassu Tacaju (cateto) e Tayassu Pecari (queixada) por meio da utilização de marcadores microssatélitesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALDissertacao completa.pdfapplication/pdf528093https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/24267/1/Dissertacao%20completa.pdfa338f9b4b8d3ba4eb7e139923e08eec2MD51open accessTEXTDissertacao completa.pdf.txtExtracted Texttext/plain129167https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/24267/2/Dissertacao%20completa.pdf.txte20a0c020348e3a15ee1e99bc85776adMD52open accessTHUMBNAILDissertacao completa.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1252https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/24267/3/Dissertacao%20completa.pdf.jpg759d71484ddcfb58a19f7313981fdf3cMD53open access1884/242672024-11-25 16:46:11.678open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/24267Repositório InstitucionalPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestinformacaodigital@ufpr.bropendoar:3082024-11-25T19:46:11Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false |
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