Caracterização da microbiota bacteriana e do viroma intestinal de leitões com e sem diarreia pós-desmame

• Ano de defesa: 2026
• Autor(a) principal: Dias, Karen Karine da Rosa
• Orientador(a): Mayer, Fabiana Quoos
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Suinocultura; Microbiota; Disbiose
• Palavras-chave em Inglês: Gastrointestinal microbiome; Gastrointestinal dysbiosis; Swine
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/309998

A fase de desmame constitui um período crítico na suinocultura tecnificada, caracterizado pela elevada vulnerabilidade dos leitões a distúrbios entéricos, como a diarreia pós- desmame (DPD), que acarreta significativas perdas econômicas. A etiologia multifatorial da DPD envolve estresse psicofisiológico, transição nutricional abrupta, imaturidade dos sistemas digestivo e imunológico e a potencial disbiose intestinal. Esta tese teve por objetivo caracterizar a microbiota bacteriana e o viroma intestinal, comparar a composição de ambos em leitões desmamados com e sem diarreia e avaliar qual a relação dessa comunidade microbiana com os distúrbios entéricos presentes nos animais estudados. Foram analisadas 30 amostras de suabes retais de leitões comerciais com 33 dias de vida, distribuídos em dois grupos: Controle (15 animais saudáveis) e Diarreia (15 animais com diarreia). A abordagem metodológica combinou sequenciamento do gene 16S rRNA (Artigo 1) e metagenômica shotgun (Artigo 2) para caracterizar, respectivamente, a microbiota bacteriana e a comunidade viral intestinal. Os dados foram processados com ferramentas bioinformáticas, incluindo análises de abundância relativa, diversidade alfa e beta, abundância diferencial e, para os dados de 16S rRNA, predição de vias metabólicas. Os resultados revelaram que leitões diarreicos apresentaram uma microbiota bacteriana enriquecida em táxons com potencial pró-inflamatórios e patogênicos, além de um enriquecimento de vias metabólicas relacionadas à degradação de compostos aromáticos (ex.: 2-aminofenol), à biossíntese de antibióticos (novobiocina) e ao metabolismo energético (ciclo do ácido tricarboxílico redutor). Paralelamente, o viroma desses animais exibiu maior abundância de vírus eucarióticos patogênicos e de bacteriófagos associados a bactérias comensais ou oportunistas. Em contraste, leitões saudáveis exibiram uma comunidade bacteriana com maior dominância de grupos com potencial probiótico e metabólico benéfico, caracterizada por um perfil enriquecido em vias de degradação de aminoácidos (ex.: L-lisina, L-treonina) e carboidratos (trealose III) e de fermentação ((S)-propano-1,2-diol), e um viroma predominado por bacteriófagos reguladores de bactérias oportunistas, além de vírus comensais. Esses achados mostram alterações significativas nas comunidades bacteriana e viral no ecossistema intestinal associado à DPD, sugerindo que o desequilíbrio nessa rede microbiana pode estar relacionado à condição clínica. Os dados podem fornecer percepções sobre os mecanismos microbianos subjacentes à diarreia e auxiliar em estratégias profiláticas ou terapêuticas mais precisas, como o uso de moduladores microbianos, prebióticos e fagoterapia, visando à promoção da saúde intestinal dos animais.