Variantes patogênicas e alteração da expressão em genes candidatos ao espectro óculo-aurículo-vertebral

• Ano de defesa: 2018
• Autor(a) principal: Souza, Malu Zamariolli de [UNIFESP]
• Orientador(a): Melaragno, Maria Isabel de Souza Aranha [UNIFESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• dARK ID: ark:/48912/00130000284rw
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
• Palavras-chave em Português: OAVS; Espectro óculo-aurículo-vertebral; Variantes de nucleotídeo único; Genes candidatos; Expressão gênica
• Palavras-chave em Inglês: Oculo-auricular-vertebral spectrum; Single nucleotide variants; Candidate genes; Gene expression
• Link de acesso: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=7044167; https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/52320

Objetivo: Investigar a presença de alterações na sequência e na expressão de genes candidatos em uma coorte de 73 pacientes diagnosticados com o Espectro ÓculoAurículoVertebral (OAVS). Métodos: Foi realizado o sequenciamento de nova geração dos éxons e regiões UTRs (do inglês, untranslated regions) de dez genes candidatos selecionados (YPEL1, MAPK1, CRKL, OTX2, GSC, HMX1, NKX32, MYT1, PUF60 e HOXA2). As variantes de nucleotídeo único (SNV) foram analisadas por diversas ferramentas de predição in silico e classificadas em três categorias: possivelmente benignas, significado incerto e possivelmente patogênicas. As variantes consideradas como possivelmente patogênicas foram validadas pelo sequenciamento de Sanger e a herdabilidade foi avaliada quando o DNA dos pais dos pacientes estava disponível. A expressão em sangue periférico dos genes portadores de variantes possivelmente patogênicas foi avaliada nos pacientes e comparada a um grupo de indivíduos controle. Resultados: Seis SNVs foram consideradas possivelmente patogênicas, estando todas em estado de heterozigose e localizadas em regiões UTRs de cinco dos genes candidatos sequenciados (YPEL1, MAPK1, CRKL, OTX2 e MYT1). As variantes localizadas nos genes YPEL1, MAPK1, CRKL e OTX2 foram identificadas em cinco pacientes não aparentados, havendo dois com variantes no YPEL1. Já a variante localizada no gene MYT1 foi identificada em outros cinco pacientes não aparentados. Foi verificado o impacto das variantes dos genes YPEL1, MAPK1, CRKL e MYT1 na expressão em sangue periférico, no entanto, os estudos de expressão não revelaram diferenças significantes entre os pacientes portadores das variantes e o grupo controle. Conclusões: Foram descritas novas variantes em genes candidatos que poderão melhorar o entendimento da complexa e desconhecida etiologia do OAVS. O fato de que cada variante só foi identificada em um ou em poucos pacientes apoia a hipótese de haver heterogeneidade genética do espectro e uma provável herança multifatorial com diferentes fatores envolvidos na doença, incluindo fatores ambientais.